Details for gene set HALLMARK_DNA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_DNA_REPAIR
Enrichment Score (ES)	0.216754
Normalized Enrichment Score (NES)	0.930398
Nominal p-value	0.5217391
FDR q-value	0.8943614
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cmpk2	257	0.621	0.0037	Yes
2	Rpa3	290	0.602	0.0192	Yes
3	Nudt21	386	0.567	0.0303	Yes
4	Rad51	398	0.563	0.0458	Yes
5	Impdh2	457	0.548	0.0583	Yes
6	Bcap31	614	0.503	0.0642	Yes
7	Pcna	623	0.501	0.0781	Yes
8	Ssrp1	625	0.500	0.0924	Yes
9	Tarbp2	673	0.490	0.1039	Yes
10	Ercc5	692	0.485	0.1168	Yes
11	Pnp	913	0.454	0.1177	Yes
12	Taf13	1145	0.420	0.1171	Yes
13	Ercc4	1420	0.388	0.1132	Yes
14	Rfc4	1648	0.366	0.1113	Yes
15	Pola1	1715	0.361	0.1180	Yes
16	Hcls1	1722	0.360	0.1280	Yes
17	Dut	1752	0.358	0.1367	Yes
18	Lig1	1798	0.354	0.1443	Yes
19	Gtf2f1	1918	0.343	0.1477	Yes
20	Ago4	1923	0.342	0.1572	Yes
21	Ddb1	1938	0.341	0.1662	Yes
22	Nme1	2131	0.325	0.1650	Yes
23	Prim1	2278	0.315	0.1661	Yes
24	Nelfcd	2376	0.307	0.1696	Yes
25	Cstf3	2528	0.295	0.1698	Yes
26	Pold3	2744	0.279	0.1660	Yes
27	Poll	2762	0.279	0.1731	Yes
28	Sf3a3	2867	0.271	0.1751	Yes
29	Sec61a1	2902	0.268	0.1809	Yes
30	Eloa	2928	0.265	0.1872	Yes
31	Sdcbp	2957	0.263	0.1932	Yes
32	Rpa2	2991	0.261	0.1988	Yes
33	Dctn4	3044	0.257	0.2033	Yes
34	Mpc2	3093	0.254	0.2080	Yes
35	Pole4	3259	0.244	0.2059	Yes
36	Gtf3c5	3372	0.236	0.2066	Yes
37	Dgcr8	3415	0.234	0.2110	Yes
38	Gtf2h5	3520	0.227	0.2118	Yes
39	Polr1h	3675	0.218	0.2096	Yes
40	Ercc3	3911	0.205	0.2026	Yes
41	Dguok	3967	0.201	0.2054	Yes
42	Ddb2	3982	0.200	0.2103	Yes
43	Fen1	4067	0.196	0.2113	Yes
44	Rnmt	4146	0.191	0.2126	Yes
45	Gpx4	4204	0.188	0.2148	Yes
46	Rfc5	4336	0.181	0.2129	Yes
47	Ak3	4432	0.176	0.2127	Yes
48	Polr2k	4451	0.176	0.2168	Yes
49	Srsf6	4601	0.169	0.2134	No
50	Taf12	4842	0.157	0.2048	No
51	Pola2	4995	0.152	0.2008	No
52	Ak1	5081	0.147	0.2004	No
53	Rfc3	5299	0.137	0.1924	No
54	Polr3c	5568	0.125	0.1813	No
55	Polr2h	5569	0.125	0.1849	No
56	Nelfe	5897	0.109	0.1701	No
57	Polr2j	6058	0.102	0.1643	No
58	Nelfb	6102	0.100	0.1648	No
59	Taf9	6266	0.093	0.1585	No
60	Vps37b	6393	0.087	0.1541	No
61	Rfc2	6924	0.065	0.1270	No
62	Snapc5	7017	0.062	0.1237	No
63	Zwint	7096	0.058	0.1211	No
64	Gtf2h1	7189	0.055	0.1176	No
65	Taf6	7213	0.053	0.1179	No
66	Gtf2h3	7461	0.042	0.1056	No
67	Ada	7483	0.041	0.1056	No
68	Polr2a	7619	0.035	0.0992	No
69	Sac3d1	7734	0.029	0.0938	No
70	Snapc4	7773	0.027	0.0925	No
71	Alyref	8054	0.016	0.0776	No
72	Upf3b	8276	0.007	0.0657	No
73	Supt5	8556	-0.004	0.0505	No
74	Nfx1	8588	-0.005	0.0490	No
75	Clp1	8733	-0.011	0.0414	No
76	Rev3l	8928	-0.019	0.0313	No
77	Pold1	9211	-0.031	0.0168	No
78	Bcam	9543	-0.045	-0.0001	No
79	Umps	9567	-0.045	-0.0000	No
80	Polr2d	9648	-0.048	-0.0030	No
81	Nt5c	9766	-0.053	-0.0079	No
82	Tyms	9904	-0.059	-0.0137	No
83	Trp53	9976	-0.063	-0.0158	No
84	Tsg101	9979	-0.063	-0.0141	No
85	Aaas	10257	-0.075	-0.0271	No
86	Mrpl40	10403	-0.082	-0.0327	No
87	Xpc	10462	-0.085	-0.0335	No
88	Pde6g	10466	-0.085	-0.0312	No
89	Ncbp2	10556	-0.088	-0.0335	No
90	Stx3	10770	-0.097	-0.0424	No
91	Polb	10787	-0.098	-0.0405	No
92	Rala	11032	-0.109	-0.0507	No
93	Edf1	11085	-0.111	-0.0504	No
94	Ercc2	11092	-0.111	-0.0476	No
95	Gtf2b	11293	-0.120	-0.0551	No
96	Polr1c	11295	-0.120	-0.0517	No
97	Itpa	11565	-0.132	-0.0626	No
98	Tk2	11659	-0.136	-0.0638	No
99	Zfp707	11810	-0.143	-0.0679	No
100	Usp11	12006	-0.152	-0.0743	No
101	Pde4b	12059	-0.154	-0.0727	No
102	Supt4a	12132	-0.157	-0.0721	No
103	Polr2f	12154	-0.159	-0.0687	No
104	Eif1b	12166	-0.159	-0.0648	No
105	Surf1	12195	-0.161	-0.0617	No
106	Adcy6	12340	-0.168	-0.0648	No
107	Gmpr2	12573	-0.180	-0.0723	No
108	Cetn2	12777	-0.190	-0.0780	No
109	Rad52	12876	-0.195	-0.0778	No
110	Ercc1	13004	-0.203	-0.0789	No
111	Cant1	13083	-0.207	-0.0772	No
112	Polr2c	13516	-0.229	-0.0943	No
113	Smad5	13571	-0.231	-0.0907	No
114	Ell	13734	-0.238	-0.0927	No
115	Gsdme	13735	-0.238	-0.0859	No
116	Guk1	14083	-0.256	-0.0975	No
117	Nt5c3	14135	-0.258	-0.0929	No
118	Polr2g	14412	-0.275	-0.1002	No
119	Rbx1	14417	-0.275	-0.0925	No
120	Polr1d	14478	-0.279	-0.0878	No
121	Taf10	14515	-0.281	-0.0817	No
122	Taf1c	14547	-0.282	-0.0753	No
123	Nme3	14558	-0.283	-0.0678	No
124	Npr2	14726	-0.292	-0.0685	No
125	Gtf2a2	14820	-0.297	-0.0651	No
126	Polh	15086	-0.314	-0.0706	No
127	Pold4	15885	-0.371	-0.1037	No
128	Nudt9	15987	-0.379	-0.0984	No
129	Adrm1	16017	-0.381	-0.0890	No
130	Rae1	16073	-0.387	-0.0810	No
131	Aprt	16159	-0.394	-0.0743	No
132	Polr2i	16346	-0.409	-0.0728	No
133	Arl6ip1	16448	-0.419	-0.0663	No
134	Nme4	16520	-0.427	-0.0580	No
135	Polr2e	16749	-0.451	-0.0575	No
136	Rrm2b	16806	-0.457	-0.0475	No
137	Polr3gl	17022	-0.479	-0.0455	No
138	Ercc8	17053	-0.483	-0.0333	No
139	Dad1	17224	-0.504	-0.0282	No
140	Mpg	17470	-0.545	-0.0260	No
141	Cox17	17694	-0.582	-0.0215	No
142	Pom121	17922	-0.636	-0.0157	No
143	Vps28	18128	-0.714	-0.0065	No
144	Brf2	18210	-0.760	0.0108	No