Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.18112104
Normalized Enrichment Score (NES)	0.7979046
Nominal p-value	0.8774704
FDR q-value	0.9586546
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Sdc4	6	1.325	0.0337	Yes
2	Ninj1	103	0.823	0.0496	Yes
3	Zbtb10	168	0.747	0.0653	Yes
4	Klf4	339	0.635	0.0723	Yes
5	Dram1	801	0.517	0.0603	Yes
6	Nfkb2	850	0.507	0.0707	Yes
7	Jun	915	0.498	0.0800	Yes
8	Pdlim5	951	0.492	0.0908	Yes
9	Klf2	1008	0.486	0.1002	Yes
10	Plek	1011	0.485	0.1125	Yes
11	Gfpt2	1091	0.472	0.1203	Yes
12	Yrdc	1122	0.467	0.1307	Yes
13	Nr4a1	1278	0.444	0.1336	Yes
14	Fos	1371	0.431	0.1397	Yes
15	Birc2	1595	0.410	0.1380	Yes
16	Nr4a2	1627	0.406	0.1467	Yes
17	F2rl1	1629	0.406	0.1571	Yes
18	Plaur	1771	0.392	0.1595	Yes
19	Dusp1	2050	0.371	0.1538	Yes
20	Cxcl10	2114	0.364	0.1597	Yes
21	Btg3	2178	0.360	0.1655	Yes
22	Olr1	2186	0.359	0.1743	Yes
23	Rhob	2337	0.346	0.1750	Yes
24	Rigi	2550	0.329	0.1718	Yes
25	B4galt1	2810	0.314	0.1657	Yes
26	Sphk1	2845	0.311	0.1718	Yes
27	Ier2	3046	0.296	0.1685	Yes
28	Btg2	3202	0.285	0.1673	Yes
29	Atf3	3208	0.285	0.1744	Yes
30	Snn	3550	0.261	0.1624	Yes
31	Plk2	3857	0.243	0.1518	Yes
32	Kynu	3883	0.241	0.1567	Yes
33	Sod2	3925	0.238	0.1605	Yes
34	B4galt5	4011	0.232	0.1618	Yes
35	Tnfrsf9	4013	0.232	0.1677	Yes
36	Cebpd	4042	0.230	0.1721	Yes
37	Bhlhe40	4328	0.216	0.1621	Yes
38	Pfkfb3	4443	0.212	0.1613	Yes
39	Nfe2l2	4445	0.212	0.1667	Yes
40	Gem	4516	0.208	0.1682	Yes
41	Dusp4	4591	0.203	0.1693	Yes
42	Gadd45a	4602	0.203	0.1740	Yes
43	Irs2	4607	0.203	0.1790	Yes
44	Nr4a3	4818	0.191	0.1724	Yes
45	Junb	4918	0.184	0.1717	Yes
46	Mcl1	4936	0.183	0.1755	Yes
47	Dnajb4	5009	0.179	0.1761	Yes
48	Tubb2a	5041	0.177	0.1790	Yes
49	Atp2b1	5093	0.174	0.1807	Yes
50	Tnip1	5253	0.166	0.1762	Yes
51	Pmepa1	5348	0.162	0.1752	Yes
52	Mxd1	5353	0.161	0.1791	Yes
53	Cflar	5423	0.158	0.1794	Yes
54	Tank	5580	0.153	0.1748	Yes
55	Ifih1	5596	0.152	0.1779	Yes
56	Birc3	5609	0.151	0.1811	Yes
57	Cd44	5750	0.143	0.1771	No
58	Plau	5824	0.140	0.1767	No
59	Id2	5933	0.135	0.1743	No
60	Spsb1	6348	0.116	0.1546	No
61	Smad3	6460	0.110	0.1513	No
62	Slc2a6	6515	0.107	0.1511	No
63	Icosl	6598	0.104	0.1493	No
64	Maff	6610	0.103	0.1513	No
65	Dennd5a	6619	0.103	0.1535	No
66	Ier5	6675	0.100	0.1531	No
67	Kdm6b	6691	0.099	0.1548	No
68	Fosb	6792	0.095	0.1518	No
69	Cd69	6798	0.095	0.1539	No
70	Lamb3	6982	0.085	0.1461	No
71	Sgk1	7227	0.076	0.1347	No
72	Klf10	7345	0.071	0.1301	No
73	Ifit2	7357	0.070	0.1313	No
74	Trib1	7361	0.070	0.1329	No
75	Rcan1	7367	0.070	0.1344	No
76	Nfil3	7744	0.054	0.1152	No
77	Il7r	7818	0.051	0.1125	No
78	Ptpre	7939	0.046	0.1071	No
79	Rel	8003	0.043	0.1048	No
80	Egr1	8211	0.035	0.0943	No
81	Stat5a	8237	0.034	0.0939	No
82	Dusp2	8544	0.022	0.0776	No
83	Irf1	8891	0.007	0.0589	No
84	Hes1	8937	0.005	0.0565	No
85	Cd83	9038	0.000	0.0510	No
86	Traf1	9265	-0.006	0.0388	No
87	Ccnl1	9409	-0.012	0.0313	No
88	Ccrl2	9440	-0.014	0.0300	No
89	Gch1	9456	-0.014	0.0295	No
90	Tap1	9458	-0.014	0.0298	No
91	Vegfa	9496	-0.016	0.0282	No
92	Csf1	9565	-0.018	0.0250	No
93	Btg1	9668	-0.022	0.0199	No
94	Ppp1r15a	9765	-0.026	0.0154	No
95	Slc2a3	9771	-0.027	0.0158	No
96	Ccl5	10000	-0.036	0.0042	No
97	Per1	10003	-0.036	0.0050	No
98	Rnf19b	10072	-0.039	0.0023	No
99	Tlr2	10250	-0.046	-0.0062	No
100	Ehd1	10352	-0.051	-0.0105	No
101	Ldlr	10522	-0.059	-0.0182	No
102	Bcl6	10594	-0.062	-0.0205	No
103	Icam1	10695	-0.066	-0.0243	No
104	Nfat5	10786	-0.070	-0.0274	No
105	Panx1	10954	-0.077	-0.0346	No
106	Sqstm1	10966	-0.078	-0.0332	No
107	Plpp3	11000	-0.079	-0.0330	No
108	Cd80	11042	-0.081	-0.0332	No
109	Tnfaip8	11053	-0.082	-0.0316	No
110	Trip10	11211	-0.088	-0.0379	No
111	Tnip2	11361	-0.095	-0.0437	No
112	Socs3	11464	-0.099	-0.0467	No
113	Rela	11643	-0.106	-0.0537	No
114	Map2k3	11831	-0.114	-0.0610	No
115	Zfp36	11863	-0.116	-0.0598	No
116	Tiparp	11903	-0.117	-0.0589	No
117	Ccnd1	11954	-0.119	-0.0586	No
118	Il6st	12078	-0.125	-0.0621	No
119	Pde4b	12184	-0.129	-0.0645	No
120	Myc	12204	-0.130	-0.0622	No
121	Tsc22d1	12339	-0.137	-0.0661	No
122	Nfkb1	12433	-0.142	-0.0675	No
123	Tnfsf9	12492	-0.145	-0.0670	No
124	Phlda1	12564	-0.148	-0.0670	No
125	Slc16a6	12769	-0.157	-0.0742	No
126	Fosl1	12786	-0.158	-0.0710	No
127	Tnf	13084	-0.174	-0.0828	No
128	Ifngr2	13319	-0.186	-0.0908	No
129	Cebpb	13786	-0.206	-0.1111	No
130	Dusp5	13820	-0.209	-0.1075	No
131	Serpinb8	14028	-0.220	-0.1132	No
132	Ripk2	14479	-0.244	-0.1316	No
133	Gpr183	14565	-0.250	-0.1298	No
134	Litaf	14732	-0.258	-0.1323	No
135	Fosl2	14905	-0.270	-0.1348	No
136	Ier3	15369	-0.300	-0.1524	No
137	Ptger4	15445	-0.306	-0.1487	No
138	Fut4	15723	-0.325	-0.1555	No
139	Clcf1	15907	-0.337	-0.1569	No
140	Marcks	15961	-0.342	-0.1510	No
141	Map3k8	15969	-0.342	-0.1426	No
142	Eif1	16324	-0.369	-0.1525	No
143	Hbegf	16463	-0.385	-0.1502	No
144	Cdkn1a	16688	-0.407	-0.1520	No
145	Abca1	16703	-0.408	-0.1423	No
146	Relb	16755	-0.413	-0.1344	No
147	Tgif1	16930	-0.433	-0.1329	No
148	Nampt	17004	-0.444	-0.1254	No
149	Pnrc1	17336	-0.486	-0.1311	No
150	Tnfaip2	17352	-0.489	-0.1193	No
151	Sat1	17399	-0.498	-0.1090	No
152	Ets2	17412	-0.502	-0.0968	No
153	Klf6	17472	-0.513	-0.0869	No
154	Il15ra	17594	-0.533	-0.0798	No
155	Nfkbia	17702	-0.556	-0.0714	No
156	Bcl3	17712	-0.558	-0.0575	No
157	Klf9	17831	-0.583	-0.0490	No
158	Nfkbie	17844	-0.587	-0.0346	No
159	Il18	17850	-0.588	-0.0198	No
160	Gadd45b	18016	-0.636	-0.0124	No
161	Zc3h12a	18053	-0.651	0.0023	No
162	Tnfaip3	18088	-0.664	0.0175	No