Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group1_versus_Group4_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.22086038
Normalized Enrichment Score (NES)	0.98882395
Nominal p-value	0.49007937
FDR q-value	0.86600226
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Lima1	16	1.144	0.0320	Yes
2	Kcnh2	222	0.699	0.0409	Yes
3	Cd276	314	0.648	0.0546	Yes
4	Ikbkg	471	0.594	0.0631	Yes
5	Hadh	624	0.561	0.0709	Yes
6	Adam15	685	0.542	0.0832	Yes
7	Tro	944	0.494	0.0833	Yes
8	Col17a1	982	0.488	0.0953	Yes
9	Thbs3	1097	0.471	0.1026	Yes
10	Nrap	1146	0.463	0.1133	Yes
11	Cadm3	1333	0.436	0.1157	Yes
12	Plcg1	1536	0.417	0.1166	Yes
13	Nrxn2	1589	0.411	0.1256	Yes
14	Myh9	1683	0.402	0.1321	Yes
15	Mdk	1777	0.391	0.1382	Yes
16	Nectin1	1859	0.385	0.1449	Yes
17	Amh	2154	0.362	0.1392	Yes
18	Pkd1	2242	0.354	0.1446	Yes
19	Rasa1	2554	0.328	0.1370	Yes
20	Cdh11	2671	0.324	0.1400	Yes
21	B4galt1	2810	0.314	0.1414	Yes
22	Itga2	2899	0.306	0.1454	Yes
23	Irs1	3006	0.300	0.1483	Yes
24	Vcam1	3110	0.291	0.1510	Yes
25	Itgb1	3112	0.291	0.1593	Yes
26	Nrtn	3124	0.290	0.1671	Yes
27	Mmp2	3426	0.269	0.1583	Yes
28	Pard6g	3520	0.263	0.1608	Yes
29	Cdh4	3547	0.261	0.1669	Yes
30	Ldlrap1	3555	0.261	0.1740	Yes
31	Wasl	3615	0.256	0.1781	Yes
32	Vcl	3643	0.254	0.1840	Yes
33	Nf2	3739	0.249	0.1859	Yes
34	Dhx16	3754	0.248	0.1923	Yes
35	Itga9	3961	0.236	0.1878	Yes
36	Icam5	4007	0.232	0.1920	Yes
37	Actn2	4008	0.232	0.1987	Yes
38	Nectin3	4012	0.232	0.2052	Yes
39	Tgfbi	4142	0.224	0.2045	Yes
40	Nlgn2	4301	0.218	0.2021	Yes
41	Cdk8	4417	0.214	0.2020	Yes
42	Adam9	4490	0.210	0.2041	Yes
43	Nectin2	4540	0.207	0.2073	Yes
44	Stx4a	4565	0.206	0.2119	Yes
45	Akt2	4627	0.202	0.2144	Yes
46	Negr1	4681	0.199	0.2172	Yes
47	Tmem8b	4747	0.195	0.2193	Yes
48	Cap1	4819	0.191	0.2209	Yes
49	Inppl1	4972	0.181	0.2177	No
50	Actn4	5078	0.175	0.2170	No
51	Actn1	5133	0.172	0.2190	No
52	Adra1b	5296	0.164	0.2149	No
53	Pten	5330	0.162	0.2177	No
54	Ptk2	5433	0.157	0.2166	No
55	Shroom2	5511	0.154	0.2169	No
56	Actg1	5675	0.147	0.2121	No
57	Cadm2	5762	0.143	0.2115	No
58	Alox8	5853	0.139	0.2106	No
59	Itgb4	6189	0.123	0.1958	No
60	Map3k20	6241	0.120	0.1965	No
61	Map4k2	6347	0.116	0.1940	No
62	Shc1	6385	0.113	0.1953	No
63	Skap2	6442	0.111	0.1954	No
64	Crat	6577	0.105	0.1911	No
65	Gtf2f1	6647	0.101	0.1902	No
66	Jam3	6677	0.100	0.1915	No
67	Icam4	6687	0.099	0.1938	No
68	Ctnnd1	6749	0.097	0.1933	No
69	Vcan	6763	0.096	0.1953	No
70	Nectin4	6777	0.095	0.1974	No
71	Pik3cb	6784	0.095	0.1998	No
72	Baiap2	6882	0.091	0.1971	No
73	Lamb3	6982	0.085	0.1941	No
74	Mapk14	6991	0.085	0.1961	No
75	Arhgef6	7005	0.084	0.1978	No
76	Amigo1	7606	0.059	0.1666	No
77	Src	7746	0.054	0.1606	No
78	Zyx	7762	0.053	0.1613	No
79	Dlg1	7771	0.053	0.1624	No
80	Pals1	8028	0.042	0.1496	No
81	Vasp	8111	0.039	0.1462	No
82	Icam2	8166	0.037	0.1443	No
83	Tsc1	8312	0.030	0.1372	No
84	Epb41l2	8640	0.018	0.1198	No
85	Tial1	8704	0.015	0.1168	No
86	Bmp1	8874	0.008	0.1078	No
87	Akt3	8875	0.008	0.1080	No
88	Cd34	8889	0.007	0.1075	No
89	Tspan4	9177	-0.002	0.0918	No
90	Taok2	9212	-0.003	0.0900	No
91	Traf1	9265	-0.006	0.0873	No
92	Nf1	9359	-0.010	0.0825	No
93	Rhof	9387	-0.011	0.0814	No
94	Insig1	9548	-0.018	0.0731	No
95	Sgce	9613	-0.020	0.0702	No
96	Cd274	9780	-0.027	0.0619	No
97	Tjp1	9800	-0.028	0.0616	No
98	Syk	10113	-0.040	0.0457	No
99	Itga10	10169	-0.043	0.0439	No
100	Msn	10228	-0.046	0.0421	No
101	Fscn1	10231	-0.046	0.0433	No
102	Vav2	10271	-0.048	0.0425	No
103	Ctnna1	10347	-0.051	0.0399	No
104	Mapk11	10529	-0.059	0.0316	No
105	Sirpa	10585	-0.061	0.0304	No
106	Icam1	10695	-0.066	0.0263	No
107	Ptprc	10739	-0.068	0.0259	No
108	Sdc3	10805	-0.071	0.0244	No
109	Mvd	10818	-0.071	0.0258	No
110	Col16a1	11058	-0.082	0.0150	No
111	Pik3r3	11110	-0.083	0.0146	No
112	Amigo2	11364	-0.096	0.0035	No
113	Layn	11632	-0.105	-0.0081	No
114	Thy1	11664	-0.107	-0.0067	No
115	Exoc4	11925	-0.118	-0.0175	No
116	Jup	11974	-0.121	-0.0167	No
117	Pecam1	12121	-0.127	-0.0210	No
118	Nlgn3	12366	-0.139	-0.0304	No
119	Myh10	12411	-0.141	-0.0288	No
120	Ywhah	12412	-0.141	-0.0247	No
121	Gnai2	12566	-0.149	-0.0288	No
122	Evl	12839	-0.162	-0.0391	No
123	Nexn	12949	-0.168	-0.0402	No
124	Rsu1	13085	-0.174	-0.0426	No
125	Sympk	13143	-0.176	-0.0406	No
126	Lama3	13246	-0.182	-0.0410	No
127	Speg	13572	-0.198	-0.0531	No
128	Cnn2	13639	-0.202	-0.0509	No
129	Egfr	13692	-0.205	-0.0479	No
130	Vwf	13903	-0.213	-0.0532	No
131	Cercam	14006	-0.218	-0.0525	No
132	Atp1a3	14139	-0.225	-0.0533	No
133	Sorbs3	14179	-0.227	-0.0489	No
134	Cd86	14290	-0.234	-0.0482	No
135	Gamt	14430	-0.241	-0.0488	No
136	Itga3	14507	-0.246	-0.0459	No
137	Arpc2	14808	-0.263	-0.0548	No
138	Gnai1	15004	-0.273	-0.0576	No
139	Mapk13	15030	-0.274	-0.0511	No
140	Pbx2	15093	-0.279	-0.0464	No
141	Rac2	15251	-0.292	-0.0466	No
142	Actb	15486	-0.307	-0.0506	No
143	Cdh1	15782	-0.329	-0.0574	No
144	Slit2	15966	-0.342	-0.0575	No
145	Fbn1	16118	-0.353	-0.0556	No
146	Nfasc	16359	-0.373	-0.0581	No
147	Adam23	16649	-0.402	-0.0623	No
148	Rras	17438	-0.505	-0.0910	No
149	Pfn1	17546	-0.525	-0.0817	No
150	Myl12b	17865	-0.591	-0.0821	No
151	Hras	18023	-0.638	-0.0724	No
152	Cldn15	18079	-0.662	-0.0564	No
153	Tubg1	18247	-0.754	-0.0438	No
154	Mpzl1	18259	-0.768	-0.0223	No
155	Wnk4	18391	-1.057	0.0009	No