Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	CLP.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.19959381
Normalized Enrichment Score (NES)	0.8712101
Nominal p-value	0.7209302
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ak4	11	1.020	0.0280	Yes
2	Tgm2	181	0.659	0.0372	Yes
3	Sdc4	300	0.609	0.0478	Yes
4	Vegfa	574	0.524	0.0476	Yes
5	Noct	628	0.511	0.0590	Yes
6	Fos	652	0.507	0.0720	Yes
7	Pdgfb	725	0.493	0.0819	Yes
8	Gpc3	891	0.462	0.0858	Yes
9	Gapdhs	901	0.460	0.0982	Yes
10	Rora	1097	0.424	0.0994	Yes
11	Hdlbp	1203	0.413	0.1052	Yes
12	Inha	1250	0.407	0.1141	Yes
13	Dusp1	1327	0.399	0.1211	Yes
14	Jun	1468	0.383	0.1242	Yes
15	Jmjd6	1512	0.379	0.1325	Yes
16	Foxo3	1652	0.364	0.1351	Yes
17	Col5a1	1756	0.355	0.1394	Yes
18	Mxi1	1780	0.352	0.1480	Yes
19	Fam162a	1964	0.333	0.1473	Yes
20	Rbpj	1988	0.330	0.1553	Yes
21	Pygm	2132	0.321	0.1565	Yes
22	Cav1	2232	0.313	0.1598	Yes
23	Kif5a	2266	0.310	0.1667	Yes
24	Pgk1	2314	0.306	0.1727	Yes
25	Akap12	2667	0.280	0.1613	Yes
26	Bcl2	2817	0.270	0.1607	Yes
27	Slc37a4	2828	0.269	0.1677	Yes
28	Sdc2	3053	0.253	0.1625	Yes
29	Pim1	3251	0.241	0.1585	Yes
30	Atf3	3318	0.236	0.1615	Yes
31	Rragd	3322	0.236	0.1679	Yes
32	Sdc3	3419	0.229	0.1691	Yes
33	Fbp1	3442	0.229	0.1743	Yes
34	Nfil3	3443	0.228	0.1807	Yes
35	Angptl4	3676	0.216	0.1741	Yes
36	Ero1a	3678	0.216	0.1801	Yes
37	Pgm2	3767	0.211	0.1812	Yes
38	Hk2	3895	0.204	0.1799	Yes
39	P4ha2	3946	0.201	0.1828	Yes
40	Selenbp1	3950	0.201	0.1883	Yes
41	Pfkfb3	3971	0.200	0.1928	Yes
42	Vldlr	4020	0.198	0.1958	Yes
43	Map3k1	4258	0.185	0.1880	Yes
44	Slc2a1	4288	0.184	0.1915	Yes
45	Gpi1	4310	0.182	0.1955	Yes
46	Myh9	4329	0.181	0.1996	Yes
47	Ndst1	4547	0.170	0.1925	No
48	Slc2a5	4581	0.168	0.1954	No
49	Atp7a	4698	0.162	0.1936	No
50	Large1	4740	0.160	0.1958	No
51	Eno3	5035	0.147	0.1838	No
52	Hs3st1	5465	0.129	0.1639	No
53	Pgm1	5549	0.125	0.1629	No
54	Cdkn1b	5628	0.122	0.1620	No
55	Maff	5635	0.121	0.1651	No
56	Btg1	5642	0.121	0.1681	No
57	Ext1	5853	0.111	0.1598	No
58	Hk1	5881	0.110	0.1614	No
59	Cxcr4	5940	0.108	0.1612	No
60	Chst3	6119	0.100	0.1543	No
61	Vhl	6233	0.095	0.1507	No
62	Klhl24	6530	0.082	0.1368	No
63	Hexa	6553	0.082	0.1379	No
64	Sap30	6578	0.081	0.1389	No
65	Pam	6753	0.074	0.1314	No
66	Tes	6790	0.073	0.1315	No
67	Chst2	7033	0.064	0.1200	No
68	Pklr	7193	0.058	0.1129	No
69	Cdkn1c	7320	0.052	0.1075	No
70	Plaur	7381	0.050	0.1056	No
71	Ddit4	7561	0.042	0.0970	No
72	B4galnt2	7716	0.036	0.0896	No
73	Zfp36	7745	0.035	0.0890	No
74	Sult2b1	7863	0.031	0.0835	No
75	Wsb1	7925	0.028	0.0809	No
76	Siah2	8331	0.013	0.0591	No
77	Tpd52	8338	0.012	0.0591	No
78	Xpnpep1	8366	0.011	0.0579	No
79	Tpi1	8459	0.008	0.0531	No
80	Ppp1r15a	8487	0.007	0.0518	No
81	Tgfbi	8514	0.006	0.0506	No
82	Cavin1	8515	0.006	0.0508	No
83	Ndrg1	8641	0.002	0.0440	No
84	Gaa	8650	0.002	0.0436	No
85	Isg20	8756	-0.002	0.0379	No
86	Bnip3l	8846	-0.006	0.0332	No
87	Gck	9472	-0.030	-0.0002	No
88	Tiparp	9574	-0.034	-0.0048	No
89	Eno1b	9658	-0.038	-0.0083	No
90	Ankzf1	9913	-0.047	-0.0209	No
91	Plin2	10183	-0.059	-0.0340	No
92	Bhlhe40	10276	-0.062	-0.0373	No
93	Fosl2	10292	-0.062	-0.0364	No
94	Irs2	10305	-0.063	-0.0353	No
95	Gcnt2	10367	-0.065	-0.0368	No
96	Eno2	10369	-0.065	-0.0350	No
97	Gbe1	10379	-0.066	-0.0337	No
98	Errfi1	10512	-0.071	-0.0389	No
99	Zfp292	10619	-0.076	-0.0426	No
100	Grhpr	10659	-0.078	-0.0425	No
101	Scarb1	10675	-0.078	-0.0412	No
102	Nedd4l	10750	-0.081	-0.0429	No
103	Ccng2	10755	-0.082	-0.0409	No
104	Egfr	10906	-0.087	-0.0466	No
105	Pdk1	11147	-0.097	-0.0571	No
106	Tpst2	11215	-0.099	-0.0580	No
107	Ppfia4	11287	-0.103	-0.0590	No
108	Ppargc1a	11429	-0.108	-0.0636	No
109	Hmox1	11648	-0.117	-0.0723	No
110	Slc2a3	11660	-0.117	-0.0696	No
111	Pdk3	11827	-0.124	-0.0752	No
112	Aldoc	11850	-0.125	-0.0729	No
113	Gpc4	11905	-0.128	-0.0723	No
114	Gpc1	12081	-0.135	-0.0781	No
115	Tgfb3	12091	-0.135	-0.0748	No
116	Plac8	12167	-0.139	-0.0750	No
117	Phkg1	12460	-0.153	-0.0867	No
118	Kdm3a	12461	-0.153	-0.0824	No
119	Nr3c1	12473	-0.153	-0.0787	No
120	Cited2	12489	-0.154	-0.0752	No
121	P4ha1	12684	-0.164	-0.0812	No
122	S100a4	12698	-0.165	-0.0773	No
123	Hspa5	12762	-0.168	-0.0761	No
124	Cp	13048	-0.181	-0.0866	No
125	Gys1	13337	-0.195	-0.0969	No
126	Aldoa	13520	-0.205	-0.1011	No
127	Pfkp	13617	-0.210	-0.1005	No
128	Anxa2	13715	-0.215	-0.0998	No
129	Lxn	14117	-0.236	-0.1152	No
130	Ugp2	14118	-0.236	-0.1085	No
131	Prkca	14181	-0.239	-0.1052	No
132	Ets1	14202	-0.240	-0.0996	No
133	Slc6a6	14209	-0.240	-0.0932	No
134	Cdkn1a	14553	-0.261	-0.1046	No
135	Ddit3	14694	-0.268	-0.1048	No
136	Ier3	14803	-0.276	-0.1030	No
137	Ndst2	14868	-0.281	-0.0986	No
138	Pfkl	15064	-0.293	-0.1010	No
139	Ampd3	15081	-0.294	-0.0937	No
140	Nagk	15869	-0.350	-0.1270	No
141	Ids	15888	-0.351	-0.1181	No
142	Prdx5	15999	-0.360	-0.1140	No
143	Car12	16079	-0.367	-0.1081	No
144	Pnrc1	16085	-0.368	-0.0980	No
145	Dtna	16345	-0.391	-0.1012	No
146	Mif	16484	-0.403	-0.0975	No
147	Glrx	16506	-0.406	-0.0873	No
148	Mt1	16731	-0.427	-0.0875	No
149	Klf7	16748	-0.429	-0.0764	No
150	Galk1	17008	-0.458	-0.0777	No
151	Ldha	17037	-0.462	-0.0663	No
152	Slc25a1	17057	-0.465	-0.0543	No
153	Csrp2	17696	-0.564	-0.0735	No
154	Casp6	17715	-0.569	-0.0585	No
155	Ilvbl	17758	-0.577	-0.0446	No
156	Adora2b	17900	-0.619	-0.0350	No
157	Klf6	18131	-0.708	-0.0277	No
158	B3galt6	18194	-0.744	-0.0102	No
159	Tnfaip3	18239	-0.781	0.0093	No