Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.31563324
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2666986
Nominal p-value	0.13263159
FDR q-value	0.7569047
FWER p-Value	0.898

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Gfpt2	30	1.076	0.0268	Yes
2	Cebpd	261	0.729	0.0323	Yes
3	Fosl2	296	0.706	0.0490	Yes
4	Lamb3	366	0.666	0.0626	Yes
5	Mcl1	686	0.573	0.0585	Yes
6	Tlr2	698	0.570	0.0730	Yes
7	Tnf	722	0.562	0.0866	Yes
8	Zbtb10	736	0.559	0.1006	Yes
9	Gadd45a	876	0.533	0.1064	Yes
10	Ldlr	890	0.531	0.1198	Yes
11	Litaf	1008	0.502	0.1260	Yes
12	Ptgs2	1056	0.488	0.1362	Yes
13	Ppp1r15a	1083	0.483	0.1474	Yes
14	Tsc22d1	1098	0.480	0.1594	Yes
15	Nfkbie	1140	0.470	0.1694	Yes
16	Pfkfb3	1223	0.454	0.1765	Yes
17	Fos	1239	0.452	0.1876	Yes
18	Sat1	1284	0.445	0.1968	Yes
19	Spsb1	1300	0.442	0.2077	Yes
20	Nr4a1	1338	0.439	0.2171	Yes
21	Cd80	1355	0.438	0.2278	Yes
22	Hbegf	1551	0.417	0.2271	Yes
23	Klf6	1706	0.403	0.2285	Yes
24	Nfkb1	1716	0.403	0.2387	Yes
25	Traf1	1847	0.383	0.2410	Yes
26	Gem	1929	0.378	0.2462	Yes
27	Cd69	1930	0.378	0.2562	Yes
28	Ehd1	1949	0.377	0.2651	Yes
29	Gch1	1985	0.374	0.2730	Yes
30	Il6	2043	0.367	0.2793	Yes
31	Icam1	2056	0.366	0.2883	Yes
32	Fosl1	2067	0.365	0.2974	Yes
33	Nfil3	2372	0.331	0.2878	Yes
34	Id2	2640	0.307	0.2798	Yes
35	Fosb	2755	0.298	0.2809	Yes
36	Ripk2	2765	0.297	0.2882	Yes
37	Smad3	2793	0.295	0.2944	Yes
38	Pdlim5	2795	0.294	0.3022	Yes
39	Tnfaip8	3001	0.278	0.2972	Yes
40	Ninj1	3251	0.262	0.2891	Yes
41	Phlda1	3316	0.258	0.2921	Yes
42	Per1	3371	0.258	0.2957	Yes
43	Junb	3392	0.256	0.3013	Yes
44	Jag1	3467	0.255	0.3036	Yes
45	Egr1	3629	0.249	0.3005	Yes
46	Panx1	3639	0.248	0.3066	Yes
47	Tnfsf9	3739	0.241	0.3070	Yes
48	Il7r	3769	0.239	0.3116	Yes
49	Slc16a6	3807	0.236	0.3156	Yes
50	Tnfaip3	4109	0.219	0.3033	No
51	Sphk1	4132	0.218	0.3077	No
52	Atp2b1	4319	0.205	0.3019	No
53	Sgk1	4337	0.203	0.3063	No
54	Plek	4347	0.202	0.3111	No
55	Jun	4662	0.187	0.2971	No
56	Tnip1	4670	0.186	0.3016	No
57	Slc2a3	4750	0.181	0.3017	No
58	Snn	4767	0.180	0.3055	No
59	Gpr183	4964	0.169	0.2982	No
60	Cflar	4984	0.168	0.3015	No
61	Tiparp	5046	0.164	0.3022	No
62	Ccnl1	5071	0.163	0.3051	No
63	B4galt5	5109	0.161	0.3071	No
64	Nfe2l2	5131	0.160	0.3101	No
65	Ptpre	5149	0.159	0.3133	No
66	Bhlhe40	5281	0.152	0.3094	No
67	Btg1	5509	0.141	0.2994	No
68	Dusp1	5531	0.139	0.3019	No
69	Ier5	5575	0.136	0.3029	No
70	Klf2	5742	0.126	0.2962	No
71	Icosl	5764	0.125	0.2982	No
72	Trip10	5766	0.125	0.3015	No
73	Nr4a2	6044	0.109	0.2877	No
74	Btg2	6094	0.107	0.2875	No
75	Csf1	6383	0.090	0.2725	No
76	Il18	6437	0.088	0.2717	No
77	Bcl3	6634	0.076	0.2618	No
78	Eif1	6763	0.070	0.2560	No
79	Klf10	6789	0.069	0.2563	No
80	Il15ra	7097	0.053	0.2391	No
81	Slc2a6	7368	0.040	0.2239	No
82	Nfkbia	7433	0.036	0.2210	No
83	Ets2	7633	0.028	0.2097	No
84	Kdm6b	7638	0.028	0.2102	No
85	B4galt1	7664	0.027	0.2094	No
86	Klf4	8117	0.004	0.1822	No
87	Zfp36	8146	0.003	0.1806	No
88	Socs3	8296	0.000	0.1716	No
89	Dusp2	8513	-0.001	0.1586	No
90	Cd44	8641	-0.006	0.1510	No
91	Cdkn1a	8774	-0.013	0.1434	No
92	Btg3	8787	-0.013	0.1430	No
93	Mxd1	8801	-0.014	0.1426	No
94	Rel	8867	-0.017	0.1392	No
95	Irf1	9090	-0.028	0.1265	No
96	Ier2	9245	-0.035	0.1181	No
97	Rela	9375	-0.040	0.1114	No
98	Nfat5	9399	-0.042	0.1111	No
99	Trib1	9675	-0.055	0.0960	No
100	Maff	9703	-0.056	0.0958	No
101	Rcan1	9729	-0.058	0.0959	No
102	Dnajb4	9779	-0.060	0.0945	No
103	Marcks	9844	-0.063	0.0923	No
104	Ifngr2	10036	-0.072	0.0827	No
105	Vegfa	10105	-0.075	0.0805	No
106	Rnf19b	10112	-0.076	0.0822	No
107	Serpinb2	10271	-0.082	0.0748	No
108	Sqstm1	10282	-0.083	0.0764	No
109	Tnip2	10367	-0.086	0.0737	No
110	Dram1	10474	-0.091	0.0697	No
111	Rhob	10500	-0.093	0.0706	No
112	Map3k8	10590	-0.098	0.0679	No
113	Nampt	10731	-0.105	0.0622	No
114	Relb	10768	-0.107	0.0629	No
115	Ccnd1	10787	-0.109	0.0647	No
116	Olr1	10945	-0.118	0.0583	No
117	Birc3	10957	-0.118	0.0608	No
118	Yrdc	11729	-0.161	0.0185	No
119	Fut4	11838	-0.166	0.0164	No
120	Ifih1	11930	-0.172	0.0155	No
121	Il6st	11954	-0.173	0.0187	No
122	Ier3	11967	-0.174	0.0226	No
123	Dusp5	12466	-0.200	-0.0022	No
124	Tubb2a	12486	-0.202	0.0021	No
125	Map2k3	12680	-0.215	-0.0039	No
126	Clcf1	12694	-0.216	0.0011	No
127	Dennd5a	12804	-0.222	0.0004	No
128	Pde4b	12878	-0.227	0.0020	No
129	Cebpb	12954	-0.231	0.0036	No
130	Stat5a	13096	-0.240	0.0015	No
131	Bcl6	13328	-0.255	-0.0057	No
132	Tgif1	13541	-0.269	-0.0113	No
133	Ccrl2	13596	-0.274	-0.0073	No
134	Ptger4	13614	-0.275	-0.0010	No
135	Tnfrsf9	13694	-0.280	0.0017	No
136	Tap1	13892	-0.292	-0.0025	No
137	Gadd45b	14023	-0.304	-0.0022	No
138	Klf9	14246	-0.317	-0.0072	No
139	Pmepa1	14452	-0.334	-0.0107	No
140	Irs2	14499	-0.338	-0.0045	No
141	Tank	14523	-0.340	0.0032	No
142	Abca1	14688	-0.352	0.0026	No
143	Zc3h12a	14695	-0.353	0.0116	No
144	Rigi	15131	-0.401	-0.0040	No
145	Plaur	15136	-0.402	0.0064	No
146	Ifit2	15150	-0.403	0.0164	No
147	Myc	15162	-0.404	0.0265	No
148	Tnfaip2	15218	-0.411	0.0340	No
149	Birc2	15301	-0.419	0.0402	No
150	Nfkb2	15610	-0.465	0.0340	No
151	Sod2	16201	-0.593	0.0141	No
152	Pnrc1	16212	-0.599	0.0294	No