Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.26732293
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1831763
Nominal p-value	0.1764706
FDR q-value	0.7263464
FWER p-Value	0.974

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ets1	11	1.236	0.0306	Yes
2	Gys1	40	1.034	0.0550	Yes
3	Hk2	190	0.778	0.0657	Yes
4	Fosl2	296	0.706	0.0772	Yes
5	Prkca	305	0.700	0.0945	Yes
6	Rora	462	0.620	0.1007	Yes
7	Car12	717	0.563	0.0996	Yes
8	Slc37a4	956	0.515	0.0982	Yes
9	Bcl2	1028	0.496	0.1065	Yes
10	Hs3st1	1048	0.491	0.1178	Yes
11	Pfkp	1065	0.487	0.1291	Yes
12	Tpst2	1066	0.487	0.1414	Yes
13	Ppp1r15a	1083	0.483	0.1527	Yes
14	Hdlbp	1113	0.477	0.1630	Yes
15	Ndst2	1151	0.467	0.1726	Yes
16	Pfkfb3	1223	0.454	0.1798	Yes
17	Myh9	1233	0.452	0.1907	Yes
18	Fos	1239	0.452	0.2018	Yes
19	Klf6	1706	0.403	0.1839	Yes
20	Scarb1	1773	0.394	0.1898	Yes
21	Ero1a	1897	0.381	0.1920	Yes
22	Bgn	1912	0.378	0.2008	Yes
23	Il6	2043	0.367	0.2022	Yes
24	Sult2b1	2058	0.366	0.2106	Yes
25	Sdc3	2095	0.364	0.2176	Yes
26	Phkg1	2304	0.340	0.2137	Yes
27	Klf7	2307	0.339	0.2221	Yes
28	Xpnpep1	2325	0.337	0.2296	Yes
29	Hspa5	2349	0.333	0.2367	Yes
30	Nfil3	2372	0.331	0.2437	Yes
31	Glrx	2409	0.326	0.2498	Yes
32	Pam	2416	0.326	0.2576	Yes
33	Slc2a1	2572	0.312	0.2562	Yes
34	Anxa2	2590	0.310	0.2630	Yes
35	Sap30	2759	0.297	0.2604	Yes
36	Pgk1	2769	0.297	0.2673	Yes
37	Lxn	3104	0.272	0.2540	No
38	Cdkn1c	3149	0.268	0.2581	No
39	Gapdhs	3155	0.268	0.2646	No
40	Slc6a6	3237	0.263	0.2663	No
41	Eno3	3377	0.257	0.2645	No
42	Pgm1	3715	0.243	0.2502	No
43	Jmjd6	3724	0.242	0.2559	No
44	B3galt6	3883	0.231	0.2522	No
45	Tes	3896	0.230	0.2573	No
46	Pdk3	3970	0.230	0.2587	No
47	Tnfaip3	4109	0.219	0.2559	No
48	Gaa	4275	0.208	0.2512	No
49	Cp	4418	0.198	0.2476	No
50	Cxcr4	4616	0.190	0.2405	No
51	Jun	4662	0.187	0.2425	No
52	Slc2a3	4750	0.181	0.2418	No
53	Ak4	4859	0.175	0.2397	No
54	Pygm	4918	0.172	0.2406	No
55	Nedd4l	5019	0.166	0.2387	No
56	Pfkl	5022	0.166	0.2428	No
57	Tgm2	5023	0.166	0.2470	No
58	Tiparp	5046	0.164	0.2498	No
59	Grhpr	5167	0.158	0.2465	No
60	P4ha1	5237	0.154	0.2463	No
61	Ilvbl	5264	0.153	0.2486	No
62	Bhlhe40	5281	0.152	0.2514	No
63	Btg1	5509	0.141	0.2413	No
64	Dusp1	5531	0.139	0.2435	No
65	Cavin1	5549	0.138	0.2460	No
66	Ndst1	5619	0.133	0.2452	No
67	Nagk	5696	0.129	0.2438	No
68	Fam162a	5723	0.127	0.2455	No
69	Wsb1	5892	0.118	0.2383	No
70	Large1	5969	0.113	0.2366	No
71	Csrp2	6023	0.110	0.2362	No
72	Hexa	6088	0.107	0.2350	No
73	Ext1	6177	0.102	0.2323	No
74	Cited2	6379	0.091	0.2224	No
75	Zfp292	6381	0.091	0.2247	No
76	Pdk1	6804	0.068	0.2009	No
77	Pgm2	6811	0.068	0.2022	No
78	Gpi1	6983	0.059	0.1934	No
79	Ddit4	7572	0.031	0.1587	No
80	Cav1	7880	0.016	0.1405	No
81	Vldlr	7976	0.011	0.1350	No
82	Zfp36	8146	0.003	0.1249	No
83	Pdgfb	8229	0.000	0.1199	No
84	B4galnt2	8241	0.000	0.1193	No
85	Errfi1	8260	0.000	0.1182	No
86	Cdkn1a	8774	-0.013	0.0875	No
87	Ankzf1	8881	-0.018	0.0816	No
88	Foxo3	8933	-0.020	0.0790	No
89	Ndrg1	9015	-0.025	0.0747	No
90	Rbpj	9022	-0.025	0.0750	No
91	Adora2b	9038	-0.026	0.0748	No
92	Gpc4	9063	-0.027	0.0740	No
93	Tgfbi	9160	-0.031	0.0690	No
94	Gbe1	9177	-0.032	0.0688	No
95	Fbp1	9252	-0.035	0.0652	No
96	Ugp2	9497	-0.046	0.0517	No
97	Prdx5	9558	-0.049	0.0493	No
98	Nr3c1	9666	-0.054	0.0442	No
99	Ppfia4	9683	-0.055	0.0446	No
100	Maff	9703	-0.056	0.0449	No
101	Aldoa	9912	-0.065	0.0340	No
102	Kif5a	9988	-0.069	0.0312	No
103	Vegfa	10105	-0.075	0.0261	No
104	Plac8	10526	-0.094	0.0031	No
105	Hmox1	10708	-0.104	-0.0052	No
106	Isg20	10881	-0.113	-0.0127	No
107	Tpd52	11064	-0.123	-0.0206	No
108	Col5a1	11105	-0.127	-0.0198	No
109	Eno1b	11124	-0.128	-0.0176	No
110	Pklr	11179	-0.131	-0.0176	No
111	Aldoc	11428	-0.144	-0.0289	No
112	Cdkn1b	11524	-0.150	-0.0309	No
113	Slc25a1	11538	-0.151	-0.0278	No
114	Mif	11596	-0.154	-0.0274	No
115	Noct	11913	-0.171	-0.0421	No
116	Bnip3l	11955	-0.173	-0.0402	No
117	Ier3	11967	-0.174	-0.0365	No
118	Ampd3	12073	-0.180	-0.0383	No
119	Tpi1	12684	-0.215	-0.0697	No
120	Casp6	12797	-0.221	-0.0709	No
121	Hk1	12893	-0.228	-0.0708	No
122	Atp7a	12971	-0.233	-0.0696	No
123	Map3k1	12985	-0.235	-0.0644	No
124	Akap12	13334	-0.256	-0.0790	No
125	Klhl24	13355	-0.258	-0.0737	No
126	Gcnt2	13467	-0.265	-0.0737	No
127	Ids	13573	-0.272	-0.0732	No
128	Gpc1	13775	-0.284	-0.0781	No
129	Gpc3	14127	-0.310	-0.0915	No
130	Pim1	14137	-0.311	-0.0842	No
131	Cavin3	14214	-0.316	-0.0808	No
132	Irs2	14499	-0.338	-0.0894	No
133	Plaur	15136	-0.402	-0.1176	No
134	Sdc2	15303	-0.419	-0.1171	No
135	Siah2	15337	-0.424	-0.1083	No
136	Ldha	15394	-0.432	-0.1008	No
137	Kdm3a	15398	-0.433	-0.0900	No
138	Galk1	15730	-0.486	-0.0977	No
139	Mxi1	15799	-0.496	-0.0893	No
140	Ccng2	16024	-0.542	-0.0891	No
141	Angptl4	16062	-0.552	-0.0774	No
142	Selenbp1	16067	-0.553	-0.0636	No
143	Plin2	16150	-0.577	-0.0540	No
144	Vhl	16163	-0.581	-0.0400	No
145	Pnrc1	16212	-0.599	-0.0278	No
146	Mt1	16473	-0.727	-0.0251	No
147	Ldhc	16481	-0.732	-0.0070	No
148	Ddit3	16557	-0.795	0.0086	No