Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.29912645
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3121665
Nominal p-value	0.01734104
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.831

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Tjp1	168	0.794	0.0119	Yes
2	Ikbkg	206	0.765	0.0310	Yes
3	Sirpa	220	0.755	0.0512	Yes
4	Rhof	321	0.693	0.0645	Yes
5	Lamb3	366	0.666	0.0804	Yes
6	Itga10	382	0.659	0.0978	Yes
7	Map4k2	494	0.611	0.1081	Yes
8	Cdk8	528	0.605	0.1230	Yes
9	Arhgef6	585	0.589	0.1360	Yes
10	Nectin4	726	0.561	0.1431	Yes
11	Actn4	804	0.549	0.1537	Yes
12	Icam5	989	0.506	0.1567	Yes
13	Cd86	1071	0.486	0.1654	Yes
14	Myh9	1233	0.452	0.1682	Yes
15	Mmp2	1249	0.450	0.1798	Yes
16	Hras	1263	0.448	0.1915	Yes
17	Msn	1315	0.441	0.2007	Yes
18	Shc1	1489	0.427	0.2021	Yes
19	Jup	1494	0.425	0.2137	Yes
20	Vcl	1606	0.411	0.2185	Yes
21	Adam9	1695	0.406	0.2244	Yes
22	Evl	1800	0.389	0.2290	Yes
23	Traf1	1847	0.383	0.2369	Yes
24	Actn3	1963	0.377	0.2404	Yes
25	Icam1	2056	0.366	0.2451	Yes
26	Ptk2	2094	0.364	0.2530	Yes
27	Sdc3	2095	0.364	0.2631	Yes
28	Atp1a3	2202	0.350	0.2665	Yes
29	Cdh1	2312	0.338	0.2693	Yes
30	Alox8	2501	0.319	0.2668	Yes
31	Itga2	2606	0.309	0.2692	Yes
32	Shroom2	2675	0.305	0.2735	Yes
33	Adam15	2705	0.302	0.2802	Yes
34	Nlgn3	2791	0.295	0.2832	Yes
35	Vwf	2861	0.289	0.2871	Yes
36	Lama3	3036	0.275	0.2843	Yes
37	Mapk11	3042	0.275	0.2916	Yes
38	Amh	3130	0.268	0.2938	Yes
39	Ywhah	3233	0.263	0.2950	Yes
40	Cdh3	3285	0.260	0.2991	Yes
41	Cercam	3578	0.252	0.2885	No
42	Cnn2	3652	0.247	0.2910	No
43	Baiap2	3811	0.236	0.2880	No
44	Taok2	4134	0.217	0.2746	No
45	Mapk14	4172	0.215	0.2784	No
46	Cd274	4243	0.210	0.2800	No
47	Pals1	4349	0.202	0.2793	No
48	Cap1	4364	0.201	0.2840	No
49	Wasl	5086	0.162	0.2450	No
50	Pik3cb	5372	0.148	0.2319	No
51	Nrap	5440	0.144	0.2318	No
52	Nectin1	5455	0.144	0.2350	No
53	Cldn15	5527	0.139	0.2346	No
54	Pecam1	5533	0.139	0.2381	No
55	Bmp1	5702	0.128	0.2316	No
56	Mvd	5735	0.127	0.2332	No
57	Cdh11	5776	0.124	0.2342	No
58	Inppl1	6215	0.099	0.2105	No
59	Itgb4	6221	0.099	0.2130	No
60	Nectin3	6247	0.098	0.2142	No
61	Tmem8b	6327	0.094	0.2120	No
62	Jam3	6329	0.093	0.2146	No
63	Vasp	6389	0.090	0.2135	No
64	Dhx16	6440	0.087	0.2129	No
65	Pard6g	6699	0.073	0.1993	No
66	Tial1	6704	0.073	0.2011	No
67	Cadm3	6852	0.066	0.1941	No
68	Ldlrap1	6931	0.062	0.1911	No
69	Hadh	6934	0.062	0.1927	No
70	Rsu1	7074	0.054	0.1858	No
71	Wnk4	7095	0.053	0.1861	No
72	Ctnna1	7125	0.052	0.1858	No
73	Plcg1	7216	0.048	0.1817	No
74	Cdh4	7499	0.033	0.1656	No
75	Rasa1	7530	0.033	0.1647	No
76	Akt2	7591	0.030	0.1619	No
77	B4galt1	7664	0.027	0.1583	No
78	Akt3	7793	0.021	0.1511	No
79	Nf2	7874	0.016	0.1468	No
80	Zyx	8046	0.007	0.1366	No
81	Rac2	8105	0.004	0.1332	No
82	Crat	8132	0.003	0.1317	No
83	Src	8572	-0.004	0.1053	No
84	Adamts5	8578	-0.004	0.1051	No
85	Itga9	8720	-0.010	0.0969	No
86	Gnai2	9075	-0.027	0.0763	No
87	Gamt	9088	-0.028	0.0763	No
88	Tgfbi	9160	-0.031	0.0729	No
89	Epb41l2	9189	-0.033	0.0721	No
90	Thy1	9198	-0.033	0.0726	No
91	Actn1	9224	-0.034	0.0720	No
92	Pfn1	9379	-0.041	0.0638	No
93	Gtf2f1	9456	-0.044	0.0605	No
94	Amigo1	9560	-0.049	0.0556	No
95	Skap2	9781	-0.060	0.0440	No
96	Actg1	9904	-0.065	0.0384	No
97	Stx4a	9936	-0.067	0.0384	No
98	Rras	9997	-0.070	0.0368	No
99	Exoc4	10071	-0.074	0.0344	No
100	Tsc1	10122	-0.076	0.0335	No
101	Col16a1	10313	-0.084	0.0243	No
102	Thbs3	10337	-0.085	0.0253	No
103	Nectin2	10563	-0.097	0.0144	No
104	Cd34	10840	-0.111	0.0008	No
105	Myl12b	11057	-0.123	-0.0088	No
106	Syk	11058	-0.123	-0.0053	No
107	Dlg1	11351	-0.140	-0.0191	No
108	Ptprc	11464	-0.146	-0.0218	No
109	Pkd1	11610	-0.155	-0.0262	No
110	Pbx2	11703	-0.160	-0.0273	No
111	Arpc2	11872	-0.168	-0.0328	No
112	Itgb1	11915	-0.171	-0.0305	No
113	Mpzl1	12181	-0.186	-0.0414	No
114	Tspan4	12283	-0.192	-0.0421	No
115	Insig1	12372	-0.195	-0.0420	No
116	Fbn1	12493	-0.203	-0.0436	No
117	Cadm2	12645	-0.213	-0.0468	No
118	Vcan	12756	-0.219	-0.0473	No
119	Nf1	12798	-0.221	-0.0437	No
120	Nlgn2	12852	-0.225	-0.0406	No
121	Nrtn	13383	-0.260	-0.0654	No
122	Map3k20	13413	-0.262	-0.0599	No
123	Cd276	13742	-0.280	-0.0719	No
124	Sorbs3	14010	-0.303	-0.0795	No
125	Vcam1	14119	-0.309	-0.0775	No
126	Kcnh2	14216	-0.316	-0.0745	No
127	Sympk	14249	-0.317	-0.0676	No
128	Actb	14342	-0.327	-0.0640	No
129	Sgce	14412	-0.331	-0.0590	No
130	Actn2	14545	-0.341	-0.0575	No
131	Slit2	14718	-0.355	-0.0579	No
132	Pik3r3	15586	-0.461	-0.0975	No
133	Lima1	15599	-0.463	-0.0853	No
134	Icam2	15649	-0.472	-0.0751	No
135	Icam4	15773	-0.490	-0.0689	No
136	Ctnnd1	15782	-0.492	-0.0557	No
137	Pten	15842	-0.504	-0.0452	No
138	Nexn	15895	-0.516	-0.0340	No
139	Vav2	16028	-0.543	-0.0269	No
140	Tubg1	16078	-0.556	-0.0143	No
141	Layn	16112	-0.566	-0.0006	No
142	Amigo2	16264	-0.620	0.0076	No
143	Myh10	16381	-0.670	0.0192	No