Details for gene set HALLMARK_ALLOGRAFT

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8.Basophil_Pheno.cls #Group6_versus_Group8_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group6_versus_Group8_repos
Upregulated in class	4
GeneSet	HALLMARK_ALLOGRAFT_REJECTION
Enrichment Score (ES)	0.2496222
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1781698
Nominal p-value	0.14949495
FDR q-value	0.65571404
FWER p-Value	0.975

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ets1	11	1.236	0.0309	Yes
2	Il18rap	13	1.235	0.0624	Yes
3	Itk	61	0.986	0.0848	Yes
4	Ccr1	159	0.807	0.0995	Yes
5	Tlr2	698	0.570	0.0816	Yes
6	Tnf	722	0.562	0.0946	Yes
7	Ncf4	735	0.559	0.1081	Yes
8	Il15	763	0.553	0.1206	Yes
9	Wars1	832	0.543	0.1304	Yes
10	Il2rg	834	0.542	0.1442	Yes
11	Cd74	864	0.533	0.1561	Yes
12	St8sia4	958	0.515	0.1636	Yes
13	Prkcb	1013	0.499	0.1731	Yes
14	Cd86	1071	0.486	0.1821	Yes
15	Lck	1234	0.452	0.1838	Yes
16	Map4k1	1334	0.439	0.1891	Yes
17	Cd80	1355	0.438	0.1991	Yes
18	Apbb1	1365	0.437	0.2097	Yes
19	Itgb2	1516	0.423	0.2114	Yes
20	Cd4	1569	0.414	0.2189	Yes
21	Il6	2043	0.367	0.1997	Yes
22	Icam1	2056	0.366	0.2083	Yes
23	Il27ra	2164	0.356	0.2110	Yes
24	Cd247	2213	0.349	0.2170	Yes
25	Hcls1	2240	0.346	0.2242	Yes
26	Traf2	2262	0.344	0.2318	Yes
27	C2	2607	0.309	0.2189	Yes
28	Cd47	2672	0.305	0.2228	Yes
29	Ripk2	2765	0.297	0.2249	Yes
30	Il4	2803	0.293	0.2301	Yes
31	Bcat1	2845	0.290	0.2351	Yes
32	Lcp2	2906	0.286	0.2387	Yes
33	Il12a	2930	0.283	0.2446	Yes
34	Elf4	2967	0.280	0.2496	Yes
35	H2-Aa	3148	0.268	0.2455	Yes
36	Socs1	3194	0.266	0.2496	Yes
37	Flna	3541	0.254	0.2352	No
38	Fas	3619	0.250	0.2370	No
39	Itgal	3780	0.238	0.2334	No
40	Tlr6	3809	0.236	0.2377	No
41	Hif1a	4029	0.224	0.2302	No
42	Irf8	4246	0.210	0.2226	No
43	Ctss	4543	0.195	0.2097	No
44	Nlrp3	4840	0.176	0.1963	No
45	H2-Ob	4874	0.175	0.1988	No
46	Capg	4908	0.173	0.2012	No
47	Irf7	5002	0.167	0.1998	No
48	Ikbkb	5268	0.153	0.1877	No
49	H2-DMa	5280	0.152	0.1910	No
50	Ltb	5323	0.150	0.1923	No
51	Ly86	5491	0.141	0.1858	No
52	Abi1	5554	0.138	0.1856	No
53	Eif3a	5669	0.130	0.1820	No
54	Csk	5689	0.129	0.1842	No
55	Il4ra	5691	0.129	0.1874	No
56	Icosl	5764	0.125	0.1862	No
57	Akt1	5887	0.119	0.1819	No
58	Brca1	5962	0.114	0.1803	No
59	Pf4	6018	0.110	0.1798	No
60	Eif4g3	6098	0.106	0.1778	No
61	Stab1	6200	0.100	0.1742	No
62	Il12rb1	6382	0.090	0.1656	No
63	Csf1	6383	0.090	0.1679	No
64	Cdkn2a	6425	0.088	0.1677	No
65	Il18	6437	0.088	0.1693	No
66	Spi1	6445	0.087	0.1711	No
67	Bcl3	6634	0.076	0.1617	No
68	H2-DMb2	6754	0.070	0.1563	No
69	Ccnd3	6829	0.067	0.1536	No
70	Ube2n	6872	0.065	0.1527	No
71	Jak2	7219	0.048	0.1330	No
72	Tap2	7436	0.036	0.1209	No
73	Igsf6	7728	0.024	0.1040	No
74	Stat1	8851	-0.016	0.0366	No
75	Prkcg	8902	-0.019	0.0341	No
76	Gcnt1	9158	-0.031	0.0195	No
77	Thy1	9198	-0.033	0.0180	No
78	Cd96	9291	-0.037	0.0134	No
79	Ly75	9340	-0.039	0.0115	No
80	Bcl10	9667	-0.054	-0.0068	No
81	Galnt1	9698	-0.056	-0.0072	No
82	Ube2d1	9738	-0.058	-0.0080	No
83	Crtam	9894	-0.065	-0.0157	No
84	Ifngr2	10036	-0.072	-0.0224	No
85	Psmb10	10108	-0.075	-0.0248	No
86	Cfp	10393	-0.087	-0.0397	No
87	Map3k7	10525	-0.094	-0.0452	No
88	Tgfb1	10560	-0.096	-0.0448	No
89	Mtif2	10760	-0.107	-0.0541	No
90	Was	10961	-0.119	-0.0631	No
91	Cd1d2	10973	-0.119	-0.0607	No
92	Tpd52	11064	-0.123	-0.0630	No
93	Tgfb2	11249	-0.136	-0.0707	No
94	Ptprc	11464	-0.146	-0.0798	No
95	Il11	11565	-0.152	-0.0820	No
96	Stat4	11652	-0.157	-0.0832	No
97	Ptpn6	11717	-0.161	-0.0829	No
98	F2r	11824	-0.166	-0.0851	No
99	Lyn	11827	-0.166	-0.0810	No
100	Il16	11894	-0.170	-0.0806	No
101	Ifnar2	11935	-0.172	-0.0786	No
102	Eif3j1	12199	-0.187	-0.0897	No
103	Elane	12226	-0.189	-0.0865	No
104	Srgn	12476	-0.201	-0.0964	No
105	Ccnd2	12501	-0.203	-0.0926	No
106	Glmn	12607	-0.211	-0.0936	No
107	Degs1	12707	-0.217	-0.0940	No
108	Gpr65	12759	-0.219	-0.0915	No
109	Abce1	12785	-0.221	-0.0874	No
110	Fgr	13320	-0.255	-0.1131	No
111	Acvr2a	13402	-0.261	-0.1113	No
112	Dyrk3	13519	-0.269	-0.1115	No
113	Hdac9	13676	-0.280	-0.1137	No
114	Ccr2	13753	-0.281	-0.1111	No
115	Tap1	13892	-0.292	-0.1120	No
116	Tapbp	14458	-0.335	-0.1375	No
117	Cd79a	14802	-0.363	-0.1490	No
118	Ifngr1	14957	-0.380	-0.1486	No
119	Gzmb	14965	-0.381	-0.1392	No
120	Eif3d	15060	-0.393	-0.1349	No
121	Nme1	15174	-0.406	-0.1313	No
122	Il10	15534	-0.452	-0.1415	No
123	Eif5a	15583	-0.461	-0.1326	No
124	H2-Oa	15656	-0.473	-0.1248	No
125	Npm1	15718	-0.484	-0.1161	No
126	Il7	15813	-0.500	-0.1090	No
127	Socs5	15823	-0.501	-0.0968	No
128	Fcgr2b	16170	-0.585	-0.1027	No
129	Mrpl3	16211	-0.599	-0.0898	No
130	Ache	16234	-0.609	-0.0756	No
131	Rps3a1	16419	-0.691	-0.0691	No
132	Nck1	16532	-0.764	-0.0563	No
133	Rpl9	16583	-0.834	-0.0380	No
134	B2m	16618	-0.869	-0.0179	No
135	Rps9	16626	-0.888	0.0044	No