Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group3_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group3_versus_Group4_repos
Upregulated in class	2
GeneSet	HALLMARK_MYOGENESIS
Enrichment Score (ES)	0.21744777
Normalized Enrichment Score (NES)	0.85314965
Nominal p-value	0.7211155
FDR q-value	0.9089881
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Sorbs1	312	0.684	0.0038	Yes
2	Cnn3	373	0.646	0.0215	Yes
3	Sphk1	395	0.636	0.0412	Yes
4	Schip1	533	0.594	0.0525	Yes
5	Tead4	663	0.567	0.0635	Yes
6	Pkia	909	0.510	0.0655	Yes
7	Pcx	930	0.505	0.0810	Yes
8	Wwtr1	1062	0.478	0.0889	Yes
9	Ctf1	1098	0.474	0.1024	Yes
10	Kcnh2	1284	0.447	0.1060	Yes
11	Ppfia4	1297	0.445	0.1200	Yes
12	Prnp	1299	0.445	0.1346	Yes
13	Slc6a8	1380	0.437	0.1442	Yes
14	Igf1	1446	0.429	0.1545	Yes
15	Lama2	1475	0.426	0.1668	Yes
16	Pfkm	1735	0.397	0.1643	Yes
17	Cd36	1746	0.395	0.1768	Yes
18	Ache	1805	0.390	0.1862	Yes
19	Plxnb2	1812	0.389	0.1987	Yes
20	Eno3	1848	0.386	0.2093	Yes
21	Nav2	2187	0.347	0.2004	Yes
22	Pygm	2377	0.331	0.1999	Yes
23	Mef2c	2388	0.331	0.2102	Yes
24	Dmd	2544	0.315	0.2113	Yes
25	Hbegf	2612	0.310	0.2174	Yes
26	Mybpc3	3087	0.271	0.1978	No
27	Myo1c	3173	0.265	0.2014	No
28	Bag1	3451	0.249	0.1930	No
29	Smtn	3514	0.247	0.1974	No
30	Adcy9	3572	0.245	0.2020	No
31	Eif4a2	3597	0.243	0.2086	No
32	Myh11	3679	0.238	0.2116	No
33	Ptp4a3	4068	0.214	0.1952	No
34	Tgfb1	4218	0.203	0.1929	No
35	Gaa	4255	0.202	0.1974	No
36	Mef2a	4398	0.195	0.1953	No
37	Cryab	4420	0.194	0.2004	No
38	Svil	4543	0.187	0.1992	No
39	Myl6b	4709	0.176	0.1951	No
40	Kifc3	4733	0.174	0.1995	No
41	Large1	4952	0.163	0.1917	No
42	Ncam1	5159	0.152	0.1843	No
43	Sptan1	5368	0.141	0.1764	No
44	Ryr1	5385	0.140	0.1801	No
45	Tpm3	5412	0.139	0.1831	No
46	Itgb5	5504	0.135	0.1820	No
47	Flii	5773	0.120	0.1699	No
48	Ablim1	5836	0.117	0.1700	No
49	Fdps	5987	0.109	0.1645	No
50	Sirt2	6057	0.105	0.1639	No
51	Mapre3	6105	0.103	0.1644	No
52	Bhlhe40	6143	0.102	0.1656	No
53	Gadd45b	6234	0.097	0.1633	No
54	Fgf2	6255	0.096	0.1653	No
55	Tpd52l1	6277	0.096	0.1672	No
56	Fkbp1b	6399	0.089	0.1628	No
57	Atp6ap1	6572	0.079	0.1551	No
58	Ocel1	6872	0.066	0.1392	No
59	Nqo1	6879	0.066	0.1410	No
60	Agl	6892	0.065	0.1425	No
61	App	6902	0.065	0.1441	No
62	Ak1	7072	0.057	0.1358	No
63	Syngr2	7182	0.052	0.1309	No
64	Myh9	7790	0.025	0.0951	No
65	Adam12	7891	0.021	0.0898	No
66	Bin1	8025	0.015	0.0823	No
67	Sgcd	8158	0.009	0.0746	No
68	Col1a1	8380	0.000	0.0613	No
69	Kcnh1	8412	0.000	0.0594	No
70	Fhl1	8541	-0.003	0.0518	No
71	Akt2	8729	-0.012	0.0409	No
72	Agrn	8845	-0.017	0.0346	No
73	Actn2	8940	-0.021	0.0296	No
74	Crat	9420	-0.043	0.0021	No
75	Mapk12	9423	-0.043	0.0034	No
76	Sorbs3	9531	-0.047	-0.0015	No
77	Mras	9684	-0.054	-0.0089	No
78	Foxo4	10067	-0.072	-0.0295	No
79	Gabarapl2	10493	-0.091	-0.0521	No
80	Sh2b1	10654	-0.099	-0.0585	No
81	Tsc2	10895	-0.110	-0.0694	No
82	Pde4dip	10972	-0.114	-0.0702	No
83	Actn3	11007	-0.115	-0.0684	No
84	Psen2	11146	-0.122	-0.0727	No
85	Igfbp7	11415	-0.135	-0.0845	No
86	Pdlim7	11562	-0.141	-0.0886	No
87	Gpx3	12453	-0.185	-0.1362	No
88	Klf5	12475	-0.186	-0.1313	No
89	Mef2d	12519	-0.189	-0.1277	No
90	Tnnc1	12553	-0.189	-0.1234	No
91	Cdh13	12660	-0.194	-0.1234	No
92	Chrnb1	13056	-0.218	-0.1400	No
93	Reep1	13084	-0.219	-0.1344	No
94	Atp2a1	13266	-0.231	-0.1377	No
95	Mylk	13434	-0.241	-0.1399	No
96	Mylpf	13503	-0.245	-0.1359	No
97	Acsl1	13511	-0.246	-0.1282	No
98	Rb1	13676	-0.256	-0.1296	No
99	Erbb3	13842	-0.266	-0.1308	No
100	Itgb4	13974	-0.276	-0.1296	No
101	Cdkn1a	14130	-0.289	-0.1294	No
102	Itgb1	14409	-0.309	-0.1360	No
103	Dmpk	14467	-0.314	-0.1290	No
104	Hdac5	14497	-0.316	-0.1204	No
105	Pick1	14683	-0.330	-0.1206	No
106	Camk2b	14879	-0.351	-0.1208	No
107	Tpm2	14984	-0.362	-0.1151	No
108	Rit1	14986	-0.362	-0.1032	No
109	Myom1	15201	-0.382	-0.1035	No
110	Gsn	15205	-0.383	-0.0911	No
111	Myl4	15304	-0.398	-0.0838	No
112	Nos1	15332	-0.400	-0.0723	No
113	Lsp1	15410	-0.410	-0.0634	No
114	Csrp3	15767	-0.455	-0.0698	No
115	Ifrd1	15829	-0.467	-0.0581	No
116	Notch1	15961	-0.491	-0.0498	No
117	Dapk2	16023	-0.504	-0.0368	No
118	Tnnt1	16201	-0.541	-0.0296	No
119	Lpin1	16617	-0.794	-0.0285	No
120	Col4a2	16684	-1.010	0.0009	No