Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group4_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group4_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.22828084
Normalized Enrichment Score (NES)	0.9896529
Nominal p-value	0.468
FDR q-value	0.62635267
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ddit4	37	0.962	0.0265	Yes
2	Col5a1	266	0.667	0.0327	Yes
3	Ldhc	728	0.521	0.0205	Yes
4	B4galnt2	862	0.495	0.0272	Yes
5	Cavin1	1167	0.451	0.0223	Yes
6	Vhl	1181	0.450	0.0350	Yes
7	Dusp1	1195	0.447	0.0476	Yes
8	Mxi1	1197	0.447	0.0609	Yes
9	Myh9	1271	0.435	0.0695	Yes
10	Jmjd6	1345	0.424	0.0778	Yes
11	Bhlhe40	1578	0.399	0.0757	Yes
12	Hmox1	1627	0.393	0.0845	Yes
13	Nfil3	1632	0.392	0.0960	Yes
14	Fos	1657	0.391	0.1063	Yes
15	Cdkn1b	1778	0.379	0.1104	Yes
16	Bgn	1919	0.368	0.1129	Yes
17	Klf6	1927	0.368	0.1235	Yes
18	Ppp1r15a	2028	0.357	0.1282	Yes
19	Hdlbp	2039	0.355	0.1382	Yes
20	B3galt6	2081	0.352	0.1462	Yes
21	Foxo3	2171	0.342	0.1511	Yes
22	Slc37a4	2209	0.338	0.1589	Yes
23	Hk1	2254	0.334	0.1663	Yes
24	Pygm	2297	0.331	0.1736	Yes
25	Noct	2406	0.322	0.1768	Yes
26	Ccng2	2408	0.322	0.1863	Yes
27	Jun	2573	0.307	0.1856	Yes
28	Ids	2704	0.298	0.1867	Yes
29	Pam	2819	0.289	0.1884	Yes
30	Gpc4	2917	0.280	0.1909	Yes
31	Tnfaip3	2931	0.279	0.1985	Yes
32	Eno3	3063	0.269	0.1986	Yes
33	Pim1	3113	0.265	0.2036	Yes
34	Rbpj	3126	0.264	0.2107	Yes
35	Aldoa	3277	0.254	0.2093	Yes
36	Isg20	3345	0.249	0.2127	Yes
37	Cp	3483	0.239	0.2116	Yes
38	Cdkn1c	3536	0.235	0.2154	Yes
39	Slc2a3	3590	0.231	0.2191	Yes
40	Car12	3646	0.226	0.2226	Yes
41	Ak4	3694	0.222	0.2264	Yes
42	Ndrg1	3771	0.217	0.2283	Yes
43	Aldoc	4120	0.195	0.2131	No
44	Tpd52	4200	0.189	0.2140	No
45	Hspa5	4240	0.187	0.2172	No
46	Zfp36	4306	0.183	0.2187	No
47	Tes	4357	0.179	0.2211	No
48	Ndst2	4405	0.176	0.2235	No
49	Irs2	4480	0.172	0.2242	No
50	Bnip3l	4623	0.168	0.2206	No
51	Angptl4	5005	0.147	0.2020	No
52	Plaur	5110	0.141	0.2000	No
53	Phkg1	5145	0.140	0.2021	No
54	Mt1	5276	0.132	0.1982	No
55	Nedd4l	5322	0.130	0.1994	No
56	Ero1a	5365	0.128	0.2006	No
57	Cavin3	5376	0.128	0.2039	No
58	Ier3	5489	0.123	0.2008	No
59	Errfi1	5577	0.117	0.1990	No
60	Ugp2	5669	0.112	0.1969	No
61	Kdm3a	5810	0.105	0.1916	No
62	Gapdhs	5870	0.101	0.1910	No
63	Prkca	6036	0.094	0.1839	No
64	Klf7	6238	0.084	0.1742	No
65	Gpc1	6261	0.083	0.1754	No
66	Wsb1	6296	0.080	0.1757	No
67	Hk2	6327	0.078	0.1762	No
68	Sdc3	6414	0.074	0.1733	No
69	Tpst2	6415	0.074	0.1755	No
70	Nr3c1	6490	0.071	0.1732	No
71	Map3k1	6512	0.070	0.1740	No
72	Gpc3	6579	0.067	0.1720	No
73	Gpi1	6599	0.066	0.1728	No
74	Pgm2	6728	0.059	0.1669	No
75	Pfkp	6756	0.057	0.1669	No
76	Plin2	6862	0.051	0.1621	No
77	Pfkl	6881	0.050	0.1626	No
78	Eno1b	7084	0.041	0.1516	No
79	Gaa	7102	0.040	0.1517	No
80	Lxn	7125	0.039	0.1516	No
81	Grhpr	7386	0.024	0.1366	No
82	Gcnt2	7387	0.024	0.1373	No
83	Cav1	7496	0.019	0.1314	No
84	Slc6a6	7632	0.013	0.1236	No
85	Il6	7749	0.007	0.1168	No
86	Gbe1	7835	0.003	0.1117	No
87	Zfp292	7868	0.001	0.1098	No
88	Ets1	7873	0.001	0.1096	No
89	Akap12	7904	0.000	0.1078	No
90	Pgm1	7959	-0.001	0.1045	No
91	Ppfia4	8102	-0.007	0.0962	No
92	P4ha1	8227	-0.012	0.0890	No
93	Glrx	8257	-0.013	0.0877	No
94	Btg1	8268	-0.013	0.0874	No
95	Pnrc1	8307	-0.015	0.0856	No
96	Slc25a1	8581	-0.027	0.0699	No
97	Pklr	8629	-0.029	0.0679	No
98	Adora2b	8678	-0.031	0.0659	No
99	Ndst1	8705	-0.032	0.0653	No
100	Sap30	8948	-0.042	0.0520	No
101	Casp6	9048	-0.046	0.0474	No
102	Nagk	9102	-0.048	0.0456	No
103	Vegfa	9284	-0.057	0.0364	No
104	Anxa2	9461	-0.065	0.0277	No
105	Cdkn1a	9910	-0.084	0.0032	No
106	Ddit3	9936	-0.086	0.0042	No
107	Pfkfb3	10017	-0.089	0.0021	No
108	Kif5a	10248	-0.099	-0.0089	No
109	Csrp2	10347	-0.105	-0.0116	No
110	Large1	10368	-0.106	-0.0097	No
111	Vldlr	10403	-0.108	-0.0085	No
112	Hexa	10651	-0.120	-0.0198	No
113	Scarb1	11345	-0.152	-0.0572	No
114	Atp7a	11395	-0.154	-0.0555	No
115	Ankzf1	11436	-0.157	-0.0532	No
116	Bcl2	11722	-0.172	-0.0653	No
117	Siah2	11862	-0.179	-0.0684	No
118	Klhl24	11976	-0.185	-0.0697	No
119	Sdc2	12165	-0.195	-0.0752	No
120	Pdgfb	12363	-0.205	-0.0809	No
121	Prdx5	12367	-0.205	-0.0750	No
122	Plac8	13017	-0.245	-0.1069	No
123	Gys1	13342	-0.264	-0.1186	No
124	Fosl2	13355	-0.264	-0.1114	No
125	Mif	13388	-0.267	-0.1053	No
126	Pdk3	13422	-0.269	-0.0993	No
127	Fam162a	13506	-0.275	-0.0960	No
128	Hs3st1	13602	-0.282	-0.0933	No
129	Cited2	13713	-0.289	-0.0913	No
130	Ilvbl	13835	-0.297	-0.0897	No
131	Slc2a1	14095	-0.313	-0.0960	No
132	Tpi1	14253	-0.326	-0.0958	No
133	Tgm2	14259	-0.326	-0.0863	No
134	Xpnpep1	14432	-0.342	-0.0865	No
135	Sult2b1	14751	-0.369	-0.0946	No
136	Ampd3	15188	-0.412	-0.1086	No
137	Galk1	15262	-0.421	-0.1005	No
138	Tiparp	15384	-0.436	-0.0947	No
139	Ldha	15399	-0.439	-0.0824	No
140	Tgfbi	15603	-0.464	-0.0808	No
141	Ext1	15645	-0.469	-0.0693	No
142	Cxcr4	15737	-0.486	-0.0602	No
143	Fbp1	15893	-0.516	-0.0542	No
144	Pgk1	16119	-0.570	-0.0507	No
145	Pdk1	16268	-0.613	-0.0413	No
146	Maff	16461	-0.714	-0.0315	No
147	Rora	16491	-0.735	-0.0113	No
148	Selenbp1	16560	-0.795	0.0084	No