Details for gene set HALLMARK_INTERFERON_GAMMA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_INTERFERON_GAMMA_RESPONSE
Enrichment Score (ES)	0.28104302
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1526836
Nominal p-value	0.24248497
FDR q-value	0.66291714
FWER p-Value	0.958

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Myd88	27	0.925	0.0213	Yes
2	Cd69	60	0.817	0.0396	Yes
3	Itgb7	102	0.744	0.0555	Yes
4	Jak2	140	0.700	0.0706	Yes
5	Pnp	183	0.669	0.0846	Yes
6	Lcp2	218	0.637	0.0983	Yes
7	Irf9	304	0.604	0.1082	Yes
8	Samd9l	339	0.591	0.1207	Yes
9	Fas	491	0.540	0.1250	Yes
10	Vcam1	527	0.532	0.1360	Yes
11	Rtp4	556	0.523	0.1473	Yes
12	Isg20	631	0.503	0.1553	Yes
13	Cfb	782	0.475	0.1580	Yes
14	Ncoa3	908	0.454	0.1617	Yes
15	Tnfaip3	926	0.452	0.1718	Yes
16	Psmb2	948	0.449	0.1817	Yes
17	Ptgs2	1056	0.431	0.1859	Yes
18	Lats2	1073	0.428	0.1955	Yes
19	Oas2	1160	0.414	0.2006	Yes
20	Rigi	1325	0.394	0.2004	Yes
21	Cd38	1344	0.392	0.2090	Yes
22	Trim21	1415	0.382	0.2143	Yes
23	Herc6	1480	0.374	0.2196	Yes
24	Ddx60	1555	0.367	0.2243	Yes
25	Tdrd7	1583	0.364	0.2316	Yes
26	Stat1	1619	0.362	0.2385	Yes
27	Dhx58	1643	0.359	0.2460	Yes
28	Isg15	1666	0.356	0.2535	Yes
29	Arl4a	1717	0.349	0.2591	Yes
30	St8sia4	1776	0.342	0.2641	Yes
31	Trim25	1852	0.334	0.2678	Yes
32	Txnip	2010	0.320	0.2662	Yes
33	Cmpk2	2179	0.306	0.2637	Yes
34	Pfkp	2183	0.306	0.2711	Yes
35	Gbp3	2309	0.297	0.2709	Yes
36	Ptpn2	2382	0.291	0.2737	Yes
37	Rnf213	2570	0.277	0.2693	Yes
38	Icam1	2615	0.272	0.2733	Yes
39	Eif2ak2	2676	0.268	0.2764	Yes
40	Pnpt1	2728	0.265	0.2798	Yes
41	Psme1	2845	0.257	0.2792	Yes
42	P2ry14	2918	0.252	0.2810	Yes
43	Casp3	3058	0.241	0.2786	No
44	Parp14	3246	0.230	0.2730	No
45	St3gal5	3402	0.221	0.2691	No
46	Ifih1	3448	0.218	0.2718	No
47	Psme2	3589	0.208	0.2685	No
48	Lap3	3774	0.198	0.2623	No
49	H2-Aa	3798	0.197	0.2658	No
50	Il6	4054	0.182	0.2548	No
51	Il7	4072	0.181	0.2583	No
52	Il15	4185	0.175	0.2559	No
53	Ifi27	4481	0.161	0.2420	No
54	Cmtr1	4510	0.159	0.2443	No
55	Znfx1	4513	0.159	0.2481	No
56	Irf5	4545	0.157	0.2501	No
57	Pim1	4592	0.154	0.2511	No
58	Il18bp	4639	0.152	0.2521	No
59	Trafd1	4744	0.146	0.2494	No
60	Ripk2	4814	0.143	0.2488	No
61	Nup93	4815	0.143	0.2524	No
62	Btg1	4934	0.137	0.2486	No
63	Slc25a28	5005	0.134	0.2477	No
64	Parp12	5197	0.125	0.2392	No
65	Cdkn1a	5296	0.119	0.2362	No
66	Ifitm3	5306	0.118	0.2386	No
67	Nlrc5	5393	0.114	0.2362	No
68	Casp4	5681	0.098	0.2213	No
69	Isoc1	5933	0.087	0.2083	No
70	Marchf1	5990	0.084	0.2070	No
71	Bst2	6004	0.083	0.2082	No
72	Psma2	6291	0.072	0.1927	No
73	Sppl2a	6435	0.065	0.1857	No
74	Tapbp	6608	0.056	0.1767	No
75	Sod2	6633	0.055	0.1766	No
76	Ripk1	6682	0.053	0.1750	No
77	Nmi	6712	0.051	0.1745	No
78	Pla2g4a	6736	0.050	0.1743	No
79	Sri	6844	0.045	0.1690	No
80	Rapgef6	7011	0.038	0.1599	No
81	Tap1	7032	0.037	0.1596	No
82	Batf2	7085	0.034	0.1573	No
83	Sp110	7169	0.030	0.1530	No
84	Ifitm2	7279	0.026	0.1471	No
85	Tor1b	7439	0.019	0.1379	No
86	Auts2	7528	0.015	0.1330	No
87	Psma3	7552	0.014	0.1319	No
88	Irf7	7634	0.010	0.1273	No
89	Stat3	7789	0.003	0.1181	No
90	Nfkbia	7945	-0.002	0.1087	No
91	Ptpn6	8069	-0.008	0.1015	No
92	Oasl1	8118	-0.010	0.0988	No
93	Hif1a	8255	-0.017	0.0910	No
94	Fgl2	8257	-0.017	0.0914	No
95	Cd274	8330	-0.020	0.0875	No
96	Il10ra	8350	-0.021	0.0869	No
97	Xaf1	8940	-0.048	0.0524	No
98	Bank1	8942	-0.048	0.0536	No
99	Stat2	9017	-0.052	0.0504	No
100	Tnfsf10	9126	-0.057	0.0453	No
101	Cd86	9140	-0.058	0.0459	No
102	Nampt	9204	-0.061	0.0436	No
103	Peli1	9400	-0.068	0.0335	No
104	Nod1	9409	-0.068	0.0347	No
105	Pml	9428	-0.069	0.0353	No
106	Vamp8	9599	-0.077	0.0269	No
107	Rsad2	9638	-0.079	0.0266	No
108	Nfkb1	9683	-0.081	0.0259	No
109	B2m	9806	-0.086	0.0207	No
110	Ogfr	9922	-0.091	0.0160	No
111	Arid5b	9957	-0.092	0.0162	No
112	Casp1	10006	-0.095	0.0156	No
113	Ly6e	10029	-0.096	0.0167	No
114	Irf1	10075	-0.097	0.0164	No
115	Oas3	10140	-0.099	0.0149	No
116	Ifi35	10576	-0.120	-0.0084	No
117	Eif4e3	10788	-0.130	-0.0179	No
118	Mx2	10815	-0.131	-0.0162	No
119	Samhd1	11018	-0.141	-0.0250	No
120	Irf2	11047	-0.142	-0.0231	No
121	Rnf31	11122	-0.146	-0.0240	No
122	Gpr18	11453	-0.163	-0.0399	No
123	Helz2	11460	-0.163	-0.0362	No
124	Il15ra	11550	-0.168	-0.0375	No
125	Psmb8	11618	-0.172	-0.0372	No
126	Stat4	11818	-0.182	-0.0448	No
127	Adar	11910	-0.186	-0.0457	No
128	Socs3	11913	-0.186	-0.0412	No
129	Psmb10	12129	-0.198	-0.0493	No
130	Mthfd2	12138	-0.199	-0.0448	No
131	Mvp	12364	-0.211	-0.0532	No
132	Irf8	12521	-0.218	-0.0573	No
133	Ifit2	12543	-0.220	-0.0531	No
134	Cd74	12636	-0.225	-0.0531	No
135	Casp8	12652	-0.226	-0.0484	No
136	Ciita	12864	-0.240	-0.0552	No
137	Zbp1	12943	-0.245	-0.0539	No
138	Ifnar2	12998	-0.248	-0.0510	No
139	Casp7	13132	-0.256	-0.0527	No
140	Cmklr1	13187	-0.260	-0.0495	No
141	Ptpn1	13532	-0.283	-0.0633	No
142	H2-DMa	13565	-0.285	-0.0582	No
143	Selp	13876	-0.309	-0.0693	No
144	Lgals3bp	14118	-0.329	-0.0757	No
145	Tnfaip2	14205	-0.337	-0.0726	No
146	Rbck1	14362	-0.351	-0.0734	No
147	Bpgm	14504	-0.362	-0.0729	No
148	Il4ra	14519	-0.364	-0.0648	No
149	Wars1	14551	-0.367	-0.0575	No
150	Trim14	14619	-0.373	-0.0523	No
151	Vamp5	14687	-0.379	-0.0470	No
152	Gch1	14913	-0.397	-0.0508	No
153	Trim26	14980	-0.404	-0.0448	No
154	Ifi30	15080	-0.416	-0.0405	No
155	Psmb9	15249	-0.436	-0.0398	No
156	Ube2l6	15289	-0.439	-0.0313	No
157	Pde4b	15302	-0.441	-0.0211	No
158	Ifi44	15552	-0.473	-0.0244	No
159	Plscr1	15564	-0.476	-0.0133	No
160	Epsti1	15831	-0.523	-0.0164	No
161	Usp18	16060	-0.575	-0.0160	No
162	Lysmd2	16284	-0.635	-0.0137	No
163	Upp1	16401	-0.693	-0.0036	No
164	Socs1	16620	-0.870	0.0048	No