Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_HYPOXIA
Enrichment Score (ES)	0.31473845
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2868267
Nominal p-value	0.13590264
FDR q-value	0.5645327
FWER p-Value	0.855

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Gpc4	106	0.740	0.0131	Yes
2	Jmjd6	116	0.726	0.0316	Yes
3	Nfil3	146	0.695	0.0482	Yes
4	Tpd52	169	0.679	0.0647	Yes
5	Ppp1r15a	265	0.618	0.0752	Yes
6	Dusp1	272	0.614	0.0910	Yes
7	Ndst2	292	0.607	0.1059	Yes
8	Errfi1	396	0.571	0.1147	Yes
9	Hdlbp	437	0.555	0.1268	Yes
10	Ets1	502	0.538	0.1371	Yes
11	Isg20	631	0.503	0.1426	Yes
12	Fos	874	0.462	0.1402	Yes
13	Ero1a	887	0.460	0.1516	Yes
14	Ccng2	924	0.452	0.1613	Yes
15	Tnfaip3	926	0.452	0.1731	Yes
16	P4ha1	928	0.451	0.1849	Yes
17	Cdkn1c	968	0.443	0.1942	Yes
18	Irs2	1017	0.436	0.2028	Yes
19	Cav1	1072	0.428	0.2108	Yes
20	Myh9	1353	0.392	0.2042	Yes
21	Hspa5	1372	0.388	0.2133	Yes
22	Gpi1	1433	0.380	0.2197	Yes
23	Adora2b	1485	0.373	0.2264	Yes
24	Prkca	1588	0.364	0.2298	Yes
25	Ndst1	1621	0.362	0.2374	Yes
26	Gpc3	1634	0.360	0.2462	Yes
27	Ldhc	1806	0.339	0.2448	Yes
28	Fosl2	1874	0.332	0.2494	Yes
29	Wsb1	1881	0.332	0.2578	Yes
30	Klf6	1922	0.328	0.2640	Yes
31	Hk2	1928	0.327	0.2723	Yes
32	Ampd3	1958	0.326	0.2792	Yes
33	Pfkp	2183	0.306	0.2737	Yes
34	Vhl	2200	0.305	0.2807	Yes
35	Cavin3	2206	0.304	0.2884	Yes
36	Mxi1	2258	0.301	0.2933	Yes
37	Aldoa	2298	0.298	0.2988	Yes
38	Bhlhe40	2449	0.287	0.2972	Yes
39	Ugp2	2532	0.280	0.2996	Yes
40	Cdkn1b	2553	0.278	0.3057	Yes
41	Car12	2630	0.272	0.3083	Yes
42	Rora	2890	0.253	0.2993	Yes
43	Klf7	2947	0.249	0.3025	Yes
44	Bnip3l	3002	0.246	0.3057	Yes
45	Siah2	3065	0.241	0.3083	Yes
46	Ddit4	3349	0.224	0.2971	Yes
47	Nr3c1	3384	0.222	0.3009	Yes
48	Casp6	3467	0.216	0.3016	Yes
49	Slc25a1	3619	0.207	0.2979	Yes
50	Pdgfb	3660	0.204	0.3009	Yes
51	Ndrg1	3708	0.201	0.3033	Yes
52	Cavin1	3882	0.194	0.2980	Yes
53	Slc2a3	4012	0.185	0.2951	Yes
54	Il6	4054	0.182	0.2974	Yes
55	Hmox1	4066	0.182	0.3015	Yes
56	Vegfa	4116	0.179	0.3033	Yes
57	Angptl4	4193	0.174	0.3033	Yes
58	Sdc3	4223	0.172	0.3060	Yes
59	Plaur	4245	0.171	0.3093	Yes
60	Csrp2	4261	0.170	0.3128	Yes
61	Eno1b	4304	0.169	0.3147	Yes
62	Atp7a	4543	0.157	0.3045	No
63	Kdm3a	4581	0.155	0.3063	No
64	Pim1	4592	0.154	0.3098	No
65	Foxo3	4663	0.151	0.3095	No
66	Jun	4674	0.151	0.3129	No
67	Pgk1	4867	0.140	0.3050	No
68	Mt1	4905	0.138	0.3064	No
69	Btg1	4934	0.137	0.3083	No
70	Lxn	5131	0.128	0.2998	No
71	Plin2	5141	0.128	0.3026	No
72	Slc37a4	5169	0.126	0.3043	No
73	Plac8	5220	0.123	0.3045	No
74	Cdkn1a	5296	0.119	0.3031	No
75	Col5a1	5561	0.104	0.2899	No
76	Sap30	5675	0.099	0.2857	No
77	Gys1	5676	0.099	0.2883	No
78	Pklr	5727	0.096	0.2878	No
79	Ankzf1	6445	0.064	0.2462	No
80	Noct	6551	0.059	0.2414	No
81	Rbpj	6611	0.056	0.2393	No
82	Phkg1	6638	0.054	0.2392	No
83	Eno3	6676	0.053	0.2383	No
84	Pfkfb3	6688	0.052	0.2390	No
85	Hs3st1	6830	0.046	0.2317	No
86	B4galnt2	6950	0.040	0.2256	No
87	Galk1	7259	0.027	0.2077	No
88	Hexa	7485	0.017	0.1945	No
89	Slc6a6	7503	0.016	0.1939	No
90	Hk1	7631	0.011	0.1865	No
91	Kif5a	7654	0.010	0.1855	No
92	Ddit3	8041	-0.006	0.1623	No
93	Zfp36	8606	-0.033	0.1291	No
94	Klhl24	8714	-0.037	0.1236	No
95	Pam	8727	-0.038	0.1239	No
96	Gcnt2	8932	-0.048	0.1128	No
97	Vldlr	9153	-0.058	0.1011	No
98	Ids	9283	-0.063	0.0949	No
99	Grhpr	9315	-0.065	0.0948	No
100	Tiparp	9363	-0.066	0.0937	No
101	Scarb1	9370	-0.066	0.0950	No
102	Nedd4l	9381	-0.067	0.0962	No
103	Tgfbi	9678	-0.080	0.0804	No
104	Pdk1	9978	-0.093	0.0648	No
105	Zfp292	10010	-0.095	0.0654	No
106	Nagk	10269	-0.105	0.0526	No
107	Tes	10276	-0.105	0.0550	No
108	Ext1	10395	-0.112	0.0508	No
109	Cxcr4	10431	-0.113	0.0517	No
110	Cited2	10475	-0.116	0.0521	No
111	Ier3	10521	-0.118	0.0525	No
112	Prdx5	11157	-0.148	0.0181	No
113	Ldha	11228	-0.151	0.0178	No
114	Pgm2	11265	-0.152	0.0196	No
115	Pfkl	11272	-0.153	0.0233	No
116	Pygm	11440	-0.162	0.0175	No
117	Anxa2	11513	-0.166	0.0175	No
118	Mif	11599	-0.171	0.0168	No
119	Glrx	11626	-0.172	0.0198	No
120	Bgn	11874	-0.184	0.0097	No
121	Map3k1	11905	-0.186	0.0128	No
122	Bcl2	12047	-0.193	0.0094	No
123	Gaa	12562	-0.220	-0.0159	No
124	Pnrc1	12750	-0.231	-0.0211	No
125	Cp	13028	-0.249	-0.0313	No
126	Large1	13345	-0.269	-0.0433	No
127	Ilvbl	13478	-0.279	-0.0439	No
128	Sult2b1	13808	-0.303	-0.0558	No
129	Pdk3	13902	-0.310	-0.0533	No
130	Sdc2	13920	-0.311	-0.0461	No
131	B3galt6	13957	-0.314	-0.0400	No
132	Xpnpep1	13977	-0.316	-0.0328	No
133	Gbe1	13994	-0.318	-0.0254	No
134	Pgm1	14068	-0.324	-0.0213	No
135	Ak4	14131	-0.331	-0.0164	No
136	Ppfia4	14237	-0.340	-0.0138	No
137	Fam162a	14689	-0.379	-0.0310	No
138	Fbp1	14884	-0.395	-0.0324	No
139	Akap12	15098	-0.418	-0.0342	No
140	Aldoc	15160	-0.426	-0.0267	No
141	Tpi1	15465	-0.462	-0.0329	No
142	Tpst2	15479	-0.463	-0.0215	No
143	Gapdhs	16031	-0.568	-0.0399	No
144	Tgm2	16061	-0.576	-0.0265	No
145	Maff	16078	-0.579	-0.0122	No
146	Selenbp1	16131	-0.591	0.0002	No
147	Slc2a1	16294	-0.638	0.0072	No
148	Gpc1	16341	-0.655	0.0216	No