Details for gene set HALLMARK

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_APOPTOSIS
Enrichment Score (ES)	0.26116648
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1385969
Nominal p-value	0.248
FDR q-value	0.6457704
FWER p-Value	0.969

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Bmf	1	1.347	0.0423	Yes
2	Cd69	60	0.817	0.0644	Yes
3	Rhob	124	0.720	0.0832	Yes
4	Fas	491	0.540	0.0781	Yes
5	Hgf	512	0.536	0.0938	Yes
6	Mcl1	533	0.531	0.1092	Yes
7	Isg20	631	0.503	0.1192	Yes
8	Dpyd	714	0.487	0.1295	Yes
9	Tgfbr3	991	0.440	0.1267	Yes
10	Cav1	1072	0.428	0.1353	Yes
11	Gucy2e	1077	0.428	0.1485	Yes
12	Dnajc3	1131	0.420	0.1585	Yes
13	Gsn	1139	0.419	0.1712	Yes
14	Btg3	1189	0.411	0.1812	Yes
15	Cd38	1344	0.392	0.1842	Yes
16	Nedd9	1354	0.391	0.1960	Yes
17	Aifm3	1417	0.382	0.2043	Yes
18	Btg2	1430	0.381	0.2155	Yes
19	Psen2	1517	0.371	0.2220	Yes
20	Il18	1978	0.324	0.2044	Yes
21	Retsat	1993	0.323	0.2137	Yes
22	Txnip	2010	0.320	0.2228	Yes
23	Cdc25b	2032	0.319	0.2316	Yes
24	Gsr	2190	0.305	0.2317	Yes
25	Ptk2	2277	0.300	0.2359	Yes
26	Cdkn1b	2553	0.278	0.2280	Yes
27	Pea15a	2581	0.275	0.2351	Yes
28	Sptan1	2687	0.267	0.2371	Yes
29	Lgals3	2835	0.257	0.2364	Yes
30	Sc5d	2913	0.252	0.2396	Yes
31	Bnip3l	3002	0.246	0.2420	Yes
32	Casp3	3058	0.241	0.2463	Yes
33	App	3059	0.241	0.2539	Yes
34	Etf1	3141	0.237	0.2564	Yes
35	Dffa	3219	0.232	0.2591	Yes
36	Madd	3303	0.226	0.2612	Yes
37	Casp6	3467	0.216	0.2581	No
38	Rnasel	3722	0.201	0.2491	No
39	Add1	3811	0.197	0.2500	No
40	Il6	4054	0.182	0.2411	No
41	Hmox1	4066	0.182	0.2462	No
42	Smad7	4253	0.170	0.2403	No
43	Igf2r	4312	0.169	0.2421	No
44	Cyld	4379	0.166	0.2433	No
45	Cflar	4563	0.155	0.2372	No
46	Satb1	4565	0.155	0.2420	No
47	Jun	4674	0.151	0.2402	No
48	Ppp3r1	4716	0.148	0.2424	No
49	Dnaja1	4864	0.140	0.2379	No
50	Gna15	4879	0.139	0.2415	No
51	Bik	5121	0.128	0.2309	No
52	Gpx4	5213	0.124	0.2293	No
53	Cdkn1a	5296	0.119	0.2281	No
54	Ifitm3	5306	0.118	0.2313	No
55	Pdcd4	5337	0.117	0.2331	No
56	Tnfrsf12a	5395	0.113	0.2333	No
57	Wee1	5400	0.113	0.2366	No
58	Anxa1	5610	0.102	0.2272	No
59	H1f0	5636	0.100	0.2288	No
60	Pmaip1	5677	0.099	0.2295	No
61	Casp4	5681	0.098	0.2324	No
62	Gpx1	5717	0.097	0.2334	No
63	Plcb2	5868	0.090	0.2271	No
64	Timp2	6077	0.080	0.2171	No
65	Bcap31	6094	0.079	0.2186	No
66	Pak1	6183	0.076	0.2157	No
67	Cdk2	6313	0.071	0.2102	No
68	Mmp2	6323	0.071	0.2118	No
69	Slc20a1	6562	0.059	0.1993	No
70	Sod2	6633	0.055	0.1968	No
71	Crebbp	6715	0.051	0.1935	No
72	Rock1	6854	0.045	0.1866	No
73	Tap1	7032	0.037	0.1771	No
74	Fdxr	7112	0.033	0.1733	No
75	Erbb3	7316	0.024	0.1618	No
76	Lef1	7329	0.023	0.1619	No
77	Ctnnb1	7606	0.012	0.1456	No
78	Nefh	7765	0.004	0.1362	No
79	Gadd45a	7826	0.002	0.1326	No
80	Birc3	7858	0.001	0.1307	No
81	Cth	7998	-0.005	0.1225	No
82	Ddit3	8041	-0.006	0.1202	No
83	Sat1	8405	-0.024	0.0990	No
84	Gadd45b	9079	-0.055	0.0601	No
85	Dnm1l	9087	-0.055	0.0614	No
86	Tnfsf10	9126	-0.057	0.0609	No
87	Brca1	9154	-0.058	0.0611	No
88	Xiap	9267	-0.063	0.0563	No
89	Rara	9276	-0.063	0.0578	No
90	Bcl10	9614	-0.078	0.0399	No
91	Tspo	9676	-0.080	0.0388	No
92	Psen1	9827	-0.087	0.0325	No
93	Casp1	10006	-0.095	0.0247	No
94	Irf1	10075	-0.097	0.0236	No
95	Hmgb2	10098	-0.098	0.0254	No
96	Sqstm1	10238	-0.104	0.0203	No
97	Ier3	10521	-0.118	0.0069	No
98	Vdac2	10649	-0.124	0.0032	No
99	Casp2	10874	-0.134	-0.0061	No
100	Ppp2r5b	11365	-0.158	-0.0308	No
101	Ifngr1	11474	-0.164	-0.0321	No
102	Top2a	11594	-0.171	-0.0339	No
103	Bcl2l2	11764	-0.180	-0.0385	No
104	Rhot2	11801	-0.181	-0.0350	No
105	Bgn	11874	-0.184	-0.0335	No
106	Ccnd2	11920	-0.187	-0.0304	No
107	Casp8	12652	-0.226	-0.0674	No
108	Tnf	12702	-0.229	-0.0632	No
109	Mgmt	12706	-0.229	-0.0561	No
110	Bax	12863	-0.240	-0.0580	No
111	Krt18	12897	-0.242	-0.0524	No
112	Ank	12932	-0.245	-0.0468	No
113	Casp7	13132	-0.256	-0.0507	No
114	Pdgfrb	13409	-0.274	-0.0588	No
115	Ebp	13486	-0.279	-0.0546	No
116	Lmna	13512	-0.281	-0.0473	No
117	Dap	13583	-0.287	-0.0425	No
118	Bcl2l11	13643	-0.291	-0.0369	No
119	Ppt1	13833	-0.305	-0.0387	No
120	Casp9	13835	-0.305	-0.0292	No
121	Rela	14105	-0.328	-0.0351	No
122	Gpx3	14111	-0.328	-0.0251	No
123	Dap3	14363	-0.351	-0.0292	No
124	Timp3	14654	-0.375	-0.0349	No
125	Gch1	14913	-0.397	-0.0380	No
126	Bid	15147	-0.423	-0.0388	No
127	F2r	15514	-0.468	-0.0462	No
128	Sod1	15636	-0.488	-0.0382	No
129	Tgfb2	15769	-0.512	-0.0300	No
130	Ccnd1	16155	-0.596	-0.0345	No
131	Cd44	16422	-0.703	-0.0285	No
132	Diablo	16425	-0.704	-0.0065	No
133	Bcl2l1	16465	-0.731	0.0141	No