Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group2_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group2_versus_Group3_repos
Upregulated in class	1
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.29135904
Normalized Enrichment Score (NES)	1.1698937
Nominal p-value	0.22264875
FDR q-value	0.67986655
FWER p-Value	0.949

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cdh4	99	0.748	0.0152	Yes
2	Cap1	148	0.695	0.0320	Yes
3	Actn3	184	0.669	0.0488	Yes
4	Itga10	202	0.653	0.0662	Yes
5	Nexn	264	0.618	0.0801	Yes
6	Myh10	381	0.575	0.0893	Yes
7	Vcam1	527	0.532	0.0956	Yes
8	Inppl1	528	0.532	0.1107	Yes
9	Cnn2	565	0.519	0.1232	Yes
10	Ctnna1	591	0.512	0.1362	Yes
11	Cldn15	680	0.494	0.1449	Yes
12	Tjp1	741	0.482	0.1549	Yes
13	Alox8	813	0.471	0.1639	Yes
14	Ywhah	820	0.470	0.1769	Yes
15	Arhgef6	1153	0.415	0.1686	Yes
16	Itgb1	1234	0.405	0.1752	Yes
17	Wnk4	1250	0.403	0.1857	Yes
18	Myh9	1353	0.392	0.1906	Yes
19	Cdk8	1456	0.378	0.1952	Yes
20	Plcg1	1601	0.363	0.1968	Yes
21	Vcl	1684	0.353	0.2018	Yes
22	Traf1	1734	0.347	0.2087	Yes
23	Tsc1	1960	0.326	0.2043	Yes
24	Actn2	1986	0.324	0.2120	Yes
25	Msn	2050	0.318	0.2172	Yes
26	Wasl	2135	0.310	0.2209	Yes
27	Pecam1	2147	0.309	0.2290	Yes
28	Ptk2	2277	0.300	0.2296	Yes
29	B4galt1	2374	0.291	0.2321	Yes
30	Src	2386	0.291	0.2397	Yes
31	Actn1	2432	0.287	0.2451	Yes
32	Layn	2433	0.287	0.2532	Yes
33	Cdh1	2448	0.287	0.2605	Yes
34	Akt3	2499	0.282	0.2654	Yes
35	Baiap2	2546	0.279	0.2706	Yes
36	Icam1	2615	0.272	0.2742	Yes
37	Actg1	2725	0.265	0.2751	Yes
38	Lima1	2817	0.259	0.2769	Yes
39	Mapk14	2879	0.254	0.2804	Yes
40	Amh	2953	0.249	0.2831	Yes
41	Lamb3	2987	0.247	0.2881	Yes
42	Sirpa	3047	0.242	0.2914	Yes
43	Icam5	3178	0.234	0.2901	No
44	Evl	3274	0.229	0.2909	No
45	Ikbkg	3479	0.216	0.2847	No
46	Nectin3	3664	0.203	0.2793	No
47	Hadh	3702	0.202	0.2828	No
48	Nf2	3939	0.190	0.2739	No
49	Map4k2	3981	0.187	0.2768	No
50	Cadm3	3993	0.186	0.2814	No
51	Zyx	4107	0.179	0.2796	No
52	Adam15	4218	0.173	0.2779	No
53	Sdc3	4223	0.172	0.2825	No
54	Rras	4268	0.169	0.2846	No
55	Amigo1	4432	0.164	0.2794	No
56	Nrtn	4488	0.160	0.2807	No
57	Shroom2	4503	0.160	0.2843	No
58	Jup	4557	0.156	0.2855	No
59	Tmem8b	4653	0.152	0.2841	No
60	Rasa1	4809	0.143	0.2788	No
61	Vasp	5114	0.129	0.2641	No
62	Mvd	5268	0.120	0.2582	No
63	Sorbs3	5383	0.114	0.2546	No
64	Nectin4	5478	0.109	0.2520	No
65	Myl12b	5521	0.107	0.2525	No
66	Col16a1	5552	0.105	0.2537	No
67	Gtf2f1	5586	0.103	0.2546	No
68	Dhx16	5765	0.095	0.2465	No
69	Mmp2	6323	0.071	0.2149	No
70	Stx4a	6637	0.055	0.1975	No
71	Adamts5	6707	0.052	0.1948	No
72	Rsu1	6742	0.050	0.1942	No
73	Pten	6829	0.046	0.1903	No
74	Tial1	6842	0.045	0.1908	No
75	Nectin1	6886	0.043	0.1895	No
76	Ctnnd1	6981	0.039	0.1849	No
77	Itgb4	7004	0.038	0.1846	No
78	Jam3	7069	0.035	0.1818	No
79	Hras	7241	0.027	0.1722	No
80	Epb41l2	7280	0.026	0.1707	No
81	Skap2	7282	0.026	0.1713	No
82	Dlg1	7297	0.025	0.1712	No
83	Itga2	7376	0.021	0.1671	No
84	Actb	7428	0.019	0.1646	No
85	Vwf	7838	0.001	0.1399	No
86	Thy1	7849	0.001	0.1393	No
87	Sgce	8198	-0.014	0.1187	No
88	Adam9	8245	-0.016	0.1164	No
89	Shc1	8316	-0.019	0.1127	No
90	Cd274	8330	-0.020	0.1125	No
91	Sympk	8581	-0.031	0.0983	No
92	Fbn1	8675	-0.036	0.0937	No
93	Crat	8835	-0.044	0.0853	No
94	Ptprc	8848	-0.045	0.0858	No
95	Pals1	8963	-0.049	0.0803	No
96	Taok2	8984	-0.050	0.0806	No
97	Pbx2	9113	-0.057	0.0744	No
98	Cd86	9140	-0.058	0.0745	No
99	Gnai2	9185	-0.060	0.0735	No
100	Akt2	9225	-0.062	0.0729	No
101	Map3k20	9524	-0.073	0.0570	No
102	Icam4	9533	-0.073	0.0586	No
103	Tgfbi	9678	-0.080	0.0522	No
104	Rhof	9739	-0.083	0.0509	No
105	Cd34	9946	-0.092	0.0410	No
106	Amigo2	9986	-0.094	0.0413	No
107	Ldlrap1	10254	-0.104	0.0282	No
108	Mapk11	10370	-0.111	0.0243	No
109	Arpc2	10477	-0.116	0.0212	No
110	Exoc4	10814	-0.131	0.0046	No
111	Thbs3	11466	-0.163	-0.0301	No
112	Mpzl1	11843	-0.183	-0.0476	No
113	Nf1	11886	-0.185	-0.0449	No
114	Vcan	11935	-0.188	-0.0425	No
115	Pik3r3	11948	-0.188	-0.0379	No
116	Pkd1	12076	-0.195	-0.0400	No
117	Pik3cb	12480	-0.217	-0.0582	No
118	Actn4	12602	-0.223	-0.0592	No
119	Pfn1	12849	-0.239	-0.0673	No
120	Icam2	12867	-0.240	-0.0616	No
121	Syk	12940	-0.245	-0.0590	No
122	Tspan4	13184	-0.260	-0.0663	No
123	Tubg1	13260	-0.264	-0.0633	No
124	Cdh11	13566	-0.286	-0.0737	No
125	Slit2	14024	-0.320	-0.0922	No
126	Cercam	14307	-0.346	-0.0994	No
127	Atp1a3	14557	-0.368	-0.1041	No
128	Vav2	14837	-0.389	-0.1099	No
129	Nrap	14972	-0.403	-0.1066	No
130	Insig1	15207	-0.430	-0.1085	No
131	Pard6g	15263	-0.437	-0.0995	No
132	Nlgn2	15274	-0.438	-0.0877	No
133	Cadm2	15360	-0.450	-0.0801	No
134	Lama3	15414	-0.455	-0.0704	No
135	Gamt	15513	-0.467	-0.0631	No
136	Rac2	15709	-0.502	-0.0606	No
137	Kcnh2	15751	-0.508	-0.0487	No
138	Nectin2	15820	-0.521	-0.0381	No
139	Itga9	15852	-0.526	-0.0251	No
140	Bmp1	15995	-0.556	-0.0179	No
141	Cdh3	16279	-0.635	-0.0170	No
142	Cd276	16438	-0.710	-0.0065	No
143	Nlgn3	16541	-0.783	0.0095	No