Details for gene set HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB
Enrichment Score (ES)	0.29653043
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3393884
Nominal p-value	0.036217302
FDR q-value	0.43256447
FWER p-Value	0.741

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ppp1r15a	56	0.846	0.0164	Yes
2	Dusp1	86	0.795	0.0333	Yes
3	Btg1	88	0.793	0.0518	Yes
4	Gpr183	94	0.779	0.0697	Yes
5	Ehd1	209	0.663	0.0783	Yes
6	Fosb	212	0.661	0.0937	Yes
7	Fosl2	214	0.660	0.1091	Yes
8	Rhob	235	0.651	0.1231	Yes
9	Csf1	279	0.628	0.1353	Yes
10	Fos	355	0.590	0.1446	Yes
11	Trip10	417	0.570	0.1542	Yes
12	Btg3	500	0.546	0.1621	Yes
13	Junb	553	0.529	0.1713	Yes
14	Klf6	818	0.467	0.1663	Yes
15	Nr4a1	822	0.466	0.1770	Yes
16	Ptgs2	906	0.455	0.1827	Yes
17	Jun	933	0.451	0.1917	Yes
18	Trib1	994	0.439	0.1983	Yes
19	Cebpd	1152	0.416	0.1986	Yes
20	Il18	1280	0.402	0.2003	Yes
21	Nfil3	1285	0.401	0.2094	Yes
22	Klf4	1288	0.400	0.2187	Yes
23	Cd69	1388	0.388	0.2218	Yes
24	Klf10	1394	0.388	0.2306	Yes
25	Plek	1400	0.388	0.2394	Yes
26	Sgk1	1414	0.386	0.2476	Yes
27	Yrdc	1468	0.380	0.2533	Yes
28	Gem	1512	0.377	0.2596	Yes
29	Atp2b1	1565	0.370	0.2651	Yes
30	Ldlr	1925	0.335	0.2512	Yes
31	Dnajb4	1972	0.331	0.2562	Yes
32	Rigi	2171	0.314	0.2516	Yes
33	Olr1	2228	0.310	0.2555	Yes
34	Tsc22d1	2237	0.309	0.2622	Yes
35	Tnfaip3	2271	0.306	0.2674	Yes
36	Id2	2383	0.297	0.2677	Yes
37	Litaf	2456	0.293	0.2701	Yes
38	Jag1	2539	0.285	0.2719	Yes
39	B4galt5	2731	0.272	0.2667	Yes
40	Cebpb	2815	0.267	0.2679	Yes
41	Sat1	2941	0.255	0.2664	Yes
42	Mcl1	2967	0.253	0.2708	Yes
43	Btg2	2976	0.253	0.2762	Yes
44	Ccnl1	3127	0.241	0.2728	Yes
45	Rnf19b	3165	0.239	0.2762	Yes
46	Hbegf	3255	0.233	0.2763	Yes
47	Traf1	3264	0.233	0.2812	Yes
48	Cflar	3291	0.231	0.2851	Yes
49	Ier2	3294	0.231	0.2904	Yes
50	Ripk2	3295	0.231	0.2958	Yes
51	B4galt1	3491	0.218	0.2891	Yes
52	Fosl1	3504	0.217	0.2934	Yes
53	Ninj1	3537	0.215	0.2965	Yes
54	Tnfrsf9	3625	0.209	0.2962	No
55	Tnip2	4018	0.187	0.2769	No
56	Bcl6	4116	0.180	0.2752	No
57	Klf9	4621	0.153	0.2483	No
58	Vegfa	4832	0.141	0.2389	No
59	Ier5	5056	0.129	0.2285	No
60	Pfkfb3	5124	0.125	0.2274	No
61	Tank	5147	0.124	0.2290	No
62	Slc16a6	5253	0.118	0.2254	No
63	Smad3	5273	0.117	0.2270	No
64	Tnip1	5297	0.116	0.2283	No
65	Dennd5a	5396	0.113	0.2250	No
66	Cdkn1a	5671	0.099	0.2108	No
67	Zc3h12a	5755	0.095	0.2080	No
68	Panx1	5932	0.087	0.1994	No
69	Sphk1	6101	0.078	0.1911	No
70	Nfe2l2	6346	0.065	0.1778	No
71	Marcks	6354	0.065	0.1790	No
72	Icosl	6492	0.058	0.1720	No
73	Nr4a2	6566	0.054	0.1689	No
74	Egr1	6582	0.053	0.1692	No
75	Il6	6691	0.048	0.1638	No
76	Kdm6b	6816	0.042	0.1573	No
77	Il7r	6828	0.042	0.1576	No
78	Bhlhe40	6841	0.041	0.1578	No
79	Slc2a3	6865	0.039	0.1574	No
80	Ier3	6875	0.039	0.1577	No
81	Birc2	7151	0.025	0.1417	No
82	Rcan1	7242	0.021	0.1368	No
83	Dusp5	7280	0.019	0.1350	No
84	Myc	7501	0.009	0.1219	No
85	Map2k3	7599	0.005	0.1161	No
86	Gfpt2	7853	-0.004	0.1009	No
87	Abca1	7954	-0.008	0.0951	No
88	Irs2	8368	-0.029	0.0708	No
89	Snn	8385	-0.029	0.0705	No
90	Irf1	8428	-0.031	0.0687	No
91	Tnfaip8	8456	-0.033	0.0679	No
92	Gch1	8532	-0.036	0.0642	No
93	Per1	8997	-0.058	0.0375	No
94	Tiparp	9001	-0.058	0.0387	No
95	Cd80	9126	-0.064	0.0327	No
96	Zbtb10	9283	-0.072	0.0249	No
97	Tap1	9292	-0.073	0.0261	No
98	Il15ra	9332	-0.075	0.0255	No
99	Rela	9358	-0.076	0.0258	No
100	Ifih1	9602	-0.088	0.0132	No
101	Pnrc1	9619	-0.088	0.0143	No
102	Dram1	9830	-0.100	0.0039	No
103	Birc3	9965	-0.106	-0.0017	No
104	Nfkb1	10110	-0.114	-0.0077	No
105	Lamb3	10267	-0.121	-0.0143	No
106	Slc2a6	10304	-0.123	-0.0136	No
107	Pdlim5	10311	-0.123	-0.0111	No
108	Pmepa1	10682	-0.141	-0.0301	No
109	Sod2	10706	-0.143	-0.0282	No
110	Ptpre	10800	-0.149	-0.0303	No
111	Mxd1	10871	-0.152	-0.0310	No
112	Ets2	10948	-0.157	-0.0319	No
113	Clcf1	11058	-0.164	-0.0346	No
114	Nfkb2	11535	-0.189	-0.0590	No
115	Relb	11566	-0.190	-0.0564	No
116	Plaur	11578	-0.191	-0.0526	No
117	Pde4b	11868	-0.206	-0.0652	No
118	Nfat5	12083	-0.219	-0.0730	No
119	Socs3	12239	-0.228	-0.0770	No
120	Ifngr2	12269	-0.230	-0.0734	No
121	Nfkbia	12665	-0.249	-0.0914	No
122	Klf2	12798	-0.258	-0.0934	No
123	Ptger4	12995	-0.268	-0.0989	No
124	Gadd45b	13143	-0.278	-0.1013	No
125	Zfp36	13218	-0.284	-0.0991	No
126	Tubb2a	13220	-0.284	-0.0925	No
127	Map3k8	13264	-0.287	-0.0884	No
128	Tgif1	13645	-0.316	-0.1040	No
129	Sqstm1	13689	-0.321	-0.0991	No
130	Nfkbie	13800	-0.330	-0.0980	No
131	Serpinb2	13815	-0.330	-0.0911	No
132	Rel	13870	-0.334	-0.0865	No
133	Dusp2	14175	-0.361	-0.0965	No
134	Cd44	14387	-0.382	-0.1003	No
135	Eif1	14431	-0.386	-0.0938	No
136	Fut4	14563	-0.398	-0.0924	No
137	Phlda1	14638	-0.407	-0.0874	No
138	Ifit2	14894	-0.434	-0.0926	No
139	Ccrl2	14927	-0.437	-0.0843	No
140	Bcl3	15026	-0.449	-0.0797	No
141	Icam1	15183	-0.466	-0.0782	No
142	Tnf	15307	-0.481	-0.0744	No
143	Il6st	15586	-0.522	-0.0790	No
144	Nampt	15653	-0.534	-0.0704	No
145	Ccnd1	15695	-0.543	-0.0602	No
146	Stat5a	15855	-0.577	-0.0563	No
147	Spsb1	16111	-0.648	-0.0565	No
148	Tnfsf9	16157	-0.658	-0.0439	No
149	Gadd45a	16193	-0.669	-0.0303	No
150	Tnfaip2	16213	-0.674	-0.0157	No
151	Maff	16247	-0.689	-0.0015	No
152	Tlr2	16684	-1.228	0.0009	No