Details for gene set HALLMARK_P53

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_P53_PATHWAY
Enrichment Score (ES)	0.19104229
Normalized Enrichment Score (NES)	0.82072514
Nominal p-value	0.85991377
FDR q-value	0.81492716
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Ppp1r15a	56	0.846	0.0143	Yes
2	Btg1	88	0.793	0.0290	Yes
3	Plk3	148	0.709	0.0403	Yes
4	H2ac25	228	0.655	0.0493	Yes
5	Wwp1	311	0.610	0.0571	Yes
6	Apaf1	321	0.608	0.0693	Yes
7	Fos	355	0.590	0.0796	Yes
8	Nudt15	433	0.565	0.0868	Yes
9	Sfn	468	0.553	0.0963	Yes
10	Phlda3	591	0.521	0.0998	Yes
11	Slc7a11	598	0.519	0.1104	Yes
12	Notch1	711	0.488	0.1138	Yes
13	Slc3a2	819	0.467	0.1171	Yes
14	Jun	933	0.451	0.1197	Yes
15	Cyfip2	973	0.444	0.1266	Yes
16	Tspyl2	1030	0.435	0.1324	Yes
17	Cdkn2a	1072	0.427	0.1388	Yes
18	Itgb4	1209	0.411	0.1392	Yes
19	Rb1	1250	0.405	0.1453	Yes
20	Xpc	1263	0.404	0.1530	Yes
21	Hexim1	1264	0.404	0.1614	Yes
22	Klf4	1288	0.400	0.1684	Yes
23	Sp1	1555	0.372	0.1601	Yes
24	Txnip	1607	0.366	0.1647	Yes
25	Baiap2	1849	0.341	0.1573	Yes
26	Slc35d1	1999	0.329	0.1551	Yes
27	Cd82	2187	0.313	0.1504	Yes
28	Tsc22d1	2237	0.309	0.1539	Yes
29	Hdac3	2342	0.300	0.1539	Yes
30	Pcna	2382	0.297	0.1577	Yes
31	Fdxr	2461	0.292	0.1591	Yes
32	Mapkapk3	2614	0.281	0.1558	Yes
33	Rab40c	2626	0.280	0.1610	Yes
34	Ppm1d	2672	0.276	0.1641	Yes
35	Procr	2766	0.270	0.1641	Yes
36	Csrnp2	2813	0.267	0.1669	Yes
37	Cebpa	2866	0.262	0.1693	Yes
38	Ccp110	2902	0.258	0.1725	Yes
39	Aen	2929	0.256	0.1763	Yes
40	Sat1	2941	0.255	0.1810	Yes
41	Btg2	2976	0.253	0.1842	Yes
42	H1f2	3069	0.245	0.1838	Yes
43	Fgf13	3159	0.240	0.1834	Yes
44	Rnf19b	3165	0.239	0.1881	Yes
45	Hbegf	3255	0.233	0.1876	Yes
46	Rad9a	3288	0.231	0.1906	Yes
47	Trafd1	3359	0.226	0.1910	Yes
48	Ninj1	3537	0.215	0.1848	No
49	Alox8	3612	0.210	0.1847	No
50	Ddit4	3648	0.208	0.1870	No
51	Zbtb16	3829	0.198	0.1802	No
52	Dgka	3943	0.191	0.1774	No
53	Abat	3944	0.191	0.1814	No
54	Casp1	3998	0.188	0.1821	No
55	Rhbdf2	4019	0.187	0.1848	No
56	Pmm1	4036	0.186	0.1877	No
57	Cdk5r1	4107	0.181	0.1873	No
58	Ei24	4240	0.174	0.1829	No
59	Ada	4306	0.170	0.1826	No
60	Polh	4400	0.164	0.1804	No
61	Mdm2	4501	0.159	0.1777	No
62	Retsat	4558	0.156	0.1776	No
63	Tcn2	4620	0.153	0.1771	No
64	St14	4702	0.148	0.1753	No
65	Ccng1	4793	0.143	0.1728	No
66	Foxo3	4999	0.133	0.1632	No
67	Ier5	5056	0.129	0.1625	No
68	Ctsf	5184	0.122	0.1574	No
69	Cdkn1a	5671	0.099	0.1300	No
70	Cdh13	5947	0.086	0.1152	No
71	Ldhb	6040	0.081	0.1113	No
72	Sphk1	6101	0.078	0.1093	No
73	Rad51c	6118	0.077	0.1100	No
74	Rxra	6204	0.073	0.1064	No
75	Kif13b	6217	0.072	0.1072	No
76	Triap1	6486	0.058	0.0921	No
77	Cdkn2aip	6679	0.049	0.0815	No
78	Pom121	6762	0.045	0.0775	No
79	Perp	6790	0.043	0.0768	No
80	Rrp8	6831	0.041	0.0752	No
81	Ier3	6875	0.039	0.0734	No
82	Fas	6893	0.038	0.0732	No
83	Jag2	7319	0.017	0.0478	No
84	App	7321	0.017	0.0481	No
85	Sertad3	7322	0.017	0.0485	No
86	H2aj	7367	0.015	0.0461	No
87	Blcap	7480	0.010	0.0396	No
88	Cgrrf1	7488	0.010	0.0393	No
89	Hras	7520	0.008	0.0376	No
90	Hspa4l	7535	0.008	0.0370	No
91	Mknk2	7572	0.006	0.0349	No
92	Sesn1	7715	0.001	0.0263	No
93	Abcc5	8364	-0.028	-0.0123	No
94	Ak1	8439	-0.032	-0.0161	No
95	Pidd1	8648	-0.042	-0.0278	No
96	Tob1	9037	-0.059	-0.0500	No
97	Dnttip2	9087	-0.062	-0.0517	No
98	Sec61a1	9096	-0.063	-0.0509	No
99	Traf4	9147	-0.065	-0.0525	No
100	Irag2	9153	-0.065	-0.0515	No
101	Tap1	9292	-0.073	-0.0583	No
102	Prkab1	9335	-0.075	-0.0593	No
103	Ccnd3	9578	-0.087	-0.0721	No
104	Rchy1	9693	-0.092	-0.0771	No
105	Ddb2	9707	-0.093	-0.0759	No
106	Coq8a	9825	-0.099	-0.0809	No
107	Dram1	9830	-0.100	-0.0791	No
108	Rap2b	9955	-0.106	-0.0844	No
109	Rps27l	10078	-0.112	-0.0894	No
110	Rrad	10135	-0.115	-0.0904	No
111	Trp53	10157	-0.116	-0.0892	No
112	Tprkb	10231	-0.119	-0.0912	No
113	Fbxw7	10346	-0.125	-0.0954	No
114	Ccnk	10516	-0.133	-0.1029	No
115	Klk8	10753	-0.146	-0.1141	No
116	Mxd4	10760	-0.146	-0.1114	No
117	Bak1	10797	-0.149	-0.1105	No
118	Ptpre	10800	-0.149	-0.1075	No
119	Rpl18	10801	-0.149	-0.1044	No
120	Mxd1	10871	-0.152	-0.1054	No
121	Tgfa	11003	-0.160	-0.1099	No
122	Vwa5a	11097	-0.166	-0.1121	No
123	Pitpnc1	11171	-0.169	-0.1130	No
124	Tgfb1	11190	-0.170	-0.1105	No
125	Gm2a	11369	-0.179	-0.1175	No
126	Slc19a2	11385	-0.180	-0.1147	No
127	Zfp36l1	11692	-0.197	-0.1291	No
128	Acvr1b	11855	-0.205	-0.1346	No
129	Cd81	12002	-0.214	-0.1389	No
130	Elp1	12004	-0.214	-0.1345	No
131	Tax1bp3	12113	-0.220	-0.1364	No
132	Ctsd	12236	-0.228	-0.1390	No
133	Tpd52l1	12318	-0.232	-0.1391	No
134	Tm7sf3	12327	-0.232	-0.1347	No
135	Hint1	12675	-0.250	-0.1505	No
136	Abhd4	12702	-0.251	-0.1468	No
137	Def6	12785	-0.258	-0.1463	No
138	Zmat3	12795	-0.258	-0.1415	No
139	Nupr1	12966	-0.266	-0.1462	No
140	Hmox1	13340	-0.293	-0.1626	No
141	Vdr	13609	-0.314	-0.1723	No
142	Fuca1	13677	-0.319	-0.1696	No
143	Ercc5	13733	-0.325	-0.1662	No
144	Wrap73	13787	-0.329	-0.1625	No
145	Vamp8	13972	-0.343	-0.1664	No
146	Ip6k2	13985	-0.344	-0.1599	No
147	Ankra2	14211	-0.364	-0.1659	No
148	Irak1	14212	-0.365	-0.1583	No
149	Steap3	14261	-0.370	-0.1534	No
150	Pvt1	14280	-0.372	-0.1467	No
151	Fam162a	14311	-0.375	-0.1407	No
152	Plxnb2	14718	-0.417	-0.1565	No
153	Rack1	14770	-0.422	-0.1508	No
154	Prmt2	14823	-0.428	-0.1450	No
155	S100a10	14834	-0.429	-0.1366	No
156	Dcxr	14840	-0.430	-0.1279	No
157	Stom	14869	-0.432	-0.1206	No
158	Osgin1	14908	-0.436	-0.1137	No
159	Ndrg1	14958	-0.441	-0.1075	No
160	Rps12	15091	-0.455	-0.1059	No
161	Eps8l2	15113	-0.458	-0.0976	No
162	Ifi30	15128	-0.460	-0.0888	No
163	Ralgds	15174	-0.464	-0.0818	No
164	Socs1	15230	-0.471	-0.0753	No
165	Ddit3	15239	-0.472	-0.0659	No
166	Ccnd2	15493	-0.506	-0.0706	No
167	Gls2	15654	-0.534	-0.0691	No
168	Nol8	15960	-0.605	-0.0749	No
169	Ptpn14	16153	-0.657	-0.0727	No
170	Tnfsf9	16157	-0.658	-0.0591	No
171	Gadd45a	16193	-0.669	-0.0472	No
172	Upp1	16201	-0.671	-0.0336	No
173	Iscu	16230	-0.681	-0.0210	No
174	F2r	16232	-0.682	-0.0068	No
175	Rpl36	16519	-0.834	-0.0067	No
176	Bax	16524	-0.835	0.0106	No