Details for gene set HALLMARK_APICAL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group3_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group1_versus_Group3_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_APICAL_JUNCTION
Enrichment Score (ES)	0.18663979
Normalized Enrichment Score (NES)	0.8462343
Nominal p-value	0.807611
FDR q-value	0.81690264
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Cdh1	35	0.902	0.0231	Yes
2	Actn1	73	0.812	0.0435	Yes
3	Arhgef6	139	0.722	0.0597	Yes
4	Cap1	392	0.578	0.0606	Yes
5	Sirpa	445	0.561	0.0732	Yes
6	Msn	773	0.475	0.0667	Yes
7	Tmem8b	842	0.464	0.0755	Yes
8	Ctnna1	874	0.460	0.0865	Yes
9	Myh9	896	0.457	0.0980	Yes
10	Pecam1	937	0.450	0.1081	Yes
11	Vcan	1060	0.429	0.1127	Yes
12	Wasl	1068	0.427	0.1242	Yes
13	Myh10	1181	0.413	0.1290	Yes
14	Itgb4	1209	0.411	0.1388	Yes
15	Cadm3	1448	0.382	0.1351	Yes
16	Nlgn3	1552	0.373	0.1393	Yes
17	Vcam1	1575	0.369	0.1482	Yes
18	Nectin1	1599	0.367	0.1571	Yes
19	Shc1	1633	0.363	0.1652	Yes
20	Baiap2	1849	0.341	0.1618	Yes
21	Pik3cb	2154	0.316	0.1522	Yes
22	Ywhah	2181	0.313	0.1594	Yes
23	Itgb1	2363	0.299	0.1568	Yes
24	Itga2	2581	0.284	0.1516	Yes
25	Nf2	2677	0.276	0.1536	Yes
26	Cdh4	2742	0.272	0.1573	Yes
27	Col16a1	2762	0.270	0.1637	Yes
28	Gtf2f1	2881	0.260	0.1638	Yes
29	Map4k2	3178	0.239	0.1526	Yes
30	Inppl1	3231	0.234	0.1560	Yes
31	Traf1	3264	0.233	0.1606	Yes
32	Tsc1	3283	0.232	0.1659	Yes
33	Vcl	3293	0.231	0.1718	Yes
34	Sympk	3341	0.227	0.1753	Yes
35	B4galt1	3491	0.218	0.1724	Yes
36	Plcg1	3530	0.215	0.1761	Yes
37	Vasp	3577	0.213	0.1793	Yes
38	Alox8	3612	0.210	0.1831	Yes
39	Mvd	3650	0.207	0.1866	Yes
40	Pbx2	3811	0.199	0.1825	No
41	Thy1	3958	0.190	0.1790	No
42	Skap2	3983	0.189	0.1829	No
43	Ptk2	4065	0.184	0.1831	No
44	Wnk4	4243	0.174	0.1773	No
45	Atp1a3	4452	0.162	0.1692	No
46	Cldn15	4459	0.161	0.1734	No
47	Rac2	4517	0.159	0.1743	No
48	Actn3	4533	0.158	0.1779	No
49	Lima1	4560	0.156	0.1806	No
50	Crat	4762	0.145	0.1725	No
51	Akt2	4987	0.133	0.1627	No
52	Rras	5065	0.128	0.1617	No
53	Itga10	5422	0.112	0.1433	No
54	Sgce	5577	0.105	0.1369	No
55	Gnai2	5615	0.103	0.1375	No
56	Actg1	5624	0.102	0.1399	No
57	Ikbkg	5695	0.098	0.1384	No
58	Zyx	5730	0.096	0.1391	No
59	Shroom2	5788	0.093	0.1382	No
60	Src	6001	0.083	0.1277	No
61	Icam5	6031	0.082	0.1283	No
62	Exoc4	6102	0.078	0.1262	No
63	Rsu1	6122	0.077	0.1272	No
64	Jup	6206	0.073	0.1242	No
65	Myl12b	6257	0.070	0.1231	No
66	Jam3	6309	0.067	0.1219	No
67	Pals1	6375	0.064	0.1198	No
68	Pik3r3	6434	0.061	0.1180	No
69	Rasa1	6459	0.059	0.1182	No
70	Mapk14	6489	0.058	0.1180	No
71	Actn4	6521	0.056	0.1177	No
72	Nectin4	6540	0.055	0.1182	No
73	Hadh	6605	0.052	0.1158	No
74	Adam15	6680	0.048	0.1127	No
75	Dhx16	6978	0.033	0.0956	No
76	Tjp1	6980	0.033	0.0965	No
77	Fbn1	7113	0.027	0.0893	No
78	Taok2	7175	0.024	0.0863	No
79	Evl	7210	0.023	0.0849	No
80	Cadm2	7287	0.019	0.0808	No
81	Epb41l2	7430	0.012	0.0726	No
82	Hras	7520	0.008	0.0674	No
83	Cercam	7863	-0.004	0.0469	No
84	Tubg1	8015	-0.012	0.0381	No
85	Cd274	8059	-0.014	0.0359	No
86	Cnn2	8140	-0.018	0.0315	No
87	Ldlrap1	8165	-0.018	0.0306	No
88	Cdk8	8455	-0.033	0.0141	No
89	Insig1	8539	-0.036	0.0101	No
90	Pkd1	9020	-0.059	-0.0173	No
91	Vav2	9021	-0.059	-0.0157	No
92	Tial1	9242	-0.070	-0.0270	No
93	Nectin2	9376	-0.077	-0.0329	No
94	Nexn	9407	-0.079	-0.0325	No
95	Pten	9521	-0.084	-0.0369	No
96	Bmp1	9651	-0.090	-0.0422	No
97	Layn	9658	-0.090	-0.0401	No
98	Arpc2	9983	-0.107	-0.0566	No
99	Dlg1	10019	-0.109	-0.0557	No
100	Syk	10107	-0.114	-0.0578	No
101	Ctnnd1	10116	-0.115	-0.0551	No
102	Lamb3	10267	-0.121	-0.0608	No
103	Mmp2	10399	-0.128	-0.0651	No
104	Actb	10427	-0.129	-0.0631	No
105	Nlgn2	10693	-0.142	-0.0751	No
106	Akt3	10792	-0.148	-0.0769	No
107	Tgfbi	11008	-0.160	-0.0854	No
108	Thbs3	11016	-0.161	-0.0814	No
109	Ptprc	11601	-0.192	-0.1113	No
110	Adam9	11776	-0.201	-0.1162	No
111	Nrap	11872	-0.206	-0.1162	No
112	Icam2	12064	-0.218	-0.1216	No
113	Nrtn	12112	-0.220	-0.1183	No
114	Gamt	12222	-0.227	-0.1186	No
115	Actn2	12654	-0.248	-0.1377	No
116	Map3k20	12739	-0.255	-0.1356	No
117	Pfn1	12982	-0.267	-0.1428	No
118	Sdc3	12991	-0.268	-0.1358	No
119	Amh	13012	-0.269	-0.1295	No
120	Adamts5	13028	-0.270	-0.1229	No
121	Amigo1	13573	-0.311	-0.1470	No
122	Nf1	13575	-0.311	-0.1384	No
123	Stx4a	13584	-0.312	-0.1302	No
124	Icam4	13871	-0.334	-0.1382	No
125	Amigo2	14317	-0.375	-0.1546	No
126	Sorbs3	14327	-0.376	-0.1446	No
127	Kcnh2	14424	-0.386	-0.1397	No
128	Cdh11	14636	-0.407	-0.1410	No
129	Vwf	15166	-0.463	-0.1601	No
130	Icam1	15183	-0.466	-0.1480	No
131	Tspan4	15312	-0.482	-0.1423	No
132	Lama3	15438	-0.498	-0.1360	No
133	Rhof	15489	-0.506	-0.1249	No
134	Pard6g	15556	-0.516	-0.1145	No
135	Cd86	15950	-0.601	-0.1214	No
136	Cd34	15951	-0.601	-0.1047	No
137	Mpzl1	15967	-0.606	-0.0886	No
138	Mapk11	16155	-0.658	-0.0816	No
139	Nectin3	16185	-0.665	-0.0648	No
140	Cdh3	16340	-0.718	-0.0540	No
141	Cd276	16457	-0.788	-0.0390	No
142	Slit2	16465	-0.791	-0.0174	No
143	Itga9	16676	-1.126	0.0014	No