Details for gene set HALLMARK_DNA

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Basophil.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group2.Basophil_Pheno.cls #Group1_versus_Group2_repos
Phenotype	Basophil_Pheno.cls#Group1_versus_Group2_repos
Upregulated in class	0
GeneSet	HALLMARK_DNA_REPAIR
Enrichment Score (ES)	0.19373095
Normalized Enrichment Score (NES)	0.77365845
Nominal p-value	0.73833674
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	SYMBOL	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	Pom121	87	0.758	0.0171	Yes
2	Taf1c	217	0.641	0.0283	Yes
3	Cant1	510	0.525	0.0261	Yes
4	Alyref	523	0.523	0.0409	Yes
5	Polr2i	551	0.515	0.0544	Yes
6	Zfp707	558	0.514	0.0693	Yes
7	Tarbp2	585	0.506	0.0826	Yes
8	Rad51	680	0.484	0.0912	Yes
9	Polr2g	744	0.472	0.1014	Yes
10	Rad52	777	0.467	0.1132	Yes
11	Brf2	897	0.448	0.1193	Yes
12	Snapc4	1146	0.410	0.1164	Yes
13	Snapc5	1337	0.388	0.1164	Yes
14	Aaas	1372	0.385	0.1257	Yes
15	Polr2j	1522	0.366	0.1275	Yes
16	Dgcr8	1684	0.351	0.1281	Yes
17	Pold3	1895	0.331	0.1252	Yes
18	Eloa	1908	0.330	0.1342	Yes
19	Eif1b	1914	0.329	0.1436	Yes
20	Nelfe	2115	0.312	0.1408	Yes
21	Surf1	2129	0.312	0.1492	Yes
22	Guk1	2181	0.308	0.1552	Yes
23	Tk2	2435	0.289	0.1485	Yes
24	Polh	2484	0.286	0.1540	Yes
25	Smad5	2753	0.269	0.1458	Yes
26	Ell	2763	0.269	0.1532	Yes
27	Pcna	2826	0.263	0.1572	Yes
28	Polr2d	3295	0.235	0.1359	Yes
29	Upf3b	3344	0.233	0.1399	Yes
30	Polr3c	3379	0.231	0.1447	Yes
31	Adcy6	3407	0.230	0.1498	Yes
32	Polr2a	3479	0.225	0.1522	Yes
33	Ercc4	3487	0.224	0.1584	Yes
34	Pde4b	3606	0.216	0.1576	Yes
35	Bcap31	3634	0.215	0.1623	Yes
36	Edf1	3694	0.211	0.1650	Yes
37	Xpc	3708	0.210	0.1704	Yes
38	Rfc4	3721	0.209	0.1759	Yes
39	Rfc2	3843	0.203	0.1746	Yes
40	Umps	3959	0.197	0.1734	Yes
41	Usp11	3967	0.196	0.1788	Yes
42	Nelfcd	4028	0.192	0.1809	Yes
43	Polr2k	4121	0.187	0.1808	Yes
44	Dut	4129	0.186	0.1859	Yes
45	Pold1	4132	0.186	0.1913	Yes
46	Nudt21	4250	0.180	0.1896	Yes
47	Ada	4306	0.178	0.1915	Yes
48	Gmpr2	4432	0.169	0.1889	Yes
49	Gtf2f1	4677	0.157	0.1788	Yes
50	Ago4	4679	0.157	0.1834	Yes
51	Hcls1	4688	0.156	0.1875	Yes
52	Trp53	4730	0.154	0.1896	Yes
53	Rala	4808	0.150	0.1894	Yes
54	Rfc5	4810	0.150	0.1937	Yes
55	Pola1	4883	0.146	0.1937	No
56	Gtf2h1	4959	0.142	0.1934	No
57	Sdcbp	5089	0.137	0.1896	No
58	Supt4a	5175	0.132	0.1884	No
59	Pola2	5240	0.129	0.1883	No
60	Cetn2	5498	0.117	0.1763	No
61	Stx3	5503	0.117	0.1795	No
62	Tsg101	5874	0.101	0.1601	No
63	Polr2e	5952	0.098	0.1584	No
64	Tyms	6054	0.092	0.1550	No
65	Impdh2	6068	0.092	0.1569	No
66	Taf6	6142	0.089	0.1551	No
67	Adrm1	6348	0.080	0.1451	No
68	Vps28	6413	0.077	0.1435	No
69	Poll	6414	0.077	0.1458	No
70	Fen1	6460	0.075	0.1453	No
71	Ncbp2	6489	0.074	0.1458	No
72	Rev3l	6501	0.074	0.1473	No
73	Dad1	6569	0.071	0.1454	No
74	Pold4	6584	0.071	0.1466	No
75	Rae1	6801	0.061	0.1354	No
76	Polr1d	7071	0.047	0.1205	No
77	Srsf6	7179	0.043	0.1154	No
78	Nme4	7281	0.040	0.1104	No
79	Prim1	7534	0.029	0.0961	No
80	Polr2c	7576	0.027	0.0944	No
81	Ddb2	7595	0.027	0.0941	No
82	Pnp	7736	0.020	0.0862	No
83	Nt5c	7893	0.014	0.0772	No
84	Cstf3	8198	0.001	0.0589	No
85	Gtf2h3	8368	-0.004	0.0488	No
86	Nfx1	8779	-0.021	0.0247	No
87	Ercc8	8904	-0.026	0.0180	No
88	Polr2f	9038	-0.032	0.0109	No
89	Sf3a3	9579	-0.058	-0.0200	No
90	Nme1	9613	-0.059	-0.0203	No
91	Ercc3	9866	-0.072	-0.0334	No
92	Taf12	10229	-0.088	-0.0526	No
93	Rpa2	10246	-0.089	-0.0510	No
94	Gtf2a2	10313	-0.092	-0.0522	No
95	Ssrp1	10511	-0.102	-0.0611	No
96	Dctn4	10517	-0.102	-0.0584	No
97	Rpa3	10731	-0.112	-0.0679	No
98	Cox17	10910	-0.119	-0.0752	No
99	Vps37b	11100	-0.129	-0.0828	No
100	Rnmt	11227	-0.136	-0.0864	No
101	Polr2h	11300	-0.140	-0.0866	No
102	Gtf3c5	11310	-0.140	-0.0830	No
103	Mpc2	11315	-0.140	-0.0791	No
104	Taf10	11390	-0.144	-0.0793	No
105	Cmpk2	11450	-0.148	-0.0785	No
106	Sec61a1	11488	-0.149	-0.0763	No
107	Polb	11529	-0.152	-0.0743	No
108	Ak1	11655	-0.158	-0.0772	No
109	Polr1h	11792	-0.165	-0.0805	No
110	Ddb1	11828	-0.167	-0.0777	No
111	Ak3	11926	-0.170	-0.0785	No
112	Arl6ip1	11945	-0.171	-0.0746	No
113	Dguok	12046	-0.177	-0.0754	No
114	Ercc2	12070	-0.179	-0.0715	No
115	Zwint	12076	-0.179	-0.0665	No
116	Lig1	12334	-0.193	-0.0763	No
117	Nelfb	12775	-0.218	-0.0964	No
118	Mrpl40	12789	-0.219	-0.0907	No
119	Mpg	12809	-0.220	-0.0854	No
120	Clp1	12922	-0.227	-0.0854	No
121	Supt5	12965	-0.231	-0.0812	No
122	Gpx4	13026	-0.233	-0.0779	No
123	Polr1c	13059	-0.236	-0.0729	No
124	Polr3gl	13287	-0.251	-0.0792	No
125	Nt5c3	13466	-0.265	-0.0821	No
126	Itpa	13575	-0.273	-0.0805	No
127	Nudt9	13634	-0.277	-0.0759	No
128	Npr2	13858	-0.292	-0.0807	No
129	Rbx1	14427	-0.336	-0.1051	No
130	Rfc3	14753	-0.363	-0.1140	No
131	Rrm2b	15216	-0.411	-0.1298	No
132	Gtf2h5	15490	-0.449	-0.1330	No
133	Ercc5	15546	-0.457	-0.1228	No
134	Taf9	15656	-0.474	-0.1154	No
135	Gtf2b	15719	-0.481	-0.1049	No
136	Pde6g	16140	-0.569	-0.1135	No
137	Taf13	16239	-0.603	-0.1016	No
138	Gsdme	16380	-0.650	-0.0909	No
139	Sac3d1	16535	-0.744	-0.0782	No
140	Ercc1	16557	-0.763	-0.0569	No
141	Pole4	16558	-0.763	-0.0344	No
142	Aprt	16698	-1.451	0.0001	No