Database and Motifs High-scoring Motif Occurences Debugging Information Results in TSV Format Results in GFF3 Format



FIMO - Motif search tool

FIMO version 5.4.1, (Release date: Sat Aug 21 19:23:23 2021 -0700)

For further information on how to interpret these results please access https://meme-suite.org/meme/doc/fimo-output-format.html.
To get a copy of the FIMO software please access https://meme-suite.org

If you use FIMO in your research, please cite the following paper:
Charles E. Grant, Timothy L. Bailey, and William Stafford Noble, "FIMO: Scanning for occurrences of a given motif", Bioinformatics, 27(7):1017-1018, 2011. [full text]


DATABASE AND MOTIFS

DATABASE /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks.fasta
Database contains 15721 sequences, 8350465 residues

MOTIFS /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/meme_out/meme.xml (DNA)

MOTIF WIDTH BEST POSSIBLE MATCH
WAMWAAAAAWAMAAAAAHWW 20 TACAAAAAATAAAAAAAAAA
GTAATCCCAGCWMYTYGGGA 20 GTAATCCCAGCACTTTGGGA
CTCGAMCTCCTGRSCTCAAG 20 CTCGAACTCCTGACCTCAAG
AACATGGTGAAACCCCRTCT 20 AACATGGTGAAACCCCGTCT
AGGCRTGMGCCACCRYGCCC 20 AGGCGTGAGCCACCACGCCC
ATYCTCCYGCCTCRGC 16 ATCCTCCTGCCTCAGC
TTGCAGTGAGCCGAGATCRY 20 TTGCAGTGAGCCGAGATCGC
CSCCGCCGCCGCCGCC 16 CGCCGCCGCCGCCGCC
GCCACTGCACTCCAGCCTGG 20 GCCACTGCACTCCAGCCTGG
CCSBSCBCSBCCYCCBCCCC 20 CCCGCCTCGGCCCCCTCCCC

Random model letter frequencies (/scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/background):
A 0.196 C 0.304 G 0.304 T 0.196


SECTION I: HIGH-SCORING MOTIF OCCURENCES

Motif ID Alt ID Sequence Name Strand Start End p-value q-value Matched Sequence
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443229 443244 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443232 443247 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443235 443250 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443238 443253 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443241 443256 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443244 443259 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443247 443262 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443250 443265 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443253 443268 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443256 443271 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443259 443274 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 443262 443277 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 913171 913186 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr10 - 931596 931611 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr10 - 931599 931614 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr12 - 991244 991259 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 + 1109234 1109249 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 + 1109237 1109252 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 1309704 1309719 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407621 1407636 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407624 1407639 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407627 1407642 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407630 1407645 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407633 1407648 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407636 1407651 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407639 1407654 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407642 1407657 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407645 1407660 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1407757 1407772 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1567997 1568012 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1568000 1568015 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 1568097 1568112 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 1652411 1652426 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 + 1658933 1658948 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 + 1891015 1891030 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 + 1891018 1891033 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgcCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 2164032 2164047 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 2164035 2164050 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 2337550 2337565 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 2337553 2337568 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 2593590 2593605 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 2593593 2593608 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 2593596 2593611 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 2593599 2593614 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 2593602 2593617 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr4 + 3074946 3074961 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr4 + 3074949 3074964 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr4 + 3074952 3074967 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr20 + 3786512 3786527 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 3880141 3880156 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 3880303 3880318 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 3880404 3880419 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 3880484 3880499 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 3880505 3880520 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 + 4682462 4682477 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 - 4847531 4847546 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 5282376 5282391 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr9 + 5629198 5629213 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 - 6104980 6104995 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279822 6279837 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279825 6279840 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279828 6279843 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279831 6279846 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279884 6279899 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279887 6279902 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279890 6279905 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 6279893 6279908 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 - 6637520 6637535 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 + 6713469 6713484 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 + 6713472 6713487 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 + 6713843 6713858 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 + 6713846 6713861 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 + 6713849 6713864 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 + 6713852 6713867 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr6 + 7107673 7107688 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr6 + 7107676 7107691 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr6 + 7107679 7107694 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr6 + 7107682 7107697 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr6 + 7107685 7107700 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 7307666 7307681 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 - 7968828 7968843 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 - 7968831 7968846 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 - 7969479 7969494 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 - 8963361 8963376 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 - 8963364 8963379 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 - 8963367 8963382 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 - 8963370 8963385 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 8963568 8963583 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chrX + 9465130 9465145 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr18 + 9914599 9914614 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr2 + 10043623 10043638 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr2 - 10448293 10448308 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 10871612 10871627 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 10871615 10871630 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 10871618 10871633 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 10871621 10871636 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 - 11797192 11797207 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 11915674 11915689 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 11915677 11915692 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 11915680 11915695 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 11915683 11915698 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 11915686 11915701 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 11915689 11915704 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr6 + 12012447 12012462 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr10 - 13347782 13347797 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 14117628 14117643 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 14144904 14144919 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 14144907 14144922 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr3 - 14947612 14947627 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr4 - 15002485 15002500 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 15332503 15332518 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 15332506 15332521 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 15332509 15332524 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 15332512 15332527 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 + 15332515 15332530 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr21 + 15730362 15730377 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr21 + 15730365 15730380 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr21 + 15730368 15730383 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 + 15847965 15847980 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chrX - 15854723 15854738 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chrX - 15854726 15854741 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr3 + 15859581 15859596 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr3 + 15859584 15859599 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr3 + 15859587 15859602 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr3 + 15859590 15859605 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr3 + 15859593 15859608 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 15949611 15949626 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 15949614 15949629 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 15949617 15949632 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr4 + 16226555 16226570 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr4 + 16226558 16226573 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr4 + 16226634 16226649 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chrX - 16946875 16946890 5.27e-09 9.31e-05 CGCCGCCGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 + 17042811 17042826 5.27e-09 9.31e-05 cgccgccgccgccgcc
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CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr14 + 95157318 95157333 1.58e-08 0.000251 cgccgccgcccccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr10 - 125160272 125160287 1.58e-08 0.000251 CGCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr9 - 133121194 133121209 1.58e-08 0.000251 CGCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 140114289 140114304 1.58e-08 0.000251 CGCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 - 166839617 166839632 1.58e-08 0.000251 CGCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr2 - 224585170 224585185 1.58e-08 0.000251 CGCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr19 - 4969442 4969457 2.11e-08 0.000331 CCCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr2 - 9951328 9951343 2.11e-08 0.000331 CCCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 + 32891882 32891897 2.11e-08 0.000331 ccccgccgcccccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 + 42682606 42682621 2.11e-08 0.000331 ccccgccgcccccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr15 - 45167152 45167167 2.11e-08 0.000331 CCCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 64661889 64661904 2.11e-08 0.000331 CCCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 + 81927467 81927482 2.11e-08 0.000331 ccccgccgcccccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 82273283 82273298 2.11e-08 0.000331 CCCCGCCGCCCCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr9 + 93576671 93576686 2.11e-08 0.000331 ccccgccgcccccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr20 - 4015395 4015410 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 - 6105259 6105274 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr22 - 16601993 16602008 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 + 17206170 17206185 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr8 - 22441343 22441358 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr12 + 25250910 25250925 2.63e-08 0.000405 cgccgcggccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 + 35192970 35192985 2.63e-08 0.000405 cgccgcggccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr2 + 39120972 39120987 2.63e-08 0.000405 cgccgcggccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr18 + 51196777 51196792 2.63e-08 0.000405 cgccgcggccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr5 - 62306651 62306666 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr10 + 79243663 79243678 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr16 + 81444683 81444698 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr17 - 82519890 82519905 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 + 91021713 91021728 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr9 - 97412149 97412164 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr13 - 97976698 97976713 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr9 + 111483384 111483399 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr1 - 117367470 117367485 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr12 + 122422572 122422587 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr12 + 128823868 128823883 2.63e-08 0.000405 cgccgcggccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr7 + 152435841 152435856 2.63e-08 0.000405 cgccgcggccgccgcc
CSCCGCCGCCGCCGCC MEME-8 chr2 - 169827512 169827527 2.63e-08 0.000405 CGCCGCGGCCGCCGCC

DEBUGGING INFORMATION

Command line:

fimo --parse-genomic-coord --verbosity 1 --oc /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/fimo_out_8 --bgfile /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/background --motif CSCCGCCGCCGCCGCC /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/meme_out/meme.xml /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks.fasta

Settings:

output_directory = /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/fimo_out_8 MEME file name = /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/meme_out/meme.xml sequence file name = /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks.fasta
background file name = /scratch/jngalang/MotifAnalysis/MemeChipOutput/GRCh38-107_AZ_exp1_d0_TRIM1_0_peaks/background alphabet = DNA max stored scores = 100000
allow clobber = true compute q-values = true parse genomic coord. = true
text only = false scan both strands = true max strand = false
threshold type = p-value output theshold = 0.0001 pseudocount = 0.1
alpha = 1 verbosity = 1

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