Raw file Scan number Scan index Sequence Length Missed cleavages Modifications Modified sequence Oxidation (M) Probabilities Oxidation (M) Score Diffs Acetyl (Protein N-term) Oxidation (M) Proteins Gene Names Protein Names Charge Fragmentation Mass analyzer Type Scan event number Isotope index m/z Mass Mass Error [ppm] Simple Mass Error [ppm] Retention time PEP Score Delta score Score diff Localization prob Combinatorics PIF Fraction of total spectrum Base peak fraction Precursor Full ScanNumber Precursor Intensity Precursor Apex Fraction Precursor Apex Offset Precursor Apex Offset Time Matches Intensities Mass Deviations [Da] Mass Deviations [ppm] Masses Number of Matches Intensity coverage Peak coverage Neutral loss level ETD identification type Reverse All scores All sequences All modified sequences id Protein group IDs Peptide ID Mod. peptide ID Evidence ID Oxidation (M) site IDs 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 84325 71195 AAAAAAAAAPAAAATAPTTAATTAATAAQ 29 0 Unmodified 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_AAESVSKPDVSEEAPGPSKVK_ 0 0 Q9BY42;A8MSH5;A2A2L5 RTFDC1 Protein RTF2 homolog 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 1 528.77593 2111.0746 0.03252 474.57633 74.812 0.0051275 44.441 28.662 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y11-NH3;y7(2+);y8(2+);y14(2+);y19(2+);a2;b2;b3;b10;b11;b11-H2O;b12;b17(2+) 385.6;139.8;259.6;266.2;1629.5;284.1;204.8;74.8;188.7;361.5;91.6;931.7;207.6;374.2;58.6;1358.5;1509.6;228.1;42.4;47.4;69.2;128.3;172.3 0.02265524;0.007420479;0.04572678;-0.1546723;0.07008864;-0.02957736;0.2154693;-0.01452056;-0.4575898;-0.08610822;0.1495281;0.07008514;-0.1802483;-0.1487769;0.2100524;-0.03000299;0.05647963;0.07682541;0.1990535;0.1316557;0.2727023;0.2855769;-0.03940872 154.0229;30.14325;81.90137;-251.2802;98.38865;-37.75021;236.1827;-13.94101;-405.2885;-661.4938;134.5387;196.5089;-459.325;-206.4852;213.1868;-260.6313;394.8933;282.3973;202.2284;122.8819;258.9155;237.9235;-47.68529 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AELVQGQSAPVGMK 14 0 Acetyl (Protein N-term),Oxidation (M) _(ac)AELVQGQSAPVGM(ox)K_ AELVQGQSAPVGM(1)K AELVQGQSAPVGM(44.43)K 1 1 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 736.87432 1471.7341 -0.72814 654.98805 121.11 0.0065964 44.426 27.285 44.426 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y5;y9;y10;y1-NH3;y9-NH3;y10-NH3;y13(2+);b2;b3;b3-H2O;b4 250.6;224.1;110.1;134.8;168.2;84.6;171.5;112;399.3;419.9;91.4;261.3 0.04047751;0.02351091;0.1301528;0.1190282;-0.03515911;0.1685451;-0.0121962;0.1586432;0.04362348;-0.006742475;-0.03134525;0.2786514 275.2218;42.96055;146.1882;116.88;-270.2024;193.0102;-12.17812;233.233;179.4807;-18.92952;-92.68192;612.4592 147.072326660156;547.267333984375;890.309875488281;1018.37957763672;130.12141418457;873.244934082031;1001.48425292969;680.191833496094;243.053924560547;356.188354492188;338.202392578125;454.971374511719 12 0.1595793 0.07058824 None Unknown 44.4259;17.1405 AELVQGQSAPVGMK;MGDSPGGAAILGLAGK 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Unmodified _AFMGTPVQK_ 0 0 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 489.7575 977.50044 -0.40371 1015.2523 90.405 0.015264 76.221 51.702 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y4-NH3;y6-H2O;y7-H2O;y8-H2O;y6(2+);y7(2+);y8(2+);a2;b2;b6 557.6;1552.3;420.4;1464.7;3182.4;79.5;656.4;241.1;638.8;430.2;50;268.7;262.5;241.1;4636.4;1926.5;862.7 -0.01059366;0.1295651;0.1255163;0.03131835;0.07845578;0.263813;-0.1263151;0.1708565;0.1067522;0.09731004;0.08827034;0.004496382;-0.005229577;0.1437845;-0.005019997;0.06666159;-0.02448779 -72.00525;274.9899;219.3517;49.76456;103.1873;290.797;-970.0685;376.2571;174.6473;131.0936;99.25022;14.26608;-13.73638;316.6396;-26.26581;304.3267;-40.45565 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 67435 57005 AFMVTDEDIRK 11 1 Unmodified _AFMVTDEDIRK_ 0 0 O95983;O95983-2 MBD3 Methyl-CpG-binding domain protein 3 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 442.22371 1323.6493 0.05019 -2.5051749 103.42 1.8058E-13 117.52 82.765 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y4-NH3;y5-H2O;y5-NH3;y6-H2O;y7-H2O;y7-NH3;y8-H2O;y9-H2O;y6(2+);y7(2+);y8(2+);y9(2+);a2;b2;b3;b6(2+) 359.9;566.2;3748.6;1208.5;1723;2663.4;6247.9;1493.2;14.8;420.6;228.7;280.9;198.3;168.7;446.3;306.3;273.6;35.3;297;1015.7;1276.6;803.8;11027.2;2769.2;277.1;221.6 0.07755636;-0.02909628;0.05066473;0.05050815;0.05580876;0.0771976;0.0910626;0.2086708;0.2273049;-0.003161435;0.1971158;-0.01591315;-0.02719786;-0.3084281;0.1597826;0.08312921;0.1528791;0.2000165;-0.194793;-0.2092533;-0.06109373;-0.1496161;0.008941795;0.002818819;-0.01101786;0.07758158 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NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y11;y1-NH3;y8-H2O;y9-H2O;y6(2+);y9(2+);y13(2+);a2;b2;b3;b4;b6;b11;b10(2+) 827;1178.5;615.8;661.5;701;1622.4;594.8;237.6;243.4;182.9;902.8;133;74.5;563.1;478;172;2336.3;335.3;435.5;621.8;545.9;63.6;478.4 0.0612142;-0.0163638;-0.1269452;0.02077842;0.06788812;0.1082424;0.1576381;0.3422892;0.03254579;0.2515738;-0.06843854;0.1408676;0.1796959;0.06642641;-0.01976172;-0.07531286;0.05947345;0.008840587;0.1236248;0.06178671;0.09602509;0.05438964;-0.1859993 416.2771;-57.58089;-307.8525;39.55583;103.7586;143.3111;177.8634;342.2393;29.54671;192.7216;-525.8246;143.4005;165.8713;175.6664;-35.84624;-96.13181;378.6332;47.75608;394.8414;139.7244;152.3647;44.41709;-330.6929 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Unknown 70.25957;14.4693 AINGPTSASGDDISK;AGLEMPLCPVSSR _AINGPTSASGDDISK_;_AGLEM(ox)PLCPVSSR_ 1380 140 443 447 2033 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 80166 67567 AINQQTGAFVEISR 14 0 Unmodified _AINQQTGAFVEISR_ 0 0 Q92945-2;Q92945 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 511.93884 1532.7947 -0.031151 -1.8493389 125.4 0.0057459 53.491 36.828 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y3-H2O;y3-NH3;y8-NH3;y10-NH3;y6(2+);a2;b2;b3;b7;b8;b7(2+) 233.6;318.5;405.7;1500;892.7;495.5;96.4;352.8;13.7;105.7;63.1;19.3;343.9;171.3;113.1;42.2;143.9;283;129.3;134.8;197.9;140.4;343.9 -0.1071526;0.144694;-0.01425352;0.05293674;0.1166204;0.04898698;0.09139018;0.0490418;0.2716818;-0.3521465;0.02393031;-0.2703744;0.1826403;-0.1164557;0.06380348;0.2284091;-0.3460443;0.1083931;-0.2281742;0.05602524;0.08906318;0.2293874;0.1406381 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Unknown 74.37621;68.01611;61.67886 ALEVSEDVK;ALEELSEAK;IAELDTEAK _ALEVSEDVK_;_ALEELSEAK_;_IAELDTEAK_ 1649 1614 516 521 2393 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_C 82162 68981 ALEYTIYNQELNETR 15 0 Unmodified _ALEYTIYNQELNETR_ 0 0 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 11 0 928.95488 1855.8952 -0.32295 0.021501322 133.11 0.009028 47.639 14.2 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y5;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y9-NH3;y11-H2O;a2;b2;b5;b5-H2O;b6;b6-H2O;b10;b11(2+) 115;188.7;192.9;299;781.5;164.1;24.2;36.9;13.4;123.6;49.6;114.4;422.4;238.3;189.8;184.7;155;86.8;282.8 0.1566414;-0.04815206;0.03537289;0.1043977;0.2208879;0.2519733;0.2310483;0.2677655;0.01533094;0.4058866;0.2520998;-0.09924848;0.06897548;0.09394399;0.1513725;-0.1664134;-0.08127498;0.2194189;0.3550257 895.2865;-174.3283;55.94314;104.0465;189.3883;196.9502;167.3724;173.4827;96.98393;353.2179;185.0392;-631.22;372.7206;162.48;270.25;-240.6444;-120.6869;179.0657;530.3027 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73.72173;15.66075 ALQHMAAMSSAQIVSATAIHNK;HMTWIPLGNQADLFPEGTIR _ALQHM(ox)AAMSSAQIVSATAIHNK_;_HMTWIPLGNQADLFPEGTIR_ 1812 12 569 575 2630 1;2 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_C 80037 67097 ALQHMAAMSSAQIVSATAIHNK 22 0 Oxidation (M) _ALQHMAAM(ox)SSAQIVSATAIHNK_ ALQHM(0.234)AAM(0.766)SSAQIVSATAIHNK ALQHM(-5.16)AAM(5.16)SSAQIVSATAIHNK 0 1 A4FUP2;H0YEJ9;P28347;H0YE88;E9PKB7 TEAD1 Transcriptional enhancer factor TEF-1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 11 1 766.05607 2295.1464 -0.82371 434.91805 129.31 1.3267E-05 74.742 58.34 5.1609 0.76644 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y2-NH3;y7-H2O;y9-NH3;y11-NH3;y9(2+);y10(2+);y18(2+);a2;b2;b5;b8;b9;b9-NH3;b10;b11;b11-H2O;b11-NH3;b12;b13;b7(2+);b8(2+);b12(2+);b13(2+);b14(2+) 38.4;437.6;485.7;984;568.4;392.3;1519.7;1157.1;345.2;234.6;97.8;61.8;150.4;347.8;364.6;113.6;277.6;340.4;364.6;90.9;384.5;512.7;348.8;299.1;1157.1;233.7;138.4;138.9;145.2;176.2;83.3;207.9;331.8;584.4;397.6;458.1 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ALQHM(4.72)AAM(-4.72)SSAQIVSATAIHNK 0 1 A4FUP2;H0YEJ9;P28347;H0YE88;E9PKB7 TEAD1 Transcriptional enhancer factor TEF-1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 766.05607 2295.1464 -0.58879 -3.3546536 117.07 0.0072303 50.873 28.438 4.7186 0.74772 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y2-NH3;y9-H2O;y7(2+);a2;b2;b7;b9;b9-NH3;b10;b10-H2O;b11;b11-H2O;b12;b13;b9(2+);b10(2+);b12(2+);b16(2+) 60.5;137.6;377;353.1;389.7;191;649.8;431.3;176.7;67.3;49.2;22.4;69.3;92;208.8;27.5;28.2;186.6;106;431.3;246.1;155.8;71.4;213.2;261.6;18.1;156;145.8;170;156.4 0.1383779;-0.1436458;-0.01387214;0.08246431;-0.2864222;0.0855305;0.07849641;0.09954705;0.1672536;0.2645274;0.1617486;0.01698017;0.1914536;0.1328056;-0.04847566;0.1939034;-0.1729068;-0.04176845;0.2239819;-0.01997446;0.107939;0.2952503;0.10892;-0.04226973;0.1557787;-0.09841413;-0.4997273;-0.462717;-0.4510041;0.2079016 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ALSSDSILSPAPDAR 15 0 Unmodified _ALSSDSILSPAPDAR_ 0 0 Q8IVT2 MISP Mitotic interactor and substrate of PLK1 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 1 750.38864 1498.7627 0.025849 666.22329 129.11 0.0072937 49.988 32.294 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y6;y7;y8;y10;y13;y1-NH3;y4-NH3;y9(2+);a2;b2;b3;b6;b13(2+) 258.1;482.8;270.1;1140.3;654.6;1001.7;517.3;189.5;151;224;250.5;465.5;372.8;410.8;206.8;240.8 0.08735123;0.03712371;0.03234268;0.1098302;0.01679756;-0.06509306;0.1574446;0.1616525;-0.07667957;0.1398878;0.02575797;0.04714435;0.1009274;0.03816819;0.0009331801;0.4565839 499.0598;150.8365;70.58585;175.3871;23.54773;-78.75683;153.395;122.8841;-484.7949;317.1561;54.77614;300.1173;545.4722;140.2612;1.66268;727.7889 175.031600952148;246.118942260742;458.203430175781;626.2158203125;713.340881347656;826.5068359375;1026.400390625;1315.48718261719;158.169082641602;441.0693359375;470.240783691406;157.086395263672;185.027526855469;272.122314453125;561.250549316406;627.357666015625 16 0.2049063 0.08602151 None Unknown 49.98771;17.69377;17.11655 ALSSDSILSPAPDAR;PRMLPSPTQLTQM;GMPIFQPQPFPPK _ALSSDSILSPAPDAR_;_PRMLPSPTQLTQM_;_GM(ox)PIFQPQPFPPK_ 1892 1278 591 598 2748 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_C 83984 70892 ALSSSADDASLVNASISSSVK 21 0 Unmodified _ALSSSADDASLVNASISSSVK_ 0 0 Q9NQW6;Q9NQW6-2 ANLN Actin-binding protein anillin 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 23 0 1005.0053 2007.996 3.5126 4.0854899 133.05 9.0443E-60 118.46 96.095 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y13;y14;y15;y16;y17;y18;y19;y1-NH3;y2-NH3;y9-H2O;y12-NH3;y13-H2O;y16-NH3;y13(2+);y15(2+);y16(2+);a2;b2;b3;b5;b5-H2O;b7;b7-H2O;b8;b9;b9-H2O;b13;b18;b9(2+);b13(2+) 837.4;416.4;721.5;1933.7;756.8;2364.4;1237.8;4446.3;3822.8;2253.7;3355.5;1629.8;549.8;665.9;428.8;235.4;53.5;77.8;356.5;312.3;773.5;509;478.4;94.2;774;579.6;576.3;1676.9;1546.8;1320.6;641.8;596.6;774;596.8;579.6;639.3;568.2;914.3;25.1;770.6;603.4 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_AMDTPKPAVSDEK_ 0 0 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 463.56239 1387.6653 -0.17639 -1.2682941 65.941 0.0017658 81.239 51.434 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y11;y1-NH3;y2-H2O;y7-H2O;y9-NH3;y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2;b9;b9-H2O 1121.6;1092;614.1;530.9;409.1;3961.8;201.9;308.4;20.6;1013.3;1651.8;162.7;46.3;372.5;923.8;460.5;276.7;4539.4;726.2;348.5;155.9 -0.008991484;0.02511773;0.1203746;-0.03148739;-0.03093367;0.1191202;0.1067224;0.1076674;0.2995985;-0.107028;0.06441876;-0.02511145;0.3436916;-0.3819202;-0.200305;0.2910717;-0.2292743;-0.0009516267;0.0884149;0.08001675;0.1032655 -61.11592;90.96331;251.7801;-54.54117;-47.71131;159.8385;122.1974;110.9501;252.5497;-822.0702;249.6073;-34.52282;360.5849;-785.6083;-373.3635;490.4243;-347.622;-5.435044;435.549;87.79682;115.5934 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ITMS MULTI-MSMS 2 1 694.60219 2774.3797 0.31711 -0.70866483 130.81 4.4589E-96 121.33 102.17 121.33 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y2-NH3;y5-H2O;y5-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y10-NH3;y11-NH3;y12(2+);y16(2+);y19(2+);y21(2+);a2;b2;b3;b4;b8;b9;b11;b12;b13;b6(2+);b8(2+);b9(2+);b13(2+);b15(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+);b20(2+) 1486.3;3447.6;1178.7;11533.8;7878.7;11761.1;13613.5;3737.8;1446;833.6;447.8;228.9;1115.8;2249.3;1081.7;1336.6;2733.1;2336.9;364.4;771.2;7378.1;2514.8;1464.5;315.5;260.1;4174.9;1419.2;3049.9;1580.5;2685.7;978.5;771.2;223.6;663;1200.8;1058.8;4058.1;2880.8;3012.3;4591.6;1575.8;495.8 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 85051 72278 AMDTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK 25 2 Oxidation (M) _AM(ox)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK_ AM(1)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK AM(104.3)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 7 0 694.60219 2774.3797 -0.34725 -370.66524 130.3 1.3424E-50 104.3 89.283 104.3 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y2-NH3;y5-H2O;y6-H2O;y6-NH3;y10-NH3;y11-NH3;y7(2+);y12(2+);y17(2+);y19(2+);a2;b2;b3;b4;b8;b9;b11;b11-NH3;b12;b8(2+);b9(2+);b13(2+);b14(2+);b15(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+);b20(2+) 1665.5;2500.9;768.5;8467.5;6538.7;9592.8;9361.7;2491.3;1420.7;849;251.1;812.3;1971.4;908.1;2791.7;1239.3;589.3;633.2;717;4961.3;1257.1;912.6;140.6;3475.6;975.8;2155;2554;1348.2;456.7;328.6;633.2;894.3;756.8;3843.8;1545.5;2452.3;1837.9;2472.6;2006.4;386 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AMDTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK 25 2 Oxidation (M) _AM(ox)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK_ AM(1)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK AM(48.26)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 13 2 694.60219 2774.3797 -0.22394 720.74991 130.54 0.012046 48.255 37.136 48.255 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y11;y1-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y11-NH3;y12(2+);b2;b3;b4;b12;b13(2+);b14(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+) 343.2;333.6;766.2;759.7;1070.1;1629;395.9;160.8;82.5;155.8;432.8;395.5;102.8;1435.6;502.3;278;411.6;102.8;593.4;195.5;379;372.5;332.5 0.02213645;0.1350658;0.006548708;0.1416906;0.144977;0.0829588;0.07532292;0.1627963;0.2322926;-0.04103375;0.3222785;0.0911452;0.3976381;0.3463874;-0.06349055;0.1869327;0.09270445;0.2918524;-0.4348511;-0.2539635;-0.1721572;-0.2136867;-0.146948 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AM(1)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK AM(71.76)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 3 0 694.60219 2774.3797 0.037299 -1.2853703 129.08 3.7841E-12 71.756 58.04 71.756 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y11;y1-NH3;y2-NH3;y5-H2O;y6-H2O;y11-NH3;y12(2+);y16(2+);y19(2+);b2;b4;b8;b9;b11;b11-NH3;b12;b9(2+);b13(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+) 534.9;269.4;962.8;672.8;1329.8;1084.1;23.3;99.7;230.8;175.9;322.2;144.8;674.4;220.7;424.1;511.8;369.4;300.3;423.4;135.6;145.8;144.8;284.8;1803.2;288.5;550;212.1 0.07355856;0.01629135;0.002428835;0.06649525;0.1458315;-0.05711688;0.3681569;-0.09903241;0.05166242;-0.06461387;0.0218635;0.3508851;0.2347541;0.3311258;0.05724425;-0.1234576;-0.1130451;0.04698376;0.2303269;0.1675942;0.06633808;0.2450994;0.05682047;-0.3798584;-0.01193996;-0.2651393;-0.2399655 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Oxidation (M) _AM(ox)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK_ AM(1)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK AM(46.56)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 6 4 694.60219 2774.3797 0.037299 1446.1013 129.12 0.012975 46.558 37.712 46.558 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y9;y10;y11;y1-NH3;y2-NH3;y5-NH3;y9-H2O;y11-NH3;y12(2+);y17(2+);a2;b2;b9;b12;b12(2+);b13(2+);b17(2+) 57;292.1;205.8;294.4;470.3;819.3;807;99.5;204.6;30.7;78.1;192.1;177.1;118.6;68.1;1598.2;270.3;23.7;166.2;287.7;68.1;133.7;206.4;317 -0.003711943;0.04128525;-0.01325616;0.03627283;0.08071644;0.07466452;0.1775633;0.1659701;0.1361437;0.2012868;-0.1032133;0.04323956;0.1424852;0.04725116;-0.06671742;-0.02537771;-0.111657;-0.1491797;0.02128728;0.1769821;-0.1725031;0.4763466;-0.2032226;-0.4259059 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_AM(ox)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK_ AM(1)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK AM(81.48)DTPKPAVSDEKNINTFVETPVQK 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 11 2 694.60219 2774.3797 -0.45056 721.61497 131.28 1.9932E-15 81.48 62.934 81.48 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-NH3;y5-H2O;y6-H2O;y10-H2O;y12(2+);y19(2+);a2;b2;b3;b4;b8;b9;b11;b11-H2O;b12;b6(2+);b13(2+);b14(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+);b21(2+) 1148.1;1492.6;640.4;8923.8;4350.3;7903.4;9684.5;1156.1;709.1;489;1107.8;1992;952.7;2133.8;1014.3;6337.1;1338;83.1;3282.7;1044.2;2302.9;1692.8;1504.4;670.6;430.5;813.6;1545.7;3759.4;1045.8;2145.2;2099.1;1155.9;363.6 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161.8703;40.67562;24.0531 APAMQPAEIQFAQR;NLDFAPGVNMQPVR;GDSGGAGPLSGSARRGR _APAMQPAEIQFAQR_;_NLDFAPGVNMQPVR_;_GDSGGAGPLSGSARRGR_ 2099 1111 653 664 3050 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 72182 61452 APAMQPAEIQFAQR 14 0 Oxidation (M) _APAM(ox)QPAEIQFAQR_ APAM(1)QPAEIQFAQR APAM(70.37)QPAEIQFAQR 0 1 Q14684-2;Q14684 RRP1B Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 787.39321 1572.7719 0.30462 2.6613789 109.07 0.0047932 70.373 54.939 70.373 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y6;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y10-NH3;y13(2+);a2;b2;b3;b4;b5;b6;b10;b12;b12-H2O;b8(2+) 194.7;140.6;276.8;351.9;219.5;2102.6;790.2;88.9;121.7;11.7;62.2;409.9;341.5;243.1;36.8;462.5;322.5;169.8;195.1;58.3;53.1;133.2 -0.1702629;-0.4347095;0.0118782;0.03116764;0.2334941;0.1273835;0.265795;0.06376746;0.357351;-0.07568774;0.175159;-0.144881;-0.04088796;-0.009687935;-0.1175937;0.1339616;0.003635259;0.04584003;0.2510375;0.206785;0.3462447;0.4692132 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_APAM(ox)QPAEIQFAQRLASSEK_;_LMAPYTPFLTELM(ox)YQNLK_;_M(ox)FSAKEVELYVTEIEKEK_ 2101 1111 654 666 3055 134 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 85067 71813 APILIATDVASR 12 0 Unmodified _APILIATDVASR_ 0 0 P17844;E7ETL9;Q92841-1;Q92841;Q92841-2;C9JMU5;Q92841-3;H3BLZ8;Q59F66 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 10 0 613.85879 1225.703 0.11084 -1.2969181 132.2 0.038832 44.829 19.634 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y7-NH3;y9-H2O;y11(2+);a2;b2;b3;b4;b5;b8;b10 529.2;531.9;402.1;498.8;1225.5;1037;1044.3;595.4;306.3;427.2;117.4;294.8;265.9;1925.7;746.8;918.3;1180.6;588.4;332;390.5;175.8 0.01436844;0.09159338;0.1454853;0.1201923;0.1035341;0.1722172;0.1174873;0.1348398;0.02561536;0.02389979;-0.03110135;0.168904;0.02165647;0.01205189;0.002920026;0.09849688;0.1055345;-0.08219108;0.0798148;-0.2215358;-0.1263841 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_ASSLHRTSSGTSLSAMHSSGSSGK_ 0 0 Q12888;Q12888-2;A6NNK5;F8VY86 TP53BP1 Tumor suppressor p53-binding protein 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 774.03639 2319.0873 0.075946 431.17642 49.578 0.011317 36.217 25.662 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y7;y8;y9;y10;y12;y1-NH3;y2-NH3;y8-H2O;y11(2+);y23(2+);a2;b13;b9(2+);b12(2+);b13(2+);b17(2+);b19(2+);b21(2+);b23(2+) 86.8;48.9;100.2;88.8;244.9;159.7;74.3;82;82;22.2;105.1;275.7;77.8;66.1;94.2;78.7;124.6;117.6;73.4;33.4;71.3;101.6 -0.1376994;0.1252042;-0.06838387;0.199983;-0.1967326;0.06347854;0.1895816;0.08283462;-0.1344175;-0.026467;-0.1352148;-0.02651746;-0.212364;-0.08205492;0.02352726;0.4059389;-0.2426335;0.2010708;0.1569222;-0.1526022;-0.3491227;-0.03368033 -935.1368;613.7187;-234.8068;328.334;-263.5261;72.35508;199.9319;72.1271;-1032.229;-141.4333;-185.6154;-51.16669;-188.7269;-625.5923;18.30024;875.1892;-413.3246;312.6454;183.2655;-161.7238;-343.6854;-30.96951 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24 2 Oxidation (M) _ATPRLASTNSSVLGADLPSSM(ox)KEK_ ATPRLASTNSSVLGADLPSSM(1)KEK ATPRLASTNSSVLGADLPSSM(48.85)KEK 0 1 Q13428-7;E7ETY2;Q13428-6;Q13428-5;H0YA99;Q13428-3;Q13428;Q13428-4;E9PHK9;Q13428-8;Q13428-2 TCOF1 Treacle protein 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 14 2 619.82325 2475.2639 -0.033998 808.39539 130.09 0.010661 48.852 18.192 48.852 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y7-H2O;y9-H2O;y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b7;b7-H2O;b8;b9;b11;b11-H2O;b11-NH3;b14 455.5;1431.8;209.2;267.3;110.1;538.8;150.8;130.1;338.3;285.9;675.4;546.5;456.8;949.9;437.5;1044.6;1542.4;129.1;503.3;564.5;645.9;324.8;311.1;201.7;223;42.1 0.02260947;0.1361007;0.2200426;0.04093095;0.08097442;0.09999674;-0.01381526;-0.02968121;0.245287;0.06076177;-0.1714662;-0.2856497;-0.4186431;0.05143934;0.3759693;0.1045394;0.04867273;-0.07737047;0.04966248;-0.02315806;0.2220968;0.1742039;0.1235147;0.1456648;0.1183279;0.2968459 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AYHMVCLDPDMEKAPEGK 18 1 Unmodified _AYHMVCLDPDMEKAPEGK_ 0 0 F5H2G1;F5GWX5;Q14839;Q14839-2 CHD4 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 8 1 697.64965 2089.9271 -0.49393 479.65927 121.74 0.0043918 47.64 47.64 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-NH3;y10-H2O;y9(2+);y10(2+);a2;b2;b3;b4;b5;b6;b7;b8;b9(2+);b10(2+);b16(2+) 73.7;448.3;354.9;280.9;132.5;78.2;146.2;66.1;28.3;55.1;300;625.8;147.5;72.1;387.9;300;259.7;120.5;124.6;209;108.9;259.7;89.2 -0.09993387;0.01108369;-0.03169718;-0.03028896;0.1397867;0.2368591;0.1304433;-0.1023436;-0.04586092;0.259405;-0.2971522;-0.2492554;0.09968161;0.2231363;0.01840678;0.1704637;0.05153015;0.1550543;0.1631295;0.1252532;0.165004;-0.4719152;0.1311555 -678.8398;54.29903;-73.6696;-60.42118;157.1864;235.8603;118.4347;-786.1177;-245.0443;239.4682;-590.7168;-451.9466;481.5231;949.9827;49.46088;338.8692;85.56642;203.443;186.3854;126.4811;303.2751;-783.6207;138.8953 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_CNSHLEITIPK_ 0 0 Q5FWF5;Q5FWF5-2 ESCO1 N-acetyltransferase ESCO1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 6 1 437.8957 1310.6653 -0.78126 -1488.7099 129.89 0.034307 47.971 19.263 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y1-NH3;y2-NH3;y10(2+);a2;b4;b4-NH3;b5;b5-NH3;b6;b6-H2O;b6-NH3 1635.3;6653.4;430.2;355.2;1058;286.6;299.6;35.3;361.4;769.5;348.3;440.9;359.2;175;463 -0.02551675;0.05069986;0.1701642;-0.06729498;0.08424091;-0.09920129;-0.2503633;-0.08084107;0.04776895;0.01972449;0.2214325;-0.008424668;0.2445554;0.09306056;0.1589853 -173.4202;207.6885;476.5444;-117.7621;647.9969;-436.552;-434.2251;-327.071;95.70557;40.91152;361.7975;-14.15345;330.0103;128.6798;219.5587 147.138320922852;244.114868164063;357.079467773438;571.448669433594;130.002014160156;227.238220214844;576.574951171875;247.166778564453;499.1240234375;482.125518798828;612.034423828125;595.237731933594;741.053894042969;723.19482421875;724.112915039063 15 0.2115296 0.08064516 None Unknown 47.97142;28.70808;19.64134 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_DGSAFEDGLRHPFIVNHPK_ 0 0 P55265;P55265-4;E7ENU4;P55265-5;H0YCK3;P55265-2;P55265-3 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 534.77099 2135.0548 -0.48492 -1.284271 131.11 0.0029225 50.188 37.995 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y8(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);y15(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b10;b11;b11-H2O;b14(2+) 1684.5;9278.7;1267.9;4043.2;5575.4;1190.9;1037.4;440.3;558.3;1462.4;6381.5;5044.3;2465.1;2990.2;1205.2;5046.2;6622.7;716.5;2886.3;3256.8;239.5;172.4;142.9;1190 -0.002292875;0.07343546;-0.04312876;0.07629976;-0.003759791;-0.06193279;0.1005723;0.1750481;-0.1771421;0.08997717;-0.1401064;-0.4459603;0.1002261;-0.178221;-0.1255204;-0.005088334;-0.01926795;-0.0983446;0.02215987;-0.07400662;-0.009955921;0.2031308;0.4347536;0.3408201 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DGVMDLLTPVQTV;QSNRGRQAISDR _DGVMDLLTPVQTV_;_QSNRGRQAISDR_ 4092 1245 1324 1344 6060 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_C 46827 39405 DGVVEITGKHEER 13 1 Unmodified _DGVVEITGKHEER_ 0 0 B4DL87;P04792 HSPB1 Heat shock protein beta-1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 490.2512 1467.7318 0.48197 -1.4308125 73.648 0.0098622 55.899 34.504 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y8-H2O;y6(2+);y7(2+);y8(2+);y9(2+);y10(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b8 379.5;196.4;363.3;74.1;222.2;552.9;85.4;31.4;38.7;257.6;205.1;371.8;856.9;540.6;69.1;422;239.4;596.9;119.5 -0.006169889;0.009680365;0.181019;-0.007038016;-0.0953155;0.2271432;-0.05903203;0.008708621;0.07035689;-0.3238352;-0.3372884;-0.0962208;-0.2200048;-0.1695625;-0.0637889;0.03786096;-0.09205798;0.06861618;-0.0778762 -35.23132;22.34647;317.5315;-10.07785;-126.1664;265.2923;-60.88474;55.08868;73.94855;-855.5363;-786.1202;-198.2481;-400.0084;-282.8473;-439.5459;218.8269;-593.3973;252.2139;-100.9457 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DIDIHEVR 8 0 Unmodified _DIDIHEVR_ 0 0 Q00839;B3KX72;Q5RI18;Q00839-2 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 498.75908 995.50361 0.03049 -1.1667936 94.062 0.016902 82.426 52.659 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y1-NH3;y3-H2O;y4-NH3;y6-NH3;y6(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b6 960.1;1288.3;1016.9;3907.4;1082.1;2802.4;57.3;340.5;373.5;223.3;632.6;5872.1;1194.7;131.5;1948.8;195.3 0.06505813;0.0701786;0.1206452;0.08458639;0.01893113;0.08420424;-0.1010021;-0.1466944;0.1423268;-0.060631;0.03335022;0.073259;0.127805;0.05116972;0.07637885;0.08665483 371.6463;256.0168;299.2866;156.5822;28.9753;109.5959;-638.4721;-380.6624;272.073;-80.68706;86.6982;364.3818;558.1235;242.4455;221.9871;119.8141 175.053894042969;274.1171875;403.109313964844;540.204284667969;653.35400390625;768.315673828125;158.193405151367;385.366088867188;523.119995117188;751.433959960938;384.670227050781;201.050109863281;228.990478515625;211.056549072266;344.06884765625;723.244140625 16 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_EHLTEQINVEEK_ 0 0 Q92576-2;Q92576 PHF3 PHD finger protein 3 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 734.86755 1467.7205 0.037379 0.074813902 99.623 0 231.67 211.83 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-H2O;y3-H2O;y4-H2O;y7-NH3;y8-H2O;y9-NH3;y10-NH3;y10(2+);y11(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b5;b7;b7-H2O;b9;b9-H2O;b9-NH3;b10;b10-NH3;b9(2+) 334.3;469.2;252.9;243.5;391.2;367.9;454.5;639.3;1513.5;1349.9;210.5;468.4;477.9;140.8;149.8;124.1;86.9;56.2;95.8;87.1;291.9;2033.4;1929.7;1792.3;554.8;311.7;304.6;229.3;258.2;217.4;157.6;107;194.7;102.2;90.5;229.6 0.007686373;0.1134051;0.03047938;-0.01521193;0.08087714;0.06319551;0.1561968;0.02667081;0.1003503;0.2342189;-0.04938031;-0.01330951;-0.05216783;0.3126328;0.006234664;0.06542253;0.2478734;-0.09494248;-0.4322308;-0.2383462;0.0544796;-0.009870918;-0.05315045;0.009129586;-0.0288704;-0.03981059;0.04358834;-0.168299;0.2214128;0.16202;0.2689114;0.2074433;0.006400339;0.1635552;0.07609305;-0.04665951 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 87104 73877 EILVGDVGQTVDDPYATFVK 20 0 Unmodified _EILVGDVGQTVDDPYATFVK_ 0 0 E9PP50;P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PQB7;E9PLJ3;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 2 HCD ITMS MSMS 51 -1 1083.5519 2165.0892 NaN -322.65112 133.94 1.7053E-178 145.71 120.55 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y7;y8;y9;y10;y11;y13;y14;y15;y16;y17;y1-NH3;y2-NH3;y9-NH3;y10-NH3;y13-H2O;y13-NH3;y17(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b6;b6-H2O;b7;b8;b8-H2O;b18;b12(2+) 1009.8;774.5;1096.3;897.3;1009.2;3564.6;1073.2;1894.4;2131.6;1529.5;1894.9;146;235.1;279.2;67.3;446.7;360.7;1121.4;685.9;291.2;398.4;482.8;1456;3031.3;345.1;4017.7;1541.7;2019.3;1131.2;1488.2;1141;1037.9;523.4;597.6;49.3;665.1 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y1;y6;y7;y9;y10;y11;y1-NH3;y9-NH3;y11-NH3;y7(2+);y9(2+);y12(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);a2;b2;b2-H2O;b5;b6(2+);b9(2+) 43.7;299.5;120.4;224.4;99.3;10.5;13.5;66.7;58.9;102.6;109.1;155.8;101.1;211.2;304.5;755.8;127;365.4;250.4;97;118.4 -0.1086924;0.07772155;0.1190609;0.1465258;-0.2734733;0.05325788;0.2232027;0.2479064;0.07150859;0.2730991;-0.04159861;-0.1189005;0.06070055;0.03276944;-0.04220238;-0.03894434;-0.06122637;0.08699191;-0.3609693;-0.1760001;-0.2018494 -738.2917;119.71;156.1882;156.9928;-257.5547;45.81213;1718.755;270.581;62.42658;715.9767;-89.02238;-192.5728;82.16158;41.88651;-50.27473;-180.9866;-251.7582;386.5682;-645.0526;-511.1424;-408.2512 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39.7;81.4;270.2;81.7;59.9;89.4;42.1;62.3;38.4;81.2;40.1;97.6;263.9;61.4;166.2;208.1;275.2;559.5;47.7;122.8;40.1;115.4;48.6 0.01818442;0.1379668;-0.004492808;-0.131001;0.2841439;0.2950792;0.3793121;-0.03744793;0.2343498;0.3939025;0.242458;-0.04177267;0.1093687;0.08262943;0.1579906;-0.3177555;0.02572975;-0.01106653;0.197227;0.01866305;0.1948391;-0.03724786;0.06986377 123.624;383.1375;-6.919135;-140.3173;267.7447;253.8783;307.5739;-287.7872;256.0557;429.9991;232.1807;-36.46369;188.0206;121.2892;213.8772;-405.9791;30.65374;-51.43632;811.8452;82.90829;186.5803;-71.25088;78.73449 147.094619750977;360.097412109375;649.330871582031;933.605834960938;1061.24926757813;1162.28601074219;1233.23889160156;130.12370300293;915.229919433594;916.054382324219;1044.26440429688;1145.59631347656;581.684814453125;681.259399414063;738.697509765625;782.689270019531;839.367248535156;215.150085449219;242.936706542969;225.104705810547;1044.26440429688;522.7705078125;887.333679199219 23 0.270848 0.176 None Unknown 62.81318;11.37514;10.37449 EINSDQATQGNISSDRGK;AHCIQQMTSKLTQDSR;SIAEVNSVDMQFTFSTK _EINSDQATQGNISSDRGK_;_AHCIQQM(ox)TSKLTQDSR_;_SIAEVNSVDM(ox)QFTFSTK_ 5750 1159 1912 1936 8617 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_C 36177 30503 EINSDQATQGNISSDRGKK 19 2 Unmodified _EINSDQATQGNISSDRGKK_ 0 0 Q29RF7 PDS5A Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 1 512.75553 2046.993 -0.33476 488.65355 56.203 0.0055892 44.831 35.316 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y10-H2O;y7(2+);y8(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b5;b7;b7-H2O;b9(2+) 101.8;150.3;38.6;29.6;44.6;86.1;76.5;24.4;98.7;130.1;283;142.7;178.6;356;61.7;44.8;97.9;150.2;122.5;92;84.3;205 -0.1327097;-0.09684668;-0.1056782;0.1622858;0.3143038;0.2276176;-0.02044964;0.2782264;0.03004399;-0.1333073;0.05061354;0.2419333;0.04882022;0.1248435;0.07805586;0.09044039;0.2467462;0.06894523;-0.08405282;0.2133597;-0.09548382;0.0843445 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31.4;164.1;114.6;41.5;169.1;151.5;300.3;353;453;175.2;145.4;620;58.6;178;284.9;307.8 -0.01759744;0.03358901;0.2072305;0.1830782;0.008709903;0.2668909;0.1066519;-0.2505339;-0.1360575;-0.1554644;-0.4750088;-0.08034143;-0.1232991;0.04744112;0.2015497;-0.005334555 -119.6044;68.78811;266.6324;172.4896;66.95931;686.1876;200.7823;-420.6636;-210.6225;-228.1157;-591.2645;-373.3002;-506.8672;210.7783;564.6041;-15.72819 147.130401611328;488.296752929688;777.214111328125;1061.38671875;130.077545166016;388.947418212891;531.181884765625;595.568359375;645.977722167969;681.515686035156;803.377990722656;215.219360351563;243.257232666016;225.075927734375;356.975311279297;339.171630859375 16 0.2314705 0.1290323 None Unknown 34.42157;13.94728;13.63644 EINSDQATQGNISSDRGKK;YMHAGSSDLLSEAIPESLK;NTMMSPPLNNPTSTSKRR _EINSDQATQGNISSDRGKK_;_YMHAGSSDLLSEAIPESLK_;_NTM(ox)MSPPLNNPTSTSKRR_ 5753 1159 1913 1937 8621 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_C 36928 31176 EINSDQATQGNISSDRGKK 19 2 Unmodified _EINSDQATQGNISSDRGKK_ 0 0 Q29RF7 PDS5A Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 8 2 512.75553 2046.993 0.086265 977.95663 56.851 0.0064333 43.764 18.447 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y6;y7;y10;y1-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y7-H2O;y10-H2O;y7(2+);y8(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);a2;b2;b2-H2O;b5;b7(2+) 138.6;98.7;350;77.7;82.3;159.5;142.3;124.7;120;151.4;205.8;159.8;110.1;516;295.6;116.1;301.7;58;102.3;105.1;166.8 0.04240012;0.048371;0.08723535;0.1335177;-0.03212262;-0.1957142;-0.08364685;0.05457594;0.1308875;0.3763575;-0.06500898;-0.000830971;-0.4033049;-0.1077372;-0.2716754;0.1512901;0.02489844;-0.07610369;-0.01922453;0.02910636;-0.2007171 288.2981;70.06828;112.2237;125.7896;-246.8722;-290.9926;-124.2071;71.87132;125.4399;967.9031;-145.8185;-1.564065;-677.0029;-166.7888;-398.5661;203.0091;115.7452;-312.9134;-85.38822;52.04937;-528.3835 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29604 EKPLEEPDAQGR 12 1 Unmodified _EKPLEEPDAQGR_ 0 0 Q9BTC0 DIDO1 Death-inducer obliterator 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 0 456.89665 1367.6681 0.25038 -2.2938019 51.077 0.0035364 69.846 44.993 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y3-NH3;y7-H2O;y8-H2O;y9-H2O;y6(2+);a2;b2;b2-H2O;b2-NH3;b3;b3-H2O;b6;b6-H2O;b7(2+) 68.9;581.2;206.2;624.7;576;800.5;45.9;21.3;30;21.7;92.9;178.8;126.8;16.5;45.5;377.5;67.7;203;419.2;41.3;190;265.9;88.7;131.6;212.3 0.09221878;0.09715724;-0.003734855;0.07125124;0.1088754;0.169757;-0.0417393;0.3852532;-0.04990888;-0.1470226;-0.1123753;-0.04514602;0.02490549;-0.08991109;0.1945923;-0.02549696;0.09234655;0.06121442;0.2554227;-0.3717678;0.3564709;-0.3677778;0.3162484;0.05708758;0.1673619 526.884;418.7031;-10.36876;165.2529;199.3493;263.9478;-54.03844;427.5766;-49.19385;-929.1147;-522.1262;-131.5376;33.01701;-101.7692;195.3189;-79.13714;401.4063;237.1883;1064.799;-1539.475;1004.593;-1089.535;435.5736;80.59811;406.1728 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Unmodified _ELAAGTESQALVSATPR_ 0 0 Q5SY74;E7ETD5;H7BY54;Q96IY1 NSL1 Kinetochore-associated protein NSL1 homolog 2 HCD ITMS MULTI-SECPEP 48 -1 850.94432 1699.8741 0.78565 -632.18255 131.14 0.018388 48.196 27.358 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y13;y14;y15;y9-H2O;y12-H2O;y9(2+);y12(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b9;b12;b14;b15;b9(2+) 339.1;180.4;875.3;299.3;426.4;579;334.4;407.4;283.7;292.4;379.1;371.2;76.8;258.7;104.9;263.6;299.3;226.3;263.7;24.2;493.8;261;191;148.9;187.4;44.4;180.4 0.0610388;0.09091992;0.2124869;0.1030444;-0.01259868;0.1063022;0.2511835;0.1939784;0.3046868;0.1134737;0.2537118;0.187432;0.1724218;0.05452256;0.09411991;-0.2079588;0.07923492;0.03417578;0.07994795;0.2896897;0.04629147;-0.1503899;-0.004902939;0.4915735;0.0414286;0.3779254;0.04330102 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ELELEVINLQKEK 13 1 Unmodified _ELELEVINLQKEK_ 0 0 O95239;O95239-2 KIF4A Chromosome-associated kinesin KIF4A 2 HCD ITMS MSMS 28 0 792.9458 1583.877 NaN -655.60066 133.42 1.2347E-88 142.1 83.836 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y7-NH3;y9-H2O;y10-NH3;y11-NH3;y9(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b5;b5-H2O;b6;b9;b12;b8(2+) 2126.6;2107.8;1603.7;1553.1;1243.3;4096.9;4815.1;4807.4;4858.6;3017.1;589.5;1673.7;746.4;1436.6;626.3;378.6;1760.4;1576.2;1063.6;4336.4;4192.6;2096.2;4527;2686.9;1488.6;1554.5;1305.1;1434.8;1408.5;1439.7;357.3;1040 0.02312827;0.03412041;0.01317767;0.1037986;-0.1037634;0.1006021;0.1326641;0.1347328;0.1612737;0.2531501;0.2635167;-0.06576825;0.02817311;0.1001719;0.22831;0.0604539;-0.453994;-0.04618302;-0.01794498;-0.001865478;0.01111555;0.04673922;0.02372513;0.02356693;0.1190806;0.009913629;0.02901379;0.01503114;0.1117099;-0.2652473;0.2243433;-0.4122894 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1947 1972 8762 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_C 22361 18597 ELEQEREDQKVK 12 2 Unmodified _ELEQEREDQKVK_ 0 0 O75940 SMNDC1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 3 0 510.93013 1529.7686 0.52247 -2.6013646 36.019 0.040428 56.548 14.843 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y1-NH3;y8(2+);y9(2+);y10(2+);a2;b2;b2-H2O;b9;b9-H2O;b6(2+) 238.7;19.4;393.1;223.5;157.9;256.4;118.7;120.3;109.8;85.6;32.4;177.6 0.02735495;-0.05068499;0.02515888;-0.1926993;-0.3400462;0.1568973;-0.04484949;-0.0769124;-0.05879057;-0.1876582;0.4563182;-0.05360069 185.98;-205.8425;193.4389;-373.1081;-585.6334;243.3756;-208.424;-316.2375;-261.08;-162.0964;400.6165;-136.303 147.08544921875;246.231903076172;130.061096191406;516.470336914063;580.64697265625;644.671325683594;215.183868408203;243.210845947266;225.182159423828;1157.69458007813;1139.0400390625;393.246643066406 12 0.1685958 0.09302326 None Unknown 56.54765;41.70429;38.23763 ELEQEREDQKVK;ELEIKEMMARHK;EEIEEKNRENLK _ELEQEREDQKVK_;_ELEIKEM(ox)MARHK_;_EEIEEKNRENLK_ 5842 751 1948 1973 8763 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 39492 33835 ELESLQNEHAQR 12 0 Unmodified _ELESLQNEHAQR_ 0 0 P12757-5;P12757;P12757-3 SKIL Ski-like protein 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 3 0 485.23918 1452.6957 0.24126 0.03518032 57 0.0028879 69.864 47.951 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y6;y7;y8;y9;y7-H2O;y9-NH3;y9(2+);y10(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b10 322.3;213;377.3;520.9;792.5;233.2;31.5;80.8;118.5;26.5;427.2;203.8;1141.3;61.2;776;372;16.7 -0.06245956;0.09894693;0.09132195;-0.02319759;0.06342159;0.2628683;0.02204208;-0.03143976;0.1205897;0.03112247;0.1475253;0.1733995;0.08329383;0.04793501;-0.06808317;0.3262154;0.3074009 -356.5422;326.4728;244.0958;-45.37011;84.08055;297.9843;22.14217;-29.04191;139.5251;29.20992;272.3763;286.0818;387.3127;197.1936;-302.3346;877.276;267.0207 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0 564.76763 1127.5207 0.010345 -0.94736565 60.228 9.3508E-13 115 90.495 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y7-H2O;y8-H2O;y8-NH3;y9(2+);a2;b2;b2-H2O;b2-NH3;b4;b4-H2O;b4-NH3;b9;b9-H2O;b9-NH3;b6(2+) 705.2;877.8;305;403.6;8468.1;3547.4;1090.5;3371.5;2318.3;272.4;176.4;217.3;220.6;334.3;393.2;488.6;1576.9;2405.4;756;214;1364.9;825.1;107;147.2;81.7;692.2 0.1137032;0.03277496;0.0799737;-0.02774348;0.1496236;0.1191326;0.09141319;0.1203232;0.1375395;0.03768506;0.06091335;0.05301647;0.2395193;0.1165402;0.134023;0.01655304;-0.005774767;0.01906094;0.06063268;0.07788819;0.1327227;0.03141112;-0.04584662;0.2248387;-0.2538532;-0.4760859 649.7128;133.1648;222.6686;-66.64471;291.5704;189.6345;120.7105;147.7655;155.3584;238.4305;265.9175;71.70974;300.8449;146.1755;302.4729;76.60561;-23.65752;84.31686;267.0977;209.3355;374.9142;88.45874;-51.89645;259.8859;-292.9279;-1540.281 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EVAEKQEATRQDHAQQLATAAEER 24 2 Unmodified _EVAEKQEATRQDHAQQLATAAEER_ 0 0 Q14980-2;Q14980;F5H4J1;F5H6Y5 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 3 0 678.08513 2708.3114 0.32082 5.5740934 75.907 3.5272E-07 60.735 52.708 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y11;y5-H2O;y6(2+);y15(2+);y17(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b5;b12;b11(2+);b13(2+);b14(2+);b16(2+);b21(2+) 99.3;278.7;458.3;336.9;322;132;190.1;239.9;166.7;110.2;91.4;81;133.5;94.9;122.6;69.1;166.7;91.2;132.6;234.4;224.3;113.5;107.7 0.1386476;-0.1352737;0.4080046;0.08922802;0.0535879;-0.2454048;0.1401381;0.1647234;-0.03944971;0.006717818;0.2356882;-0.3806071;0.03929293;-0.08774069;0.03182158;0.06710991;-0.0142976;0.06386326;-0.3748133;0.3452992;0.139735;-0.3542998;-0.2416079 320.154;-268.1999;709.7333;131.9479;71.70776;-285.1248;141.7877;138.7218;-70.78629;19.83647;273.3594;-401.1245;195.4055;-382.8027;150.7589;223.6339;-25.65478;46.09063;-589.1459;453.4339;175.2724;-382.6969;-212.0659 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_FHPIQGHRVEVK_ 0 0 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 6 0 482.937 1445.7892 -0.21387 -2.6945622 61.168 0.0048258 64.73 46.54 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y7;y8;y1-NH3;y2-NH3;y7-NH3;y8-H2O;y7(2+);y8(2+);y9(2+);y10(2+);a2;b2;b6(2+) 300.6;335.1;124;415.6;282.3;13.6;76.4;223.9;151.3;247;239.7;684.1;314.3;1078.9;99.2 0.02532553;0.07185835;0.07100175;0.04345866;-0.1007567;0.1612303;-0.1116142;-0.3765909;0.2349399;0.1996534;0.1278549;-0.01904201;0.1465541;0.04256123;-0.4191369 172.1801;291.9773;86.12508;45.62642;-773.9378;704.0825;-138.2119;-402.8148;569.5436;418.9382;239.795;-32.72625;570.2646;149.2894;-1228.785 147.087478637695;246.109359741211;824.402709960938;952.488830566406;130.18701171875;228.993438720703;807.558776855469;934.898315429688;412.505554199219;476.570129394531;533.183959960938;581.857238769531;256.993133544922;285.092041015625;341.098510742188 15 0.269043 0.106383 None Unknown 64.72977;18.18985;14.4693 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_GAPATPHLADAPKEAEK_ 0 0 Q99958 FOXC2 Forkhead box protein C2 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 2 568.29681 1701.8686 0.2133 1177.6891 80.675 0.0021855 54.859 36.19 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y7-NH3;y10-H2O;y6(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);y15(2+);b2;b3;b5;b6(2+);b13(2+);b16(2+) 248.9;530.4;199.4;90.7;532.1;230.6;31.9;125;99.9;52.8;197;250.5;374.9;247.6;325.9;690.6;345.5;339.3;31.8;172.9;229.2 -0.02078653;0.1458925;0.02468114;-0.4478875;0.1720509;0.1833;0.2739501;-0.05337811;0.1603635;0.1395322;0.02165286;-0.2118037;0.1552154;0.3273091;-0.1006525;-0.02987967;-0.09747714;0.1477155;-0.125599;-0.001378662;-0.15257 -141.2766;208.0503;31.95402;-504.4376;179.5354;171.087;226.7137;-410.1603;212.3364;132.4566;61.65861;-350.072;237.6274;465.2316;-127.7295;-231.4535;-430.9027;371.0926;-505.9227;-2.244175;-195.8432 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_GFLQGAPAGGEK_ 0 0 Q9UHF7;Q9UHF7-3;Q9UHF7-2;E5RJ97;E5RFF3;H0YC29 TRPS1 Zinc finger transcription factor Trps1 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 566.29329 1130.572 -0.47416 -2.9856244 91.171 0.0098213 59.116 41.057 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y8-H2O;y9-NH3;y9(2+);a2;b2;b3;b5 316.7;250.4;175.8;504.1;146.4;1452.7;488;163.2;59.3;130.3;130.3;469.8;307.2;557.9;656;144.1;179.2 0.1088827;0.1759858;-0.139531;-0.08942216;-0.0912488;0.05747322;0.07784273;0.02555417;0.3564193;-0.02592755;0.1947967;0.02333952;0.1570921;-0.04888356;0.05397173;0.01797956;0.1025984 740.6786;451.2199;-302.4243;-160.1464;-144.9736;83.74489;95.59142;27.55274;331.7993;-199.2707;291.5501;29.27117;385.4554;-275.9427;263.2213;56.51049;203.9087 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 85049 72276 GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIMIPAGK 28 0 Oxidation (M) _GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(ox)IPAGK_ GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(1)IPAGK GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(82.64)IPAGK 0 1 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 1 936.44371 2806.3093 0.20257 -1.3963759 130.29 2.0788E-23 82.639 67.342 82.639 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y13;y1-NH3;y2-NH3;y3-NH3;y4-NH3;y9-NH3;y7(2+);y8(2+);y9(2+);y15(2+);y23(2+);y24(2+);b2;b3;b11;b12;b14;b15;b15-H2O;b14(2+);b15(2+);b18(2+) 479.5;1262.4;625.8;11096.9;1491.2;1519.7;972.6;1109.2;2476.1;1963.2;461.1;633.3;170.5;332.9;59.8;312.1;263;938.1;2445.5;245;388.2;757.7;238.3;288.8;32.8;915.1;1106.5;809.9;273.8;174.5;128;419.7;523.9;538.4 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147.204895019531;204.125305175781;275.116546630859;372.164916992188;485.315795898438;632.318542480469;745.328308105469;874.36962890625;1002.30810546875;1101.35754394531;1202.34020996094;1259.47290039063;1373.53967285156;130.088989257813;187.299102783203;258.042755126953;355.088439941406;985.418029785156;373.112487792969;438.029357910156;502.120910644531;779.562805175781;1221.49487304688;1250.32922363281;115.053298950195;212.077850341797;1078.35656738281;1192.28771972656;1306.33911132813;1434.26806640625;1416.45483398438;653.417907714844;717.695739746094;853.70556640625 34 0.4326293 0.1658537 None Unknown 82.63918;15.29673;9.56641 GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIMIPAGK;SKSPESLSVSTDSQNAEDNKAEGTTPK;NAMQPSTNAENEKTWQEISDEIKK _GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(ox)IPAGK_;_SKSPESLSVSTDSQNAEDNKAEGTTPK_;_NAM(ox)QPSTNAENEKTWQEISDEIKK_ 7633 1366 2611 2642 11555 156 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_C 79799 66757 GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIMIPAGK 28 0 Oxidation (M) _GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(ox)IPAGK_ GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(1)IPAGK GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(45.04)IPAGK 0 1 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 1 936.44371 2806.3093 0.65423 356.19072 130.67 0.00082796 45.042 34.472 45.042 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y8;y9;y10;y12;y13;y2-NH3;y7(2+);y24(2+);b2;b3;b4;b5;b6;b11;b13;b14;b20;b6(2+);b11(2+);b13(2+);b20(2+) 14.7;438.2;2539;259.8;300;307.8;392.2;458.2;71.6;206.3;57.2;342.7;139.9;40;251.4;126;233.5;237.8;116.1;139.9;168.2;48.8;184.7;187.8;229.1;361.4 -0.2644541;0.007452098;0.0492493;0.1321536;0.01481236;0.1664328;0.07767145;0.1840492;0.04554984;0.2378913;-0.2739035;-0.02178322;0.354173;-0.1538061;0.09472802;-0.1554561;-0.07933542;0.3422487;0.1949364;-0.1990464;0.1955862;0.304382;-0.4625513;0.1188066;0.2509778;-0.3357479 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GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIMIPAGK 28 0 Oxidation (M) _GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(ox)IPAGK_ GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(1)IPAGK GGPPGQFHDNANGGQNGTVQEIM(56.99)IPAGK 0 1 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 0 936.44371 2806.3093 0.65423 -1.07567 130.68 1.038E-06 56.986 46.549 56.986 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y12;y16;y1-NH3;y2-NH3;y7(2+);y8(2+);y17(2+);y20(2+);y23(2+);y24(2+);b3;b10;b11;b11-NH3;b12;b12-H2O;b13;b13-NH3;b14;b15;b6(2+);b14(2+);b16(2+);b25(2+) 120.9;192.1;2713.4;345.2;314.8;249;443.6;606.2;415.3;76.4;51.7;35.7;45.4;482.7;147;236.5;168.1;126.7;76.5;230.4;297.1;470.9;216.9;193.3;143.7;76.5;101.9;107.4;99;22.4;274.3;213.2;63.7 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type II cytoskeletal 4 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 521.92806 1562.7624 -0.50922 -1.4645035 90.84 0.003338 63.374 21.753 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y2-NH3;y3-NH3;y4-NH3;y6-NH3;y7(2+);b2;b3;b6;b7;b7-H2O;b8;b9;b10;b10-H2O;b11;b11-H2O 667.2;242.1;864;1921.1;4050.7;2114.8;2252.7;898.5;1696.6;275.6;155.1;430.5;119.3;122;1445.2;917.2;1445.2;232.5;184.4;963.7;1269.2;403.4;389.6;565.9;148.2;198.3;559.1;242.8 0.001353975;0.01244172;0.06051677;0.05341604;0.1116676;0.02901406;0.01583488;0.02174024;0.1465975;0.03234826;-0.1909944;-0.004199033;-0.1911856;-0.2258437;0.1651116;-0.1264413;0.2014971;-0.1196112;-0.05856178;0.1936757;-0.02106106;-0.03760719;0.1149338;0.1869347;0.01559393;0.1874023;0.1935769;0.01540963 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processed 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 433.21546 864.41637 -0.01558 -1.303127 99.989 0.0066096 96.19 74.488 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y4-H2O;y4-NH3;y5-H2O;y6-H2O;y6-NH3;y6(2+);a2;b2;b3;b4 282.8;621.2;2159.3;2727.1;1273.8;332.1;255.9;1210.9;1006.1;627;115;303.9;59.5;2539.3;3104.9;562.7;259.3;290.8 0.03205466;-0.00851825;0.01127556;0.1288838;0.07959688;-0.01900006;0.4180203;0.08805582;0.09391156;0.04734853;0.09897098;0.001710419;0.2674032;-0.01997885;0.01666274;0.02871298;0.1628214;0.2273291 217.9392;-36.37894;24.99096;215.4756;114.4886;-146.036;1937.825;405.7307;216.8395;109.0671;170.5938;2.525328;394.386;-57.38037;116.4402;167.8297;607.5364;547.7722 147.080749511719;234.153350830078;451.185668945313;598.136474609375;695.238525390625;130.105255126953;215.716247558594;217.030227661133;433.092468261719;434.123046875;580.155822753906;677.305847167969;678.024169921875;348.182678222656;143.101226806641;171.084091186523;268.002746582031;415.006652832031 18 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GPAPAGEQLRGATGEPEVMEPALEGTGK 28 1 Oxidation (M) _GPAPAGEQLRGATGEPEVM(ox)EPALEGTGK_ GPAPAGEQLRGATGEPEVM(1)EPALEGTGK GPAPAGEQLRGATGEPEVM(86.08)EPALEGTGK 0 1 Q9H6R4-4;Q9H6R4;Q9H6R4-2;G8JLK7;Q9H6R4-3 NOL6 Nucleolar protein 6 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 11 0 922.45187 2764.3338 -0.020552 -0.72425357 130 1.6016E-28 86.08 70.784 86.08 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y8;y9;y10;y13;y1-NH3;y2-NH3;y10-H2O;y11(2+);y13(2+);y19(2+);y21(2+);y23(2+);y24(2+);y25(2+);y26(2+);a2;b2;b3;b4;b5;b9;b15;b15-H2O;b6(2+);b8(2+);b12(2+);b15(2+);b17(2+);b18(2+) 413.3;148.4;304;968.1;580.7;581.8;2243.7;812.9;1017.4;325.3;296.2;195.1;290;360.5;2350.6;347.1;711;582.4;344.4;1614.8;956.6;1024.9;1930.5;1061.4;308.2;465.3;404.3;479.9;309.5;1061.4;370.6;451.3;1142.4;435.3;577.8 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Unmodified _HCSQVDSVRGFGGK_ 0 0 Q14247;Q14247-3;Q14247-2;H7C314 CTTN Src substrate cortactin 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 0 511.91241 1532.7154 -0.061312 -1.9824152 74.766 0.0022539 64.827 39.126 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y6;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-NH3;y9-NH3;y10-H2O;y10-NH3;y6(2+);y8(2+);y10(2+);y13(2+);a2;b2;b4;b9(2+);b13(2+) 429.8;15.8;110.8;123.1;64;175.1;316.1;99.1;69.9;51.1;26.5;183;227.8;1461.3;169.7;114.1;200;229.6;133.2;177.7 0.1504781;0.0568448;-0.0332846;0.06654738;0.1078337;0.1073999;0.08517169;0.09517607;0.207017;0.198886;-0.009359132;0.1192286;-0.1573325;0.358272;0.1121364;-0.06781686;-0.08178286;0.1433751;0.156154;0.06691686 1023.923;278.5453;-53.56561;82.4238;116.9098;105.1461;655.1614;508.9288;228.6873;198.2253;-9.316969;383.3005;-389.0665;701.2339;160.4875;-251.0158;-274.2747;279.4596;291.8277;96.38792 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_HCSQVDSVRGFGGK_ 0 0 Q14247;Q14247-3;Q14247-2;H7C314 CTTN Src substrate cortactin 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 511.91241 1532.7154 -0.24462 -2.1781462 62.564 4.7494E-20 109.6 83.188 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y12;y1-NH3;y7-NH3;y8-H2O;y9-NH3;y10-H2O;y8(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);b2;b4;b5;b6;b9(2+);b13(2+) 322.9;137.9;158.6;143.1;154.6;179.7;140.3;249.3;153.1;92.9;443.6;260.3;193;206;40.1;392.8;137.8;485.3;597;397.1;2178.4;285.7;325.7;157.2;208.5 0.06290793;0.09187898;-0.07290608;-0.15411;0.1019693;-0.03182625;0.02016066;0.08769207;0.02347659;0.3924028;-0.02688885;0.1016588;-0.07097043;-0.07215782;0.216281;0.05552765;0.09532446;-0.0974626;-0.2520604;0.004276716;0.2305333;0.3458832;0.0295035;-0.1854598;-0.06314906 427.7999;450.2936;-279.0891;-331.1347;164.1371;-44.1757;24.96902;95.07085;22.98204;317.4162;-206.6575;144.5482;-89.89202;-79.68663;215.5663;137.3863;165.7215;-157.4726;-360.5562;14.34694;449.4203;565.2518;40.5684;-346.3746;-90.94369 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IAVEPVNPSELPK 13 0 Unmodified _IAVEPVNPSELPK_ 0 0 B4DK30;Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 696.89029 1391.766 0.044678 -2.0002095 132.33 0.0022319 69.352 69.352 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y2-NH3;y10-H2O;y10-NH3;y9(2+);a2;b2;b3;b4;b8(2+);b11(2+);b12(2+) 485.2;978.1;467.6;797.7;1049;247.1;4909.6;1244.5;460.1;253.1;504.7;347.1;386;359.5;1578.1;929.4;3033.2;827.1;1005.9;370.4;314.3;359.6 -0.0166514;-0.02573142;0.1406232;0.08294998;0.04262547;0.2779095;0.2111665;0.150244;0.1483454;0.09988791;-0.09451581;-0.0783883;0.1206363;0.1077037;-0.1026926;-0.07979352;0.05377772;0.03134081;0.06252033;0.4683146;0.1296886;-0.4853479 -113.1751;-105.374;393.7823;123.7516;54.34307;314.6583;215.4035;135.4241;122.7513;78.06247;-726.0351;-344.9925;110.5283;98.58916;-209.2023;-507.5493;290.5731;110.2907;151.3161;1141.497;225.4743;-777.3989 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_IDEPLEGSEDR_ 0 0 P61978-3;P61978-2;B4DFF1;P61978;Q5T6W5 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 630.29114 1258.5677 -0.17116 -1.8099515 91.828 0.0041726 78.342 5.1084 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y5;y6;y8;y9;y10;y1-NH3;y9-H2O;y10-H2O;y8(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b6 517.9;953.1;558.6;2083.7;371;212.6;270.3;77.1;149.5;778.6;494.7;1375.9;517.8;273.7;284.4;213.3;124.7 -0.04065475;0.06772507;0.1248445;0.1171411;0.07642122;0.3106396;0.0631062;0.3972774;0.267116;-0.01335273;-0.01975858;0.02587625;0.02696928;0.3167604;0.07374328;0.1745474;-0.3865702 -232.1012;120.256;180.3696;129.8244;74.09554;271.0216;399.3323;392.1574;236.7602;-29.55925;-98.23147;112.9512;127.7676;885.1909;216.8432;383.5877;-554.0423 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 59854 50760 IFYIDRNASK 10 1 Unmodified _IFYIDRNASK_ 0 0 Q1ED39;H3BNU8 KNOP1 Lysine-rich nucleolar protein 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 409.55578 1225.6455 -0.096471 -2.4078937 90.406 0.011065 72.243 28.946 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y5-H2O;y6-H2O;y6-NH3;y7-H2O;y7-NH3;y8-H2O;y8-NH3;y6(2+);y7(2+);y8(2+);y9(2+);a2 396.6;300.8;101.2;560.2;1074.4;270.5;503.3;18.3;53.9;277.2;320.3;159;152.2;262.1;115.9;95.2;364.8;343.7;504.4;277.2;681.7 0.04563498;-0.02971271;-0.1393472;-0.1060565;0.1869308;0.1651763;-0.01710797;0.2810574;0.006360261;-0.09272193;0.2246264;0.05245299;0.06320696;0.09678309;-0.08092301;0.084367;-0.4739811;-0.4839205;-0.1127787;-0.1201367;-0.05908299 310.3003;-126.8827;-242.147;-153.6029;232.7181;170.9307;-131.4952;1302.077;29.29485;-166.3448;334.2069;77.90736;80.48118;123.0846;-85.31046;88.86449;-1369.278;-1201.672;-233.0781;-215.5274;-253.3316 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_IHTGERPHVCPDCGK_ 0 0 Q8IWY8-2;Q8IWY8;Q8IWY8-4 ZSCAN29 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 29 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 441.45825 1761.8039 -0.33091 -1.2557449 54.525 0.019141 43.305 21.491 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y9;y1-NH3;y2-NH3;y5-NH3;y8(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);a2;b2;b8;b8-H2O;b8(2+) 170.5;121.5;455.2;128.8;271.6;60.5;72.5;182.6;14.4;160;132.1;108.6;93.3;126.5;105.1;197.1;102.5;38.2;311.4 0.01829123;-0.02118865;0.118743;-0.07239258;0.1563051;0.1301296;0.1781391;-0.1593199;-0.01976839;0.2218581;-0.2278636;-0.44451;-0.2562268;-0.141079;-0.07310165;0.09944054;0.1840029;0.2645636;0.2147498 124.3502;-103.7868;326.1757;-151.0494;271.3214;176.7716;166.5977;-1223.227;-105.6413;396.8865;-467.9569;-655.38;-362.6347;-186.3711;-327.4746;396.0973;198.2168;290.6655;462.2984 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IIEQINEDTGTAR;AVGKMPMAPTTPSR;IADVTSGLIGGEDGR _IIEQINEDTGTAR_;_AVGKM(ox)PMAPTTPSR_;_IADVTSGLIGGEDGR_ 9733 1122 3303 3340 14680 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 86400 73110 IIETENMMDRIVTGLSESSVK 21 1 2 Oxidation (M) _IIETENM(ox)M(ox)DRIVTGLSESSVK_ IIETENM(1)M(1)DRIVTGLSESSVK IIETENM(41.51)M(41.51)DRIVTGLSESSVK 0 2 C9J2I1;H0YGM5;B7Z637;B7Z441;Q8IUR7-3;F5GWK4;Q8IUR7-2;A8MTG8;Q8IUR7 ARMC8 Armadillo repeat-containing protein 8 3 HCD ITMS MSMS 11 0 795.3943 2383.1611 NaN -418.18659 133.38 0.032471 41.513 7.8062 41.513 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y16;y1-NH3;y2-NH3;y17(2+);y18(2+);y19(2+);a2;b2;b3;b8;b8-H2O;b8-NH3;b16;b11(2+);b16(2+) 1610.1;429.9;33.6;942.8;699.6;1164.3;866.7;951.8;1999.6;1873.2;916.1;1534.8;1021.2;1078.3;81.1;1316.2;911.3 0.0517385;0.04083723;-0.00422158;-0.001879697;0.06686991;0.3953215;0.4615192;0.3763094;-0.07488129;-0.01801598;0.0363569;-0.05053918;-0.00727086;-0.2651376;0.4402518;-0.2428428;0.4862763 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_IIGINGDFFANM(ox)VVDAVLAIK_;_LQGEMSSSIDIVFVVKNNKK_;_KDVLDFGDLTYGGWKALPLK_ 9753 363 3306 3344 14703 40 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_C 80360 66978 IIGINGDFFANMVVDAVLAIK 21 0 Oxidation (M) _IIGINGDFFANM(ox)VVDAVLAIK_ IIGINGDFFANM(1)VVDAVLAIK IIGINGDFFANM(58.76)VVDAVLAIK 0 1 E7EQR6;E7ERF2;P17987 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 9 2 1118.6059 2235.1973 -0.17546 896.08235 134.37 0.00045831 58.755 58.755 58.755 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y13;y14;y1-NH3;y2-NH3;y20(2+);a2;b2;b3;b5;b6;b10;b10-H2O;b10-NH3;b13;b16;b6(2+);b16(2+) 642.4;2709.2;1445.5;1409.3;508;947.8;830.2;720.5;413.5;309.9;656.3;555.3;313;72.8;327.1;121.8;311.5;1346.5;1333.3;3145.7;460.2;596;318.1;308.3;317;153.4;46;1004.9;519.8 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NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-NH3;y6-NH3;y8-NH3;y9-NH3;y6(2+);y8(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2 1365.5;3296.5;824.6;582.1;456.6;1068.6;593.8;436.5;207.9;20.2;750.7;534.9;255.5;75.3;439.2;529;405.7;373.5;471.9;221.4;1524;534.9 0.006938692;0.007319121;-0.03665903;0.02854625;0.05062339;0.1401304;0.177652;0.2247036;0.1263597;0.09408506;0.03045368;-0.04307947;0.09087623;0.1681252;0.1797667;-0.3509181;0.2042163;0.02480186;0.1462238;0.02549152;0.01462677;-0.006693961 47.16802;29.97696;-96.15203;57.64137;80.06538;192.1598;217.6485;233.2753;115.7764;76.58514;234.1586;-189.6253;127.5883;177.6687;167.3288;-959.9885;423.6509;40.34283;222.1665;35.26705;73.44014;-29.46518 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protein 2;Heat shock 70 kDa protein 1-like;Heat shock 70 kDa protein 6;Heat shock 70 kDa protein 1A/1B 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 449.26478 1344.7725 -0.20049 -1.295871 56.502 3.7694E-07 105.46 83.405 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y7-H2O;y8-NH3;y9-H2O;y9-NH3;y6(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);a2;b2;b2-H2O 214.2;181.4;408.4;265.3;424.6;155.8;308.7;382.8;96.1;129.1;85.8;85.4;103.4;52.5;94.7;235;779.4;384.7;604.2;700.5;1476.3;708.9;144.1 0.1274984;0.04247662;0.1648868;0.05703003;-0.01563631;0.06281359;0.1090883;-0.03094769;-0.06954375;0.009808747;0.2453179;0.3103271;0.0628493;-0.4313258;0.2094855;0.2193189;-0.1475343;0.2660681;0.02010571;-0.01409948;0.08277923;0.07072058;0.01846888 867.4227;181.4447;294.3427;82.8456;-19.46051;68.46516;107.1115;-237.8447;-321.6583;45.17902;366.042;462.409;80.02203;-478.7609;209.4135;219.0302;-427.7913;522.1941;35.50317;-22.85665;442.5245;328.8285;93.69836 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y1;y2;y3;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y7-H2O;y7-NH3;y8-NH3;y9-H2O;y7(2+);y9(2+);y10(2+);a2;b6;b10(2+) 1197.3;385.8;618.7;544.4;833.3;222.7;375.3;299.3;1418.2;146.2;246.4;151.6;142.5;67;102.7;319.9;315.5;473.1;736.9;246.4;248.8 0.0947988;-0.09789863;0.1538649;0.03451283;0.01397051;0.1228313;-0.4605383;0.09998789;-0.03068829;0.146106;0.1072334;0.2173081;0.132415;0.2117041;0.04645445;-0.1064244;0.016004;0.4758265;0.141376;0.08610404;0.1019965 644.8108;-354.38;363.6866;56.73598;19.31353;138.5876;-480.765;98.56956;-235.8516;207.1807;151.8385;250.2965;152.3287;225.1621;46.62079;-239.7889;31.52056;792.632;519.699;121.9201;174.5992 147.018005371094;276.253295898438;423.069946289063;608.305725097656;723.353210449219;886.307678222656;957.928161621094;1014.38909912109;130.116943359375;705.210510253906;706.2333984375;868.20263671875;869.271545410156;940.229370117188;996.432067871094;443.825317382813;507.732177734375;600.31201171875;272.034362792969;706.2333984375;584.175109863281 21 0.1832405 0.1025641 None Unknown 65.84172;42.08345;35.71035 IWGAYDGKFEK;TGTGSPMELVGHK;ASLQTRMEFSK _IWGAYDGKFEK_;_TGTGSPMELVGHK_;_ASLQTRM(ox)EFSK_ 10656 983 3613 3654 16050 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 75557 64291 IWGAYDGKFEK 11 1 Unmodified _IWGAYDGKFEK_ 0 0 P61964 WDR5 WD repeat-containing protein 5 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 438.55567 1312.6452 0.11975 -1.5364953 114.6 0.031201 51.252 51.252 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y5-NH3;y6-NH3;y7-H2O;y8-NH3;y9-H2O;a2;b5;b6 684.6;446.6;301.7;484.6;609.9;297.9;143.3;719.3;176.8;380.4;30.9;20.1;110.6;279.7;176.8;380.4 -0.03941751;0.06093887;0.0247472;0.1041194;0.127531;0.008028556;-0.08494864;0.05778217;0.1504198;0.0452217;0.2381821;0.1384619;-0.2796564;0.1122927;0.1292904;0.02409233 -267.8689;144.0081;40.68153;143.9579;143.8909;8.385268;-83.72838;444.3809;254.4471;64.0266;274.3459;147.2525;-280.5659;412.7447;218.7051;34.11084 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Unmodified _KLEELELDEQQRK_ 0 0 Q02750-2;Q02750 MAP2K1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 3 HCD ITMS MULTI-SECPEP 2 0 553.2967 1656.8683 -0.17655 -125.83591 84.913 0.02632 68.171 27.694 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y6;y7;y1-NH3;y6-NH3;y6(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2;b2-NH3;b3;b3-NH3;b5;b5-H2O;b5-NH3;b6;b8;b9;b9-H2O;b6(2+);b10(2+) 68.9;310.6;218.4;227.4;147.3;298.6;160;115.1;145.2;254.5;76.9;366.7;113.9;152.3;178.9;360.4;226.9;134.4;388.2;62.9;29.6;73.6;152.3;199.6 0.1413381;0.0334628;-0.07225953;0.1485312;0.1092431;-0.02118206;0.2535128;-0.347084;0.4024321;0.2199158;-0.1351492;0.008340208;0.01320895;0.02036995;0.09584111;0.04946233;0.2579528;0.1433356;0.0880271;0.2336411;0.2453504;0.2291704;0.494185;-0.3043588 961.6704;59.83004;-104.9604;184.9123;119.2122;-162.8044;322.4859;-862.2112;568.0464;287.4063;-630.5763;34.43834;58.66824;54.87468;270.6562;80.64868;433.4707;240.4211;118.5854;240.7987;223.1865;211.9374;1331.287;-495.2038 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None Unknown 62.08109;16.24015 KSLESINSRLQLVMK;SRTSLTLNQKLEMIK _KSLESINSRLQLVM(ox)K_;_SRTSLTLNQKLEMIK_ 11955 342 4001 4048 17962 32 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_C 73420 60611 KSLESINSRLQLVMK 15 2 Oxidation (M) _KSLESINSRLQLVM(ox)K_ KSLESINSRLQLVM(1)K KSLESINSRLQLVM(55.98)K 0 1 E5RI99;P62888;E5RJH3 RPL30 60S ribosomal protein L30 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 588.00123 1760.9819 0.13845 568.2719 126 0.03965 55.98 46.408 55.98 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y9;y1-NH3;y9(2+);y11(2+);y13(2+);y14(2+);a2;b2;b2-H2O;b2-NH3;b3;b4;b4-NH3;b10;b10-NH3;b12;b12-NH3;b6(2+);b12(2+);b13(2+) 636.6;987.6;111.8;652.6;322.9;463;274.9;712.2;53.1;138;95.9;305.7;366.6;202.3;158.8;98.5;60.7;54.8;42.6;366.6;434;406.2 -0.05913186;0.03144315;0.3024952;0.0220766;-0.05788275;-0.1442457;0.003860635;0.04221371;-0.4382834;0.1156217;0.09205648;-0.05069796;-0.2158112;-0.137482;-0.1128836;0.2394432;0.4440952;0.1503952;0.4736996;0.2580039;-0.0939547;-0.4127141 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Ha2;Keratin, type I cuticular Ha7;Keratin, type I cuticular Ha5;Keratin, type I cuticular Ha8;Keratin, type I cytoskeletal 24;Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 17;Keratin, type I cuticular Ha1;Keratin, type I cuticular Ha3-II;Keratin, type I cytoskeletal 16;Keratin, type I cytoskeletal 13;Keratin, type I cytoskeletal 18 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 404.20341 806.39227 0.073296 -2.0091758 77.153 0.00095246 114.72 46.323 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y1-NH3;y2-NH3;y3-NH3;y4-NH3;y5-H2O;y5-NH3;y6-H2O;y6-NH3;a2;b2;b3 1498.2;8800.5;2068.3;813.8;5389.4;3667.5;717.1;404.8;355;73.4;112.7;110.9;120;255.6;5888;2637.1;353.7 0.1001839;0.03316078;0.01307622;-0.05580594;0.07896409;0.04216431;-0.0252727;-0.03119961;-0.03092894;0.1040463;0.1385288;0.07029829;-0.05653514;0.002187471;0.05872577;0.006689098;0.18455 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LADSGDGAGPSPEEK 15 0 Unmodified _LADSGDGAGPSPEEK_ 0 0 Q92917 GPKOW G patch domain and KOW motifs-containing protein 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 715.32571 1428.6369 0.15587 -1.134049 48.255 1.7076E-13 103.79 86.197 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y13;y1-NH3;y2-H2O;y4-NH3;y7-H2O;y11-H2O;y13-H2O;a2;b2;b3;b4;b8;b9;b12;b12-H2O 92.6;173.7;292.4;487.6;405;209.9;262.9;87.6;553.5;101.4;406.8;36.3;265.8;222.5;128.9;76.2;95.3;256.9;419;115.1;111.6;332.9;229.7;76.2;110.4 0.2301595;0.1956805;0.06151471;-0.02382852;0.04951508;-0.07120804;0.1213983;0.1084243;0.1827445;0.003469167;0.2204757;-0.2924528;0.1846275;-0.004188441;0.04334493;0.1925655;0.0951649;0.1014199;-0.05042455;0.02331719;0.01362807;0.1198494;-0.00712438;0.1925655;0.4814393 1566.962;709.0907;122.4931;-34.71727;66.61453;-87.42919;139.331;109.9265;175.1632;3.068721;177.0459;-2243.103;715.7209;-8.631896;59.76113;187.821;77.53264;645.8542;-272.3018;77.68976;35.19884;174.409;-9.571624;187.821;478.111 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_LISEM(ox)HSFIQIKK_ LISEM(1)HSFIQIKK LISEM(61.24)HSFIQIKK 0 1 Q16666-3;Q16666-2;Q16666;H3BLV7;E7EPR3 IFI16 Gamma-interferon-inducible protein 16 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 3 0 530.62884 1588.8647 0.0037348 -0.83611739 115.58 0.0096778 61.235 43.982 61.235 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y8-H2O;y6(2+);y7(2+);y9(2+);y11(2+);a2;b2;b5;b10;b11(2+) 193.9;183.5;250.7;187.9;129.3;70.5;72.6;92.9;58.6;250.7;130.5;221.4;404.1;625.1;329.3;173.8;28.1;159.7 0.07879233;0.1349217;-0.08347401;-0.3829712;0.1855648;0.02783491;0.06227167;-0.1787443;0.1901958;0.3797764;0.1312642;-0.463487;-0.1839887;-0.06426117;0.009816049;0.2932377;0.0501894;0.1905159 535.8782;490.4945;-214.9313;-608.067;239.0322;32.23472;62.23859;-1372.159;193.6045;977.8592;303.7539;-806.3704;-269.565;-322.5238;43.21098;497.0196;41.73625;289.4724 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(M) _LNVCVSKQPAIM(ox)PGQSYGLEDGSCSYK_ LNVCVSKQPAIM(1)PGQSYGLEDGSCSYK LNVCVSKQPAIM(130.72)PGQSYGLEDGSCSYK 0 1 P14866;A6NIT8 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 21 2 1002.1332 3003.3776 -0.32226 664.89891 131.49 6.6937E-117 130.72 118.48 130.72 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y6;y7;y8;y10;y11;y12;y13;y14;y15;y1-NH3;y10-H2O;y11-H2O;y11-NH3;y13-H2O;y13-NH3;y15-NH3;y8(2+);y15(2+);y19(2+);y20(2+);y21(2+);y22(2+);y23(2+);y24(2+);a2;b2;b2-NH3;b3;b3-NH3;b4;b4-NH3;b5;b5-NH3;b6;b8;b8-H2O;b8-NH3;b10;b11;b12;b12-H2O;b12-NH3;b12(2+);b17(2+) 292.2;422.4;397.7;563.9;776.1;1552.5;941.4;1395.9;849.8;897.4;44.6;74;492.2;103.6;445;352.3;178.8;41.6;158.8;29;281.7;1621.4;745.4;283.9;354.8;1115.3;497.1;318.6;399.5;3478.7;447.7;1396.3;422.4;463.4;308.5;584.3;275.5;272.2;1089.1;384.6;440;445;1115.3;580.7;318.6;399.5;360;941.4 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_LRVAYEGSDSEK_ 0 0 H3BPD5;P78549;H3BRL9;H3BUV2 NTHL1 Endonuclease III-like protein 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 451.89301 1352.6572 0.095119 -2.0242545 63.504 0.00017608 96.82 58.07 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y10;y1-NH3;y5-H2O;y6-H2O;y7-H2O;y7-NH3;y11(2+);a2;b2;b3;b3-NH3;b4;b5;b7;b11(2+) 519.3;272.5;455.2;544.4;401.6;1266.6;254.3;18.9;339.2;241.7;410.7;629.2;131;545.2;1185.6;362.9;313.8;145;1369.7;1290.1;166.4;410.7 0.005855318;0.03817925;0.07908827;-0.06288349;0.00292788;0.1323018;0.04092269;0.1710826;-0.05472088;0.1541064;-0.09768432;0.01967685;-0.04623432;0.3850354;0.2372097;0.005805967;0.02438468;-0.4176307;0.09348089;0.04349766;-0.03697677;-0.07186349 39.80314;138.2719;217.809;-131.4792;5.179857;212.6575;54.47138;157.7805;-420.4739;281.688;-161.634;26.83401;-62.96122;620.6155;980.3661;21.48873;66.04082;-1184.258;212.3579;72.09742;-46.83791;-118.9094 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5047 22282 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_C 80417 67334 LVILANNCPALRK 13 1 Unmodified _LVILANNCPALRK_ 0 0 E5RI99;P62888 RPL30 60S ribosomal protein L30 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 3 494.62554 1480.8548 -0.027626 -1.1023992 131.32 0.00081878 87.713 70.94 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y7-NH3;y8-NH3;y9-NH3;y7(2+);y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);a2;b2;b3 1695.5;4417.6;1664.7;11447.4;19184.6;4480.1;3541.1;4517.3;7577.9;952.9;1145;999.3;1143.2;2301.4;2033.3;11447.4;20565.1;5592.8;21422.1;58231.2;30597.3;5064 -0.07014871;0.04115519;0.0464533;0.3287453;0.04282508;0.05314858;0.1414862;0.1133687;0.1829532;0.09978085;0.005825992;0.1047442;0.03603835;0.1654373;-0.4884849;-0.2505295;-0.2911767;0.123597;-0.3498129;0.03242397;0.03478488;0.1106701 -476.6089;135.7483;111.5991;675.0329;73.28732;71.40119;164.8408;116.5876;175.3503;86.27637;44.78761;124.4983;37.71905;161.19;-1135.423;-514.4276;-557.2061;213.5797;-550.2727;175.1393;163.2135;339.3404 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(Protein N-term) _(ac)MDADDSRAPK_ 1 0 Q01813 PFKP 6-phosphofructokinase type C 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 574.25604 1146.4975 -0.18178 -0.07840514 64.716 0.020659 66.663 50.33 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y7-H2O;y7(2+);y8(2+);y9(2+);a2;b2;b3;b6;b7;b8 185.2;299;208.5;104.3;151;125.5;356.7;174.1;56;72.9;71.3;338.6;76.2;215.6;104.2;119.6;301.7;88.7 0.2394369;0.1024882;0.1431943;0.06204407;-0.05212618;0.1878685;0.151457;-0.04831219;0.09319292;-0.2067205;0.03281416;-0.04160494;0.04534074;-0.1498997;-0.06340843;-0.1521155;0.1334437;-0.325048 1630.227;419.925;256.532;92.14912;-66.11291;218.6452;155.4518;-371.248;120.9848;-523.4687;76.27933;-85.29586;173.6894;-518.2622;-176.0437;-224.571;160.1627;-359.2994 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_C 67127 56514 MDVANLAK 8 0 Unmodified _MDVANLAK_ 0 0 Q9H0H5;H0YIK5;F8VZ41 RACGAP1 Rac GTPase-activating protein 1 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 0 431.22857 860.44259 0.010994 -1.3262881 106.18 0.014947 86.833 22.03 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y1-NH3;y2-NH3;y7-H2O;y7-NH3;a2;b2;b2-H2O;b3 1025.8;517.1;448.7;702.3;1902.4;2941.7;4001.7;897.5;1361.2;245.2;200.1;1172.7;2463.9;486.9;694.6 -0.07948709;-0.07521021;-0.03857055;0.1180959;0.02093235;0.01012264;0.1211721;-0.08987714;0.07290804;0.006176276;0.1684756;0.01033148;-0.05835254;-0.001900621;0.03429234 -540.0221;-344.6451;-116.4315;265.2894;40.54355;16.44961;165.9237;-690.4271;362.6356;8.669764;236.2201;47.16073;-236.1179;-8.29726;99.07964 147.192291259766;218.225128173828;331.272552490234;445.158813476563;516.293090820313;615.372314453125;730.288208007813;130.176132202148;201.05046081543;712.392639160156;713.21435546875;219.069458007813;247.133056640625;229.066040039063;346.108825683594 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_M(ox)EPENKYLPELMAEK_;_GAPGPGPEPGSERGHGGHGK_;_YLEYERRHGSGEWR_ 15257 1045 5157 5219 23026 125;126 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 83632 70538 MEPENKYLPELMAEK 15 1 Oxidation (M) _MEPENKYLPELM(ox)AEK_ MEPENKYLPELM(1)AEK M(-51.59)EPENKYLPELM(51.59)AEK 0 1 Q07666;Q07666-3;Q07666-2;E7ET98 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 3 HCD ITMS MULTI-SECPEP 11 1 613.2952 1836.8638 -0.0088521 547.12725 130.64 0.015208 60.631 26.843 51.587 0.99999 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y11-NH3;y7(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b7;b8;b12;b12(2+) 999.8;610.1;826.4;3788.4;1044.3;446.3;110.1;67.2;603.4;89.3;1635.3;1409;4618.1;3850;740.7;982.5;867.7;259.1;25.9;884.4 0.04880881;0.03812147;0.044152;0.1697824;0.2704479;0.1649532;0.1421184;0.4172236;-4.864184E-05;0.3458747;0.06268103;0.2262371;-0.0002330605;0.07533952;-0.01409785;0.09905064;-0.1118492;0.05265914;0.2176746;0.0844604 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transduction-associated protein 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 30 2 613.2952 1836.8638 -1.5131 1088.8658 132.86 0.001667 88.311 67.602 77.859 1 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y8-H2O;y10-NH3;y11-NH3;y12-NH3;y7(2+);y8(2+);y11(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b6;b6-NH3;b7;b8;b12(2+);b13(2+) 8462.5;7471.2;5495.9;6383.5;4195.4;41614.8;5185.8;7114.1;1525.6;377.1;348.4;6462.4;1771.8;406.2;244.8;142.8;13750.4;2961.4;2967.4;15839.7;21678.1;13619.8;7920.4;8631;2849.9;7335;2417.4;3436.9;6420 0.02943015;0.02307746;0.1331421;0.09501375;0.1697113;0.1096822;0.1620079;0.1973823;0.142321;0.1422797;0.07122529;0.007946963;0.0923612;0.09990271;0.1757891;0.2269272;0.14991;0.4638841;-0.02727272;-0.001688975;0.02995988;-0.02264136;0.09710401;0.01968808;-0.04262763;0.07154201;0.2391021;0.02916255;-0.4248147 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68507 MEPENKYLPELMAEK 15 1 Oxidation (M) _M(ox)EPENKYLPELMAEK_ M(1)EPENKYLPELMAEK M(65.02)EPENKYLPELM(-65.02)AEK 0 1 Q07666;Q07666-3;Q07666-2;E7ET98 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 9 1 613.2952 1836.8638 0.088631 -1.634187 132.62 0.0073958 71.316 59.63 65.016 1 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y5;y7;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y8-NH3;y7(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b6;b7;b11;b11-NH3;b6(2+);b11(2+);b12(2+);b13(2+) 2911.9;982.2;871.5;7036.3;741.8;871.8;238.6;239.5;13.4;1089.3;1619.3;2487.5;1763.2;3085.5;2028.8;1864.8;1529.5;973.1;48;52.9;941.7;727.7;1011.3;1763.2 0.0381124;-0.005181816;0.1396304;0.05304159;0.1388756;0.1778511;0.3862174;0.1708441;0.4485446;-0.05478192;0.1081761;-0.0155563;-0.1173506;-0.01899031;0.04110986;-0.02646167;-0.02895694;0.08216213;0.05219;0.4328675;0.01467246;-0.3936676;0.05388179;0.3475852 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0.1032864 None Unknown 68.28335;15.84394;12.15469 MGAHYHCIICSATITR;YKTCTSKTEVTNSDEK;EWQGVKDDRYYFER _MGAHYHCIICSATITR_;_YKTCTSKTEVTNSDEK_;_EWQGVKDDRYYFER_ 15304 1248 5172 5237 23087 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 65005 55381 MGAHYHCIICSATITRR 17 1 Unmodified _MGAHYHCIICSATITRR_ 0 0 Q7Z2T5;Q7Z2T5-2 TRMT1L TRMT1-like protein 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 6 0 512.50002 2045.971 -0.51079 -1.0237093 97.712 0.00084625 74.649 61.494 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y8;y9;y10;y1-NH3;y8-NH3;y9-NH3;y10-NH3;y6(2+);y7(2+);y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);a2;b2;b6;b8;b9;b7(2+);b8(2+);b14(2+) 652.8;338.1;96.3;193.1;68.2;76.2;250.4;169.9;47.9;422.1;598.3;1683.5;1841.4;1470.4;1262.5;1325.6;904.6;370.7;423.4;529.6;95.3;107.9;1187.5;540;241.2 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homolog 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 1 559.53612 2234.1154 -0.018442 -1.2950698 131.98 0.029471 49.343 31.109 49.343 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y2-NH3;y9-NH3;y11-NH3;y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);y14(2+);y15(2+);a2;b2;b9(2+);b13(2+) 2385.3;2011.4;326.4;140.2;51.6;104;1425.1;457.6;520.8;191.9;3558.4;1046.2;1591.2;2172.2;1537.6;616.1;508.5;333.7;1289.5;598.2 0.01934409;-0.1231686;0.1683204;0.1933354;0.08294132;0.130051;-0.006655698;-0.07938993;0.1470203;0.375484;-0.2136542;-0.1422478;-0.4622764;-0.1351937;0.1763441;-0.4563094;-0.0729566;-0.003640122;0.1322191;0.01882353 131.5088;-564.2866;156.6591;160.6503;62.99425;89.96057;-51.16111;-394.5768;139.0352;288.9828;-397.112;-236.1077;-701.1284;-186.8539;212.3909;-507.3246;-411.8533;-17.75083;255.9348;24.61089 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adenosine deaminase 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 0 861.4538 1720.893 -0.32009 -1.1575538 131.97 0.017683 64.842 40.312 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y7;y9;y10;y11;y12;y7-NH3;y9-NH3;y10-NH3;y11-NH3;y12-NH3;y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2;b3;b5;b8;b15 520.6;326.2;638.9;314.3;188.7;74.7;247.5;678.8;411.4;236.4;106.5;281.9;247.3;353.5;125.2;50.8;157.3;174.4;294.2;226.2;41 0.00316849;-0.04855521;0.1675933;0.1215217;0.1772403;0.2792817;0.07797186;0.1351848;0.1949482;0.2349198;0.06999332;0.2102986;0.1913522;-0.2969628;0.03408718;-0.04637159;0.07303949;-0.221187;0.0789845;0.09915911;0.1249436 18.09368;-63.84719;175.2342;114.9153;153.2555;217.2649;104.8942;143.9052;187.38;206.1752;55.17255;439.4266;361.6438;-512.7647;52.98547;-287.8065;386.4601;-657.5923;139.5119;114.8609;80.73043 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Unknown 114.9683;61.55986;51.43592 MIFDVESMKK;PFVDYLSVCK;DEKFSVFMPK _MIFDVESMKK_;_PFVDYLSVCK_;_DEKFSVFMPK_ 15371 815 5196 5265 23197 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 86422 73608 MIFDVESMKK 10 1 Unmodified _MIFDVESMKK_ 0 0 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 28 0 409.87525 1226.6039 -0.54016 -1.0970818 131.57 0.023554 52.167 22.616 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y5-H2O;y5-NH3;y7-NH3;y8-NH3;y8(2+);a2;b2;b4 2605.5;2415.8;3191.7;2720.8;3514.4;5182.4;1602.1;3868.1;773.9;419.6;594.1;195.7;762;16823.3;3651.4;1018.5 0.04285788;0.1066014;-0.0112237;0.07427711;0.03642882;0.1328909;0.1308702;-0.07017804;-0.03760594;0.02404637;-0.1028257;0.07416977;-0.09971938;0.01108646;0.05846079;0.1407562 291.4116;387.499;-22.75268;119.3689;50.50055;158.9062;133.0853;-539.1823;-62.22544;39.72818;-125.4745;76.74964;-202.5389;51.06005;238.5441;277.5784 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Unmodified _MILIQDGSQNTNVDKPLR_ 0 0 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 18 1 1021.5386 2041.0626 -0.083108 491.52017 130.03 2.8959E-05 88.637 66.823 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y5;y7;y9;y10;y11;y12;y13;y14;y3-NH3;y10-NH3;y11-H2O;y12-H2O;y13-H2O;y13-NH3;y14-NH3;y15(2+);y16(2+);a2;b2;b3;b4;b6;b10;b12;b13;b6(2+);b7(2+) 106.1;572.7;160.5;124;306.7;208.6;141.5;57;38.8;106.4;31.5;96.5;65.7;31.2;53.1;60.4;24.2;17.8;108.7;232.2;371.9;743.1;901.3;176;64.2;117;47.4;86.7;901.3;80.5 0.1396126;-0.01063844;-0.02505043;0.2551885;0.1513199;0.2070748;0.06423625;0.2007568;0.3743202;-0.2537661;0.2911395;0.07185176;-0.01089684;0.4438543;0.307359;0.3970462;0.2392161;0.1906158;0.1136643;0.02160207;-0.01666928;0.07371958;0.1209794;0.238338;0.151892;0.1079755;0.1520727;0.1045198;-0.3985347;0.1697228 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_C 77712 64406 MILIQDGSQNTNVDKPLR 18 1 Unmodified _MILIQDGSQNTNVDKPLR_ 0 0 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 681.36148 2041.0626 0.20057 -1.1528391 132.07 9.9662E-74 127.18 109.44 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y12;y13;y8-NH3;y9-H2O;y9-NH3;y12-H2O;y12-NH3;y13-NH3;y8(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);a2;b2;b3;b4;b6(2+);b7(2+) 2242.8;8924;6245.3;2199.4;1754.9;1226.8;2516;1508.5;346.3;1287.7;515;1095.4;764.8;1040.6;282.8;383.1;205.2;1449.3;803.4;4755;3659.6;7546.9;4385.1;6416.3;27028.3;18828.2;9835;9972.7;9835;1481.1 -0.02899704;-0.02611086;0.006138539;0.1681524;0.00115369;0.04682772;0.107995;0.1791207;0.348538;0.1124794;0.1185484;0.07882135;-0.1683581;0.02110182;0.4057477;0.2626881;0.0807688;-0.3613096;-0.1166865;0.1951318;-0.1057277;-0.3619004;0.2795579;0.01116506;0.04523563;0.09050425;0.06504065;0.1391559;-0.4544734;-0.0308692 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 86262 73053 MILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYK 25 2 Oxidation (M) _M(ox)ILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYK_ M(1)ILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYK M(47.82)ILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYK 0 1 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 1 948.83565 2843.4851 -0.40709 -0.37199533 133.21 0.038544 47.822 24.537 47.822 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y11;y14;y1-NH3;y6(2+);y11(2+);y19(2+);y20(2+);y21(2+);y22(2+);y23(2+);a2;b2;b3;b4;b14;b14(2+);b16(2+);b17(2+);b18(2+);b24(2+) 226;459.5;864.5;168.7;33.6;267.2;229.8;336.6;672.4;587.7;753.4;216.7;733.3;739.2;801.6;1092.8;203.8;16.4;237.9;244;516.4;338.8;102.7 0.05581259;0.06370595;-0.0180822;0.2486701;-0.00159534;0.02747821;0.4297748;0.1044747;0.07244007;0.09482271;0.07284193;-0.2038517;-0.4300081;-0.02808706;0.007629568;0.02846113;0.05734932;0.04690966;0.1974422;-0.3545489;-0.4040696;0.1881119;-0.2882748 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_M(ox)ILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYK_ M(1)ILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYK M(44.34)ILIQDGSQNTNVDKPLRIIGDPYK 0 1 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 711.87856 2843.4851 -0.32695 -1.2077537 133.06 0.011059 44.341 30.625 44.341 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y10;y11;y1-NH3;y10(2+);y11(2+);y12(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);y19(2+);y20(2+);y21(2+);a2;b2;b3;b4;b5;b7;b10;b14(2+) 1442.5;1031.2;6730.1;968.8;86;1133.9;828.1;1460.8;793.2;725.2;1514.6;616.2;1415.3;1781.2;1057.8;7581.5;4499.2;4511.9;1213;797.7;1428.6;852.2;569.4 0.02584433;0.1543432;0.03456062;0.3105674;0.2650275;0.05564594;-0.1992324;-0.02113562;0.03353463;-0.1250281;-0.287224;0.2117177;0.02324573;-0.01906889;-0.1288182;-0.03895131;-0.03439314;0.0416142;-0.01015556;0.1793729;0.4564173;-0.03553758;-0.04828535 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specificity protein kinase CLK1 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 483.73369 965.45282 -0.016126 -2.2492348 94.598 0.035301 69.598 50.62 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y1-NH3;y2-NH3;y5-NH3;y6-H2O;y6-NH3;a2;b2;b3 411.5;377.7;2452.6;113.4;381;1300.8;549.1;178.3;77;199.4;235;92.1;2419.1;513.9;289.9 -0.07439066;0.08403051;0.04655388;-0.1512956;0.1590423;0.1178951;0.2212462;-0.1207151;-0.1920456;0.3044292;0.1773988;-0.02852704;0.08103275;0.08713206;0.007853208 -505.4153;385.3446;147.7169;-351.5388;268.1389;163.2404;264.9026;-927.1021;-953.9536;528.5577;251.9341;-40.44452;373.3267;355.5762;20.98853 147.187194824219;218.065887451172;315.156127929688;430.380920410156;593.133911132813;722.217651367188;835.198364257813;130.206970214844;201.315414428711;575.961975097656;704.147583007813;705.337524414063;217.055877685547;245.044692993164;374.166564941406 15 0.3749691 0.09493671 None Unknown 69.59818;18.97834 MLEYDPAK;PDSLAVYAM _MLEYDPAK_;_PDSLAVYAM_ 15457 434 5227 5298 23327 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86427 73136 MMLDDIVSR 9 0 Unmodified _MMLDDIVSR_ 0 0 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 0 540.26483 1078.5151 0.032965 -0.97746513 133.41 2.1962E-86 155.84 94.934 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y3-NH3;y4-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y7-H2O;y7-NH3;y8(2+);a2;b2;b3;b4;b7;b7-H2O;b6(2+) 8611.2;8957.3;13705.7;19034.3;31480.3;50612.2;96639;23598.4;1681;1229.6;6714;8841.3;2176.7;1150.1;1601.5;2498.8;1993.7;6849.5;76656.5;51914;4278.3;1893.4;45061.8;1993.7;2539.1 0.07711258;-0.01024377;0.1041601;0.07585839;0.09340201;0.1182698;0.1317772;0.1582237;0.003795292;-0.1256974;0.06058872;0.146184;0.05925802;-0.07552238;0.1745455;-0.02582119;-0.08227192;-0.4225295;0.03904029;0.04930525;-0.06993888;0.08862647;0.04627616;-0.1290224;0.1400608 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_MM(ox)LDDIVSR_ M(0.033)M(0.967)LDDIVSR M(-14.64)M(14.64)LDDIVSR 0 1 Q92945-2;Q92945;E7EP96 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 8 0 548.26228 1094.51 -0.45153 -1.9815561 132.69 0.033161 86.882 44.017 14.638 0.96677 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y3-NH3;y6-H2O;y7-H2O;y7-NH3;y8(2+);b2;b3;b4;b5 1802.2;5013.9;3313.1;4630.9;5800.5;9548;21310.9;2150.3;298;462.7;690;1193.8;360.6;375.9;265.6;1980.8;12007.9;1003.8;1114.7;484.3 0.01757279;0.1331583;0.05609495;0.02748803;0.03023062;0.01994221;0.07513656;0.117921;0.05929151;0.02838588;-0.04460537;0.03690058;0.04325203;0.1110807;0.2181431;-0.01583142;0.02374258;0.02809464;-0.1478432;0.07877636 100.3578;508.2033;155.3174;57.95788;51.29919;28.31343;91.9252;122.2792;375.1841;116.2822;-181.9372;107.2205;63.02172;138.969;272.6119;-32.79371;85.08073;71.64458;-291.4073;126.6211 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Acetyl (Protein N-term),Oxidation (M) _(ac)M(ox)NPQIRNPMK_ M(1)NPQIRNPMK M(46.26)NPQIRNPM(-46.26)K 1 1 Q9NRW3 APOBEC3C DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 643.82083 1285.6271 -0.55117 -2366.0549 89.321 0.0042027 61.593 39.255 46.26 0.99998 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y5;y7;y8;y9;y1-NH3;y7-NH3;y8-NH3;y9-NH3;y8(2+);b2;b4;b5;b7 276.6;144.8;226.1;310.8;83;214.6;188.9;490.6;77.9;145.4;77.5;316.7;116.8;341.5;147.6;311.1 0.01806235;0.06490883;-0.357038;0.01159013;0.08806951;0.03719567;-0.07246478;-0.06148053;-0.008975197;0.01235555;0.2302098;0.1327402;-0.08083413;0.09215274;0.37983;0.05249397 122.794;173.0251;-729.2353;17.95976;99.35588;37.81937;-66.01746;-472.3903;-10.32255;12.78372;213.0917;269.7184;-265.747;174.1638;591.7169;57.53501 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2-O-methyltransferase fibrillarin 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 2 803.37887 2407.1148 0.043542 -0.09327399 125.68 0.015458 61.477 61.477 26.345 0.99769 2 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y7;y8;y9;y10;y12;y4-H2O;y10-NH3;y12-NH3;y6(2+);y12(2+);y13(2+);y15(2+);b2;b2-NH3;b3;b3-NH3;b10 48.9;455.6;128;356.2;87;186;70.9;132.3;115.5;41.4;44.2;156.7;166.1;327.8;79.2;192.1;143.4;156.7;125.2;41.4 -0.1603142;0.01854343;-0.007283885;0.09632136;-0.02225138;0.1775005;0.1975105;0.3608539;0.1487868;-0.1480083;-0.3962861;-0.2053472;-0.09883279;-0.3308923;0.1442854;0.0186116;0.05300611;0.2486979;-0.2753488;-0.2239337 -914.6214;32.86332;-10.50569;106.1561;-21.80314;154.561;154.6144;240.1869;272.4444;-117.3962;-266.6585;-508.397;-131.4306;-405.3779;153.7695;67.41316;204.6396;615.7243;-710.745;-177.6182 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182.2;312.1;323.9;205.6;496;19.2;16.4;132.7;117.6;168.1;17.9;265.8;315.5;124.7;445.4;287;125.2;17.9;157.1;205.7;260.5 0.09783401;0.054249;-0.1167199;0.08770539;-0.03966497;0.08410722;0.2169035;0.1298968;0.07236139;0.4638152;-0.09124559;-0.4686448;0.09949356;-0.0485797;0.06132516;0.06514104;-0.07818693;-0.167171;-0.01389436;0.3809609;-0.3960421 558.9841;96.14808;-168.3209;108.7729;-43.70835;65.83462;154.3271;86.44696;107.1644;521.1632;-72.37682;-622.9108;92.55941;-209.2509;235.8251;268.054;-201.3865;-132.6015;-27.6651;507.2976;-493.6567 175.021118164063;564.223388671875;693.436950683594;806.316589355469;907.491638183594;1277.55310058594;1405.47888183594;1502.61865234375;675.2373046875;889.961608886719;1260.70190429688;752.346557617188;1074.91564941406;232.160003662109;260.045013427734;243.0146484375;388.243103027344;1260.70190429688;502.234313964844;750.961364746094;802.26220703125 21 0.1953003 0.1212121 None Unknown 52.7307;11.86737;11.07133 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532.2703 2125.0521 -0.52683 470.96184 88.08 0.0075412 62.525 53.29 62.525 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y2-NH3;y5-NH3;y10(2+);y16(2+);a2;b5;b6;b7;b8;b6(2+);b7(2+);b8(2+);b9(2+);b10(2+);b11(2+);b13(2+);b15(2+) 206.9;221.6;1058.4;581.6;478.4;564.4;876.6;252.7;524.5;154.3;410.1;478.4;252.7;355.7;576.4;498.8;260.5;90.6;385.2;630.9;810.6;892.4;1010.4;444.3;228.3;408.2 0.01644492;0.08839452;0.08126327;-0.0418871;0.007443584;0.09480462;0.04156132;-0.08501704;-0.03747845;0.05223238;0.01150361;0.4416105;-0.05031695;0.0646741;-0.07380097;0.04101909;0.06075202;0.1292172;-0.0537636;-0.06684636;0.05118752;-0.1631047;-0.1762376;0.1067743;-0.2440008;0.009632554 111.7969;405.3651;295.406;-107.8738;14.41698;150.4209;60.46717;-100.3158;-288.0216;259.7707;23.04059;855.3262;-59.37144;234.255;-114.347;52.43016;67.84743;126.2613;-137.2374;-149.107;99.93217;-297.6605;-305.7136;166.7761;-325.7242;11.07318 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Unmodified _MTGEEGKEVITEIEK_ 0 0 Q5UIP0-2;Q5UIP0;H7BZN3;C9J1D6;B4DS49 RIF1 Telomere-associated protein RIF1 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 8 0 846.92166 1691.8288 0.035197 -1.0166599 131.23 0.014343 52.372 29.833 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y8;y9;y12;y13;y1-NH3;y2-H2O;y3-NH3;y4-NH3;y12-NH3;y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b9;b8(2+) 304.5;327;207.5;272.5;213.3;215.8;197.2;166.8;92.9;82.8;179.1;465.3;153;213.3;60.1;190.8;107.2;73.2;98.4;281.3;199.1 -0.009357695;0.03891167;0.1257527;0.1128649;0.1694545;-0.1217257;-0.04221279;-0.3491052;0.1221687;0.1781783;-0.05082989;0.0155296;-0.3221831;0.4135863;-0.04354056;0.375015;-0.08296201;0.07064401;-0.1669715;-0.02439524;-0.3188589 -63.60493;140.9248;323.1774;217.8147;273.6844;-166.1703;-43.9457;-320.5833;87.03928;121.9923;-390.5873;60.1621;-864.8395;825.7821;-31.39771;513.3657;-404.3308;303.1609;-775.7028;-25.37328;-738.094 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y1;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y7-NH3;y7(2+);y8(2+);a2;b2;b2-H2O;b4;b5;b6;b6-H2O;b7 156.1;566.7;363.1;1780;773.1;600.3;178.2;34.4;172.3;138;749;710.1;420.5;342.2;21.4;549.1;446.8;99.3;165.8;172.7 -0.01822305;0.1501991;-0.04927578;0.2251787;0.04168103;0.2232804;0.2045611;-0.01691688;-0.03221417;0.05537383;-0.08946402;-0.3470231;-0.0347637;0.05110857;-0.142409;0.03756091;0.03126234;0.03952066;0.08040861;-0.1464349 -123.8559;322.2277;-85.04466;353.9668;52.14011;244.4856;199.3057;-14.84361;-247.5757;61.77309;-195.6192;-674.962;-157.2092;205.2229;-615.8967;75.09859;50.97855;54.41212;113.5283;-174.4122 147.13102722168;466.127044677734;579.410583496094;636.157592773438;799.404418945313;913.265747070313;1026.36853027344;1139.67407226563;130.118469238281;896.407104492188;457.337615966797;514.13720703125;221.13020324707;249.039245605469;231.222198486328;500.154632568359;613.244995117188;726.32080078125;708.269348144531;839.5908203125 20 0.2115808 0.1098901 None Unknown 63.18534;13.56435;9.778946 MTHNLLLNYGLYRK;KVILMQLSDTISEMK;LMFFRRHMLLMPK _M(ox)THNLLLNYGLYRK_;_KVILMQLSDTISEM(ox)K_;_LM(ox)FFRRHMLLM(ox)PK_ 15741 1358;1086 5314 5396 23749 131 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 86587 73764 MTHNLLLNYGLYRK 14 1 Oxidation (M) _M(ox)THNLLLNYGLYRK_ M(1)THNLLLNYGLYRK M(112.02)THNLLLNYGLYRK 0 1 Q92769;H3BM24;B3KRS5;E5RFI6;E5RJ04;E5RGV4;E5RHE7;E5RH52;E5RG37;E5RFP9;E5RK19;Q13547;Q5TEE2 HDAC2;HDAC1 Histone deacetylase 2;Histone deacetylase;Histone deacetylase 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 1 584.6469 1750.9189 -0.026584 571.76304 131.72 2.664E-20 112.02 94.882 112.02 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y3-NH3;y7-NH3;y8-NH3;y6(2+);y7(2+);y8(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b5;b6;b7;b8;b9;b10;b11;b11-NH3;b6(2+) 1489.5;1511.8;5753;6145.4;19639.8;8134.5;9337.2;1707.8;333.1;1350.4;1488.6;2490.9;1329.7;4279.2;2724.4;1655.5;2158.9;1072.5;286.4;1094.2;2182.6;12299.7;13083.1;3679;4632.6;288;533.3;80.7;250.1;1849.8 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 86618 73794 MTHNLLLNYGLYRK 14 1 Oxidation (M) _M(ox)THNLLLNYGLYRK_ M(1)THNLLLNYGLYRK M(96.37)THNLLLNYGLYRK 0 1 Q92769;H3BM24;B3KRS5;E5RFI6;E5RJ04;E5RGV4;E5RHE7;E5RH52;E5RG37;E5RFP9;E5RK19;Q13547;Q5TEE2 HDAC2;HDAC1 Histone deacetylase 2;Histone deacetylase;Histone deacetylase 1 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 21 1 438.73699 1750.9189 -0.21763 570.91979 131.75 8.0874E-08 96.371 96.371 96.371 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y3-NH3;y7-NH3;y8-NH3;y9-NH3;y6(2+);y7(2+);y8(2+);y9(2+);a2;b2;b2-H2O;b4;b5;b6;b6-NH3;b7;b8 3798.9;8536.4;26643.2;16259.9;55118.5;30844.3;17765.8;2844.3;823;157.2;3722.8;9946.4;6673.5;1429.5;243.6;20037.6;22958.6;23431.6;8861.8;7479.9;2825.6;1027;12754.2;15593.1;6996.5;2733.5;1879.1;1191.7 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envelope pore membrane protein POM 121C 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 0 524.76754 1047.5205 -0.010167 -1.5980019 104.34 0.033202 63.076 30.822 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y3-NH3;y6-NH3;a2;b2;b3;b4 184.4;170.5;211.3;973.6;670;1711.5;157.8;357.6;139.2;141.2;1273.2;347.7;264.9;238.4 -0.06705246;-0.0404171;0.03954897;0.03951091;0.005133074;0.1812891;0.2301107;-0.0391582;0.14862;0.3129956;-0.04515199;-0.07187433;0.06375434;-0.4502988 -382.7501;-147.3852;105.409;69.15764;7.796484;221.5605;250.8683;-247.6305;415.0702;488.2556;-222.2414;-310.8912;163.0199;-940.8094 175.186004638672;274.227783203125;375.195495605469;571.316711425781;658.383117675781;818.237609863281;917.257202148438;158.131561279297;358.059875488281;641.048706054688;203.166412353516;231.188049316406;391.083068847656;478.629150390625 14 0.2669212 0.08588957 None Unknown 63.07553;32.25393;20.03047 MVCSPVTVR;AEIVSASESR;DSATDTLGLR _MVCSPVTVR_;_AEIVSASESR_;_DSATDTLGLR_ 15774 34 5324 5407 23790 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_NADDSTKKPNAETTVASEIK_ 0 0 Q7Z5K2;Q7Z5K2-2;Q7Z5K2-3 WAPAL Wings apart-like protein homolog 3 HCD ITMS MULTI-SECPEP 5 2 707.02196 2118.0441 -0.0064056 947.20143 81.472 0.025839 48.372 25.938 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y5;y7;y9;y12;y1-NH3;y12-NH3;y13(2+);y17(2+);y18(2+);a2;b2;b3;b4;b8;b6(2+);b10(2+);b11(2+);b19(2+) 258;122.5;278.6;168.4;106.2;110.6;366.8;25.4;224.1;120.5;335.6;373;236.5;85.6;91;63.7;86.8;81.1;113.5;81 0.01244712;-0.08294752;0.1414282;0.27223;0.03724524;0.02472562;-0.01674176;0.2423171;-0.02526257;-0.2306695;-0.3269392;0.01113477;0.1108925;-0.04467481;0.3168935;-0.1179109;0.405628;0.4990897;0.2380446;0.00888937 84.61649;-318.6859;258.4734;364.3567;38.10341;19.62938;-128.6808;195.0429;-36.38041;-253.4254;-337.8112;70.43699;596.272;-148.343;762.085;-137.0214;1342.213;931.5585;416.4987;9.006749 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D6RAT0;P61247;D6RG13;D6RB09;F5H4F9;E9PFI5;D6RED7;D6RAS7;H0Y8L7 RPS3A 40S ribosomal protein S3a 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 456.21472 1820.8298 0.028646 -2.247753 130.67 0.0088164 48.405 32.165 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y9-NH3;y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2;b5 1326.6;1825;831.1;1106.4;225.8;1929.6;495.6;110.9;1245.4;105.7;1766.4;2834.9;1600.4;2149;2022.6;532.7;1511.3;509 0.03258872;0.09798495;-0.0275458;0.06787868;0.1022598;0.102117;0.08095078;0.1149409;-0.04883099;0.101887;0.002816874;-0.1679225;-0.1567868;-0.08771569;0.0160796;-0.03027344;0.0105091;-0.09872603 221.571;188.7264;-43.55754;90.82805;116.4242;109.1741;75.48285;94.25448;-375.2331;96.53952;6.015985;-312.7446;-256.8361;-131.4276;22.40037;-122.5069;38.20513;-163.6286 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ankyrin domain family member J;Putative beta-actin-like protein 3 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 1 411.95486 1643.7903 -0.34287 607.46553 77.452 0.00020332 88.092 72.273 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y5-NH3;y6(2+);y7(2+);y9(2+);a2;b2;b2-H2O;b2-NH3;b3;b3-NH3;b4;b4-H2O;b4-NH3;b5;b5-H2O 438.3;395.8;969.3;841.9;519.6;847.6;50.8;75.8;446.2;173.7;325.4;562.9;452.6;143.1;420.8;348;199.5;302.4;332;439.5;702.2;306;137;186.2 0.07053732;0.0408195;-0.06701669;-0.04999438;0.1252561;0.05694274;0.1056783;0.03497891;0.02833271;0.1150644;0.1225637;-0.2887985;-0.07253828;-0.1145254;0.01521587;0.09103119;0.07407022;-0.03495046;-0.06980035;0.06151161;0.05442593;0.09874425;0.08744211;-0.1203882 479.7078;134.6409;-152.1931;-92.68667;192.0223;77.01205;126.3483;39.14834;217.8468;181.1229;331.155;-689.1785;-147.7785;-497.4433;58.95495;379.2858;307.3353;-82.97697;-172.6812;114.7311;105.0423;190.2318;131.4615;-185.9705 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381.2;59.5;1142.8;326.8;637.7;562.8;621.4;59.1;265.6;245.3;243.8;12;21.7;2357.1;1142.8;273.1;562.8;243.8;285.5;364.8 -0.04802347;0.03482527;0.1506031;0.05671603;0.03527204;0.09856991;-0.01390362;0.4092466;0.03899638;-0.01565202;-0.2840824;0.1190162;0.05503192;0.05040908;0.1359989;0.2226122;0.0839657;-0.2913845;-0.04282669;-0.3147214 -326.3332;141.4819;243.2285;80.2991;46.20674;118.1431;-106.8686;1789.092;52.25138;-40.951;-679.6226;594.9872;241.2723;99.58621;219.6423;322.5636;100.6389;-697.0917;-74.37546;-481.1265 147.160827636719;246.146392822266;619.183837890625;706.309753417969;763.352661132813;834.326477050781;130.100158691406;228.745422363281;746.322387695313;382.213256835938;418.000244140625;200.03157043457;228.090469360352;506.185363769531;619.183837890625;690.134338378906;834.326477050781;418.000244140625;575.817565917969;654.134399414063 20 0.3438773 0.1205674 None Unknown 55.19601;20.31501 RAYDLAGSCRGVK;AIKYRNMEQQR _RAYDLAGSCRGVK_;_AIKYRNM(ox)EQQR_ 17776 1035 6075 6165 26960 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_C 83283 70211 RAYETMAGAGVPFSANGRPLASGIR 25 2 Oxidation (M) _RAYETM(ox)AGAGVPFSANGRPLASGIR_ RAYETM(1)AGAGVPFSANGRPLASGIR RAYETM(59.54)AGAGVPFSANGRPLASGIR 0 1 O94776;Q68DB1 MTA2;DKFZp686F2281 Metastasis-associated protein MTA2 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 7 1 642.08022 2564.2918 0.099299 390.24632 132.42 8.6096E-08 59.539 51.787 59.539 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y7;y1-NH3;y4-H2O;y11(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);y19(2+);a2;b2;b2-NH3;b6;b7;b8;b9;b10;b11;b6(2+);b7(2+);b8(2+);b9(2+);b10(2+) 7970.4;2176.7;4373.1;25162.4;980.7;1866;2725.9;29644.4;17929.1;239202.9;4229.3;34017;4230.8;21364.6;8713.9;2067.8;415.6;2694.8;17637.3;9398.5;23893.2;7974.5;68073.5;14477.8;1786.7;5569;10482.3;8475.4;5103.3 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MULTI-MSMS 7 0 642.08022 2564.2918 0.099299 0.27509681 132.46 0.0098489 42.941 33.377 42.941 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y7;y1-NH3;y7(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);y19(2+);y24(2+);a2;b2;b2-NH3;b6;b7;b8;b9;b10;b11;b11-H2O;b7(2+);b8(2+);b9(2+);b10(2+);b14(2+) 2183.7;4355.4;249.7;1114.7;8538.4;4625.1;79597.1;10998.8;1837.5;4750.9;3505.1;236.5;467.8;311.8;1843.4;5892.1;2660.1;7989;2732.3;24083.3;4021.3;359.5;1756;5042.2;1220.4;2045.7;3215 0.0559639;0.2126765;0.01853528;0.07762784;0.0618934;-0.04043529;-0.08357241;-0.06701493;-0.4689903;0.1082089;-0.1031537;0.4923858;-0.03450245;0.1685115;0.1548103;0.06429798;0.09176821;0.1130488;0.1107949;0.1882279;0.09465452;0.2657305;-0.1540604;-0.06550874;-0.002701354;0.194737;-0.2833201 319.6786;298.1929;117.2571;217.3589;103.1945;-60.0455;-115.7544;-83.76775;-561.0406;125.2617;-114.6671;408.7511;-172.3528;739.1603;733.823;83.69189;109.3416;126.1312;114.5381;183.769;84.25528;240.427;-366.5108;-145.9754;-5.578758;379.949;-389.1099 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642.08022 2564.2918 0.5528 1.3670162 132.45 0.00029769 56.485 41.083 56.485 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y5;y7;y13;y14;y1-NH3;y13-NH3;y7(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);y19(2+);y21(2+);a2;b2;b2-NH3;b6;b7;b8;b9;b10;b11;b15;b6(2+);b7(2+);b8(2+);b9(2+);b10(2+) 17316.5;5687;51822.1;271.5;162.5;2316.7;990;2336.9;12254.2;74732;48890.1;672705.1;17296.2;84088.3;13776.7;47855.2;21620.7;5728.7;3760.7;876.8;2713;41470.2;19332.9;48512.7;14558.2;155796.1;34569;87.6;5021.7;20737.9;35578.9;22701.3;23406.6 0.02254715;-0.3334531;0.05563302;0.144641;-0.123518;0.09905591;0.2716564;-0.0470975;-0.1122629;-0.143734;-0.1245417;-0.1325836;-0.1072268;-0.1336043;-0.1679038;-0.1335514;-0.04248472;-0.2073668;0.05494457;-0.0348576;-0.06171188;0.07766468;0.04294009;0.1333125;0.1034707;0.1108353;0.1366467;0.0744032;0.1175743;-0.07001501;-0.1055478;-0.1044775;-0.1028093 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y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y2-NH3;y6-NH3;y7-H2O;y7-NH3;y8-H2O;a2;b3;b4;b5;b7;b6(2+);b9(2+) 41;143.7;106.8;277.2;134.7;227;116.7;66.7;60.3;52.6;171.6;96.7;125.1;55.8;107.3;280;358.7;250.5;29.9;164.2;358.7 0.04908347;0.08930025;-0.03261727;-0.02763304;0.1500503;-0.1355494;0.1147602;0.01320622;-0.03721905;-0.2051474;0.081859;0.08942498;0.02461244;0.08802972;-0.06423497;0.1017187;-0.02395382;-0.08889081;-0.3449814;0.08312899;-0.04214657 333.7565;437.6498;-112.0103;-79.35617;334.1242;-234.7462;177.0399;16.33729;-286.0287;-1095.213;146.1284;141.8923;38.98815;111.3929;-263.0375;264.1237;-45.0024;-147.3212;-413.2975;217.5686;-79.1814 147.063720703125;204.044967651367;291.198913574219;348.215393066406;449.085388183594;577.429565429688;648.216369628906;808.348571777344;130.123474121094;187.312866210938;560.185607910156;630.231140136719;631.279968261719;790.26318359375;244.204650878906;385.11767578125;532.278747558594;603.380798339844;834.704650878906;382.081787109375;532.278747558594 21 0.2875921 0.1834862 None Unknown 57.2674;10.65497;9.362578 RDLMACAQTGSGK;QGFWESQMELR;SPVWMNGHTDPK _RDLM(ox)ACAQTGSGK_;_QGFWESQMELR_;_(ac)SPVWMNGHTDPK_ 17822 693 6095 6186 27025 70 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 22195 18791 RDLMACAQTGSGK 13 1 Oxidation (M) _RDLM(ox)ACAQTGSGK_ RDLM(1)ACAQTGSGK RDLM(41.74)ACAQTGSGK 0 1 O00571;O00571-2;B4DLU5;B4DXX7;O15523;C9J081;D6RCM4;E9PCD8;Q9NQI0-2;D6RDK4;Q9NQI0;H0Y960 DDX3X;DDX3Y;DDX4 ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 3 HCD ITMS MULTI-SECPEP 7 0 470.88699 1409.6391 0.04147 -265.78575 32.996 0.031609 41.743 37.952 41.743 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y9;y1-NH3;y7-NH3;y7(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2;b3;b4;b6;b8;b9(2+);b10(2+) 97.6;25.7;126;154.7;232.8;214.9;169.4;53.6;47.1;104.4;148.4;257.5;76.1;33.3;270.1;358.1;363.9;44.8;51.2;363.9;252.5 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_C 25790 21547 RDLMACAQTGSGK 13 1 Oxidation (M) _RDLM(ox)ACAQTGSGK_ RDLM(1)ACAQTGSGK RDLM(55.41)ACAQTGSGK 0 1 O00571;O00571-2;B4DLU5;B4DXX7;O15523;C9J081;D6RCM4;E9PCD8;Q9NQI0-2;D6RDK4;Q9NQI0;H0Y960 DDX3X;DDX3Y;DDX4 ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 470.88699 1409.6391 -0.60288 -1.0371393 41.399 0.019388 55.415 41.171 55.415 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y7;y8;y9;y1-NH3;y3-H2O;a2;b2;b3;b4;b5;b6;b7;b8;b9(2+);b10(2+);b11(2+) 150.6;267.7;173;501.1;974.3;421.2;139.1;101.9;209.7;154.1;29.6;161.4;565.9;806.3;264.7;71.7;198.2;50.4;806.3;283.2;167.4 -0.01570535;0.09123811;-0.08983773;0.13823;0.01470486;-0.001572836;0.02706121;0.1291164;-0.009631162;-0.06780964;0.0220077;-0.05387846;0.1261328;-0.01272335;0.1443245;0.06925983;-0.3678085;-0.1092798;-0.03091611;0.4615662;0.1206469 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ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 470.88699 1409.6391 -0.21916 -0.82431891 33.153 0.0032693 86.498 71.719 86.498 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y6-NH3;y7-NH3;y8-H2O;y9-H2O;y9(2+);a2;b2;b3;b3-NH3;b4;b4-NH3;b5;b6;b7;b9(2+) 234.7;304.1;554.6;375.6;1204.1;535.3;879.8;273.5;118;203.1;117.7;679.1;183.1;160.1;28.8;264.5;144.8;227.7;853.5;252;891.3;199.6;971.3;309.2;61.9;891.3 -0.05604959;0.01756868;-0.02767342;0.0116736;0.01943508;0.1014501;0.08674504;0.1288068;0.01803241;-0.08780194;-0.005928668;0.3280748;0.2064362;0.05116449;0.1037202;-0.163432;0.02823329;-0.06147733;0.05099851;0.1489001;0.04782352;0.1155127;0.1049568;0.262314;0.06017;0.02963077 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0 1 O00571;O00571-2;B4DLU5;B4DXX7;O15523;C9J081;D6RCM4;E9PCD8;Q9NQI0-2;D6RDK4;Q9NQI0;H0Y960 DDX3X;DDX3Y;DDX4 ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 470.88699 1409.6391 -0.47698 -1.4627802 41.976 0.0042683 69.261 62.529 69.261 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y6-H2O;y6-NH3;a2;b2;b3;b4;b5;b6;b7;b8;b9(2+);b10(2+);b11(2+) 76.3;359.8;282.3;798.9;435.8;614.9;285.7;121.1;175.9;22.3;362.4;616.1;28.6;437.2;961.9;836.7;865.7;433.9;123.3;37.2;836.7;616.1;183.2 0.03335166;-0.003427418;-0.02458128;-0.1228379;0.05390371;0.1414936;-0.07675959;0.326321;0.02193927;-0.05001131;0.1067545;0.01227892;0.06753993;-0.05433622;0.008151831;0.08102664;0.07590411;0.09019489;0.1727188;-0.279751;0.06283389;0.4921449;0.08793201 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Unknown 58.11581;18.13626;17.59444 RDLMACAQTGSGK;FEEEEVIQEMK;QDGSTAMECKRK _RDLM(ox)ACAQTGSGK_;_FEEEEVIQEMK_;_QDGSTAMECKRK_ 17828 693 6095 6186 27031 70 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_C 44758 37854 RDLMACAQTGSGK 13 1 Unmodified _RDLMACAQTGSGK_ 0 0 O00571;O00571-2;B4DLU5;B4DXX7;O15523;C9J081;D6RCM4;E9PCD8;Q9NQI0-2;D6RDK4;Q9NQI0;H0Y960 DDX3X;DDX3Y;DDX4 ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 465.55535 1393.6442 -0.30756 -0.53627037 68.755 0.0010278 83.856 65.046 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y5-H2O;y5-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y8-H2O;y8-NH3;a2;b2;b3;b4;b5;b6;b6-H2O;b7;b8 416.1;858.5;604.8;1100;2488.1;1048;1207.7;654.7;470.9;397.5;132.9;604.2;763.5;1306;1670.4;571.7;227.2;40.8;430.7;2424.1;2589.9;2891.6;867.7;149;216.4;178.5 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P55265;P55265-4;E7ENU4;P55265-5;H0YCK3;P55265-2;P55265-3 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 6 2 910.09369 2727.2592 0.076639 734.26943 129.22 0.007578 44.158 44.158 44.158 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y8;y9;y10;y14;y2-NH3;y14(2+);b4;b5;b6;b7;b8;b9;b10;b9(2+);b10(2+);b11(2+) 93.1;196.4;155.7;111.4;96.4;132.7;129;67.4;128.9;304.5;318;126.9;584;175.7;131.1;336;414.7;152.2;167.7;64.2 0.08051657;0.06237969;0.2061275;0.05843244;-0.1601027;-0.03585012;0.01078515;0.2925066;0.06683645;0.08604875;-0.3407555;0.09466279;-0.01695194;0.08132468;0.05057152;0.0312431;0.1376459;0.06582961;-0.2151975;-0.3653903 547.6115;225.9372;546.7617;122.1944;-168.069;-34.48757;9.711991;193.7909;257.994;113.9326;-722.5952;153.1253;-23.17737;97.70493;50.95823;28.23665;112.8753;118.8925;-352.4862;-554.3021 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RTAQEVETYRR 11 2 Unmodified _RTAQEVETYRR_ 0 0 P17844 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 470.2479 1407.7219 -0.21477 -1.9208799 41.215 0.012916 78.548 53.422 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y1-NH3;y4-NH3;y5-NH3;y6(2+);y7(2+);y10(2+);a2;b2;b2-H2O;b2-NH3;b3;b4;b5;b5-NH3;b6;b7;b9 1079.4;389.6;147;36.6;583;447.3;509.8;300.7;501.6;90.8;360.9;220.2;321;204.4;419.7;1016.1;294.4;239.2;67.6;60.7 -0.009496305;-0.1482389;-0.06194459;-0.02031359;-0.01627966;-0.03020512;-0.2948849;-0.3675215;-0.1200248;-0.05070168;0.1149893;0.006280091;0.05117824;0.03027692;0.01384223;0.1167991;0.07840917;0.02694885;-0.2818374;0.09680872 -54.2248;-248.9404;-85.50739;-128.4754;-28.14988;-42.70015;-714.8386;-770.3019;-191.4462;-220.2392;445.6241;26.15188;212.2888;91.98158;30.27358;199.2555;137.7559;39.32211;-345.9456;89.76907 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_RTEALEQGGLPK_ 0 0 D6R9G1;D6RAD4;P50613 CDK7 Cyclin-dependent kinase 7 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 433.57361 1297.699 0.047088 -1.8828384 71.443 0.0012001 75.088 37.76 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y1-NH3;y2-NH3;y6-NH3;y7-H2O;y11(2+);a2;b3;b3-NH3;b4;b5;b6;b9;b9-NH3;b10;b7(2+);b9(2+) 789.4;3436.9;965.1;1200.2;706.3;213.4;540.6;254.8;394.4;252;2688.2;231.9;1235.1;307.1;4256.4;2688.2;603.6;66.4;74.1;28.9;965.1;1200.2 0.06779074;0.06742349;-0.4195781;0.0454281;0.07061938;0.08690633;0.04436969;-0.1166421;-0.03985306;-0.1792736;0.4919579;0.2506441;-0.003001091;0.1049713;0.09856582;0.005566814;0.1673616;0.2318182;0.04346489;-0.4472404;0.02346813;0.4884743 461.0203;276.2147;-1011.786;96.39974;117.8403;119.3265;341.1954;-513.2637;-68.4332;-252.2982;861.0986;1090.181;-7.750719;283.6547;215.1448;9.743873;239.0213;246.0309;46.96907;-423.525;56.59188;1036.557 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_RYIGIVKQAGLER_ 0 0 P52597;B4DKS8 HNRNPF Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 501.63158 1501.8729 0.036648 -1.5483323 100.81 0.0051081 74.475 60.61 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y10;y1-NH3;y6-NH3;y7(2+);y12(2+);b4;b5;b6;b7;b8;b10;b8(2+) 977.9;330.2;270;1382.5;2571.5;3390.7;811.5;132.4;75.2;227.3;610.3;463.8;2133.5;1040.8;2468.9;2396.9;956.2;60.9;40.1;492.5 0.01563492;0.09935045;0.1245155;0.1255324;0.06840796;0.119173;0.129053;-0.2389345;0.2555703;0.09347119;0.07590023;-0.1208917;-0.467793;0.02919686;0.04087315;0.09231929;0.09792684;0.1466167;-0.08252556;-0.0535466 89.28969;326.7439;298.5117;264.7573;125.4649;177.0132;161.0488;-265.2573;238.7668;591.5938;115.6557;-301.2101;-693.6833;59.55529;67.74699;131.4458;117.9235;152.9748;-75.93974;-111.5906 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 72692 61500 SALAFLNRGQPSSSNAGNK 19 1 Unmodified _SALAFLNRGQPSSSNAGNK_ 0 0 Q9H0H5;F8VRD2;F8W1E5;F8W1T4;F8VV37;F8VQF5;F8VYH6;F8VQZ5;F8VZ66;F8VV47;F8VWY4;F8VVE5 RACGAP1 Rac GTPase-activating protein 1 3 HCD ITMS MSMS 2 0 640.32917 1917.9657 NaN -0.42553634 111.64 0.0065688 64.327 31.998 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y7;y9;y11;y1-NH3;y2-NH3;y7-H2O;y9-NH3;y11-NH3;y9(2+);y13(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b6;b10;b11;b14(2+) 56.6;855.9;170.7;399.6;1041.5;109.3;100.3;299.5;282.7;299.6;102.3;465.4;282.7;745.8;833.2;1456.6;177.8;266.6;429.5;761.2;9.6;1206.1;621.6;148.6;273.9;40.4;129.2 -0.04121805;0.1226506;0.04328421;0.1159101;0.1961858;0.2295351;-0.2122679;0.04699868;0.2083117;0.1455278;0.447859;-0.05906601;-0.2836961;-0.2132827;0.2901625;-0.001400232;-0.2103448;-0.2624666;-0.06565172;0.01422384;0.126233;0.002950907;0.02202881;0.1559825;0.1198083;0.1344863;-0.2045624 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63339 SALCNADSPKDPVLPMK 17 1 Unmodified _SALCNADSPKDPVLPMK_ 0 0 Q29RF7 PDS5A Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 921.95805 1841.9016 0.28184 -1.3615288 115.81 0.0041732 59.606 41.427 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y6;y7;y9;y10;y11;y13;y14;y1-NH3;y11(2+);y14(2+);b7;b11;b11-H2O;b11-NH3;b13;b14;b14-H2O;b11(2+);b13(2+) 29.6;533.4;211.3;48.3;160.7;87.9;70.9;155;40.1;49.5;106.4;159.3;78;137;47.6;70;31;65.7;33.6;82.5;110.1 -0.08784891;-0.04721275;-0.1954561;-0.1049755;0.2673608;-0.03630419;0.0763322;0.3353285;-0.4053856;0.06419086;-0.3132372;-0.1205023;-0.01230969;0.2438271;0.149156;0.05150651;0.2529443;0.3201626;0.3031282;0.1552759;-0.3859419 -596.797;-125.8157;-285.5013;-131.2943;261.0133;-32.6578;62.23232;237.5875;-257.8524;493.692;-510.0425;-153.213;-16.80939;210.3298;130.6844;45.08517;186.6234;218.0365;208.9968;267.6706;-568.6465 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_SEICTEEPQKQK_;_TDGAPEQDM(ox)VAAKK_;_TMENPDLKQGESK_ 19516 1325 6661 6756 29535 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 26809 22908 SEICTEEPQKQK 12 1 Unmodified _SEICTEEPQKQK_ 0 0 Q8NFC6 BOD1L1 Biorientation of chromosomes in cell division protein 1-like 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 492.90481 1475.6926 -0.11921 0.58457249 38.846 0.011541 57.885 37.152 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y7(2+);y8(2+);y9(2+);y10(2+);a2;b2 145.8;228.7;244;116.1;70.7;23.8;120.2;129.4;74.4;154.3;156.2;191.3;514.4;519.1;793.7;697.1 -0.01826883;0.1692683;-0.195312;-0.004403458;0.09287713;0.01409077;0.01580831;-0.01603985;-0.04780506;0.1578902;0.311643;0.3321863;0.04730899;-0.2854149;-0.05550322;-0.02909446 -124.167;419.9194;-310.7228;-5.813724;104.7837;14.26918;13.776;-123.2865;-64.64883;213.2972;702.8112;672.5417;82.38727;-452.2486;-293.4466;-134.0073 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y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y7-NH3;y8-H2O;y8-NH3;y9-H2O;a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b9;b7(2+) 4835.6;8263.3;6195.2;3631.8;15577.2;15369.9;43977.2;26003.2;10315;2826;1815.4;1967.8;3297;1466.1;1473.7;25546.5;65487.7;2156.3;11913.2;6435.4;1373.1;3516.9 0.02085471;0.02452123;0.05847535;0.09524786;0.06345296;0.07911304;0.1617897;0.1344976;0.1713814;0.01768207;0.04615938;0.05278213;-0.03323264;0.04087083;0.2911878;0.08400789;0.007816552;-0.09651339;0.02140019;0.05157263;0.1344893;-0.3998289 141.7801;112.418;176.569;199.1908;115.528;111.0685;184.8452;133.9162;153.3767;135.9442;229.5605;61.49228;-33.68748;41.39202;264.8948;444.4792;36.00869;-484.5832;64.82065;112.3203;120.4716;-931.8075 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29546 31 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_C 83369 70144 SEIEYYAMLAK 11 0 Oxidation (M) _SEIEYYAM(ox)LAK_ SEIEYYAM(1)LAK SEIEYYAM(76.93)LAK 0 1 E5RI99;P62888 RPL30 60S ribosomal protein L30 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 0 667.32085 1332.6272 -0.32703 0.3698853 134.25 0.016793 76.927 56.797 76.927 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y8-H2O;a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b7(2+) 1202.5;525.5;1132.2;594.2;935.7;882.6;2409.9;2173.3;688.7;643.4;1706;270.7;1943.5;4780.1;674.4;913.8;603.4;2466.8 -0.03209329;0.1614536;0.06705078;0.1207606;0.1320565;-0.03117748;0.1633766;0.173377;0.1243843;-0.06595135;-0.01577604;0.07736306;-0.005149218;0.01619363;-0.08168185;0.1462476;0.04250891;-0.3785582 -218.1067;740.652;202.4682;252.5586;240.4636;-43.76395;186.6586;172.6342;111.3123;-506.7248;-78.43346;78.43067;-27.23126;74.60242;-410.1462;443.1481;92.57851;-882.2794 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16266.4;51415.8;26572.2;14393.7;30214.6;36247.3;40247.3;29593.1;9097.5;8697.3;2434.9;12283.4;94090.9;199920.8;21240.9;36575.6;8767.9;17570.9;10426.8 -0.001514677;0.02870214;0.04352173;-0.009091733;0.00174642;0.00532154;0.05815203;0.07034962;0.20373;-0.1206389;-0.01460111;0.09574144;-0.08612761;-0.0822866;-0.1485611;0.02387211;-0.002103954;0.00945837;-0.0123673 -10.29592;131.588;131.41;-19.00929;3.179327;7.470249;66.43099;70.04106;182.3322;-926.5167;-72.59253;96.96774;-455.2846;-378.9142;-745.7143;72.30859;-6.740039;20.59754;-28.0304 147.114318847656;218.121215820313;331.190460205078;478.278472900391;549.304748535156;712.364501953125;875.375;1004.40539550781;1117.35607910156;130.206893920898;201.137969970703;987.353454589844;189.173110961914;217.164184570313;199.21989440918;330.14208984375;312.157501220703;459.199096679688;441.210357666016 19 0.3472444 0.08558559 None Unknown 100.8783;25.70071;18.05888 SEIEYYAMLAK;QSNQKEDTQQK;CYKPEDTHRK _SEIEYYAM(ox)LAK_;_QSNQKEDTQQK_;_CYKPEDTHRK_ 19525 342 6662 6757 29549 31 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_C 79296 65940 SEIEYYAMLAK 11 0 Oxidation (M) _SEIEYYAM(ox)LAK_ SEIEYYAM(1)LAK SEIEYYAM(152.04)LAK 0 1 E5RI99;P62888 RPL30 60S ribosomal protein L30 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 9 0 667.32085 1332.6272 0.4085 0.51996479 133.51 4.9814E-86 152.04 113.08 152.04 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y1-NH3;y2-NH3;y7-NH3;y8-H2O;y8-NH3;y9-H2O;y10-NH3;y7(2+);y8(2+);y9(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b5;b8(2+) 31739.4;41248.5;39465;30424.5;70576.9;131355.8;205001;171896.4;70416.8;1419.9;19562.3;6906.7;15802.9;28862.3;14751.8;4009.9;1086.5;13113.5;8888.7;6824.1;180518.1;401510.5;12050.5;67652;16905.5;29151.1;12069.8;9112.1;8888.7 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0 C9IZM8;B5MEB7;Q8WXE1-3;Q8WXE1-2;Q8WXE1;F8WE08 ATRIP ATR-interacting protein 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 7 0 565.79566 1129.5768 0.15698 0.065077206 84.161 3.4095E-19 125.57 81.799 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y1-NH3;y2-H2O;y3-H2O;y3-NH3;y4-H2O;y6-NH3;y7-H2O;y8(2+);a2;b2;b3;b3-H2O;b4;b5;b6 388.9;433.8;263.8;417.9;492.4;1276.6;1762.2;310.4;344.1;158.5;289;296.4;188.3;189.2;1255.9;694.9;3557.8;1325.4;277.2;504;204.8;178.3 -0.02951455;0.04919609;0.01866228;0.2329473;0.1448311;0.1187266;0.1683417;-0.06877423;0.07589337;0.1194257;0.106432;0.2081003;-0.1578835;-0.02142222;-0.1031635;0.006683465;0.03422138;-0.03393087;0.01641753;0.02535284;-0.121174;0.108797 -200.5851;178.1782;46.17144;437.0299;224.1288;156.362;185.741;-528.4024;294.0818;309.3257;274.9606;404.0486;-212.6217;-24.11044;-197.4863;33.90958;152.0518;-91.16286;46.35892;52.24962;-202.4777;149.5968 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 67766 57280 SHTILLVQPTKRPEGR 16 2 Acetyl (Protein N-term) _(ac)SHTILLVQPTKRPEGR_ 1 0 G3V279;P84090 ERH Enhancer of rudimentary homolog 3 HCD ITMS MULTI-SECPEP 1 2 625.3584 1873.0534 -0.1898 1015.93 103.98 3.5254E-08 82.515 71.095 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y8;y10;y1-NH3;y2-NH3;y10-NH3;y8(2+);y9(2+);y10(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b5;b7;b6(2+) 77.8;459.5;202.1;118.8;73.1;26.5;1240.8;89.1;276.3;138.9;470.9;1407.1;915.9;1054;222.1;619.7;435.1;539.9;362.3;167.9;409.2;396.5;319.5;209.9 0.3823189;-0.08907628;-0.3645374;0.04498454;-0.2043668;-0.1049236;-0.0139103;0.2346603;-0.3099596;-0.4928595;-0.3027078;-0.0648352;0.01046096;0.002561912;-0.09606361;0.004624931;-0.05083111;0.1041833;0.0001432599;-0.01716655;-0.0183013;-0.1377534;0.2856595;-0.2509287 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homolog 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 1 469.27062 1873.0534 -0.35372 -1.1133831 114.67 0.003403 64.798 54.886 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y8;y1-NH3;y2-NH3;y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b5;b5-H2O;b6;b6-H2O;b7;b7-H2O 618.7;799.9;42.8;61.9;72.4;3541.2;1383.9;1321.3;289.5;56.3;222;218.9;1139.2;611;1506.9;998.8;3027.7;487.5;1927.5;415.8;206.7;156.6 -0.07318649;5.030401E-05;-0.1898787;0.08494153;0.02860069;0.1779554;0.08404475;-0.1050759;0.07538379;-0.002496722;-0.02604523;0.06812641;0.04973993;0.02895185;0.05476338;0.01889962;0.009097137;0.07970921;0.09438182;0.1412512;0.1410062;-0.06493203 -417.7499;0.2166965;-201.8436;537.5792;132.9737;378.1524;157.1767;-179.7896;117.6401;-10.44145;-97.49846;273.567;135.1237;82.69196;113.8092;40.80132;15.30692;138.3278;133.4369;204.9326;174.8727;-82.34552 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protein 148 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 496.54708 1486.6194 -0.27369 -1.3652473 38.294 0.0010559 91.701 75.478 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y3-NH3;y6-NH3;y7(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b5;b6(2+) 295.9;245.7;214.7;368;412.9;904.8;98.5;218;160.3;161.5;110.7;490.8;879.2;919.8;125.9;347.7;1764.6;74.7;305.6;194.7;230.7;144.1 -0.06619797;0.1843143;0.02434561;0.02398381;-0.08036657;-0.07004308;-0.05117028;-0.05508598;0.05697217;-0.4431825;0.0346334;-0.1065111;-0.3430838;-0.03342521;0.2383403;-0.1489867;0.0710561;0.1315211;-0.03240499;0.06695464;0.08093641;-0.09611537 -377.8743;572.3994;61.91658;51.66279;-138.95;-94.85724;-58.45058;-54.83965;360.5025;-1176.671;48.01698;-243.0056;-588.3989;-52.86248;340.2127;-755.3104;315.7668;635.5022;-99.95399;218.7423;131.9991;-255.7966 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7011 30811 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 46718 39969 SINQQSGAHVELQR 14 0 Unmodified _SINQQSGAHVELQR_ 0 0 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 1 783.90278 1565.791 0.14238 639.95143 68.2 5.8517E-05 91.845 67.331 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y6;y8;y9;y10;y11;y12;y8-NH3;y9-H2O;y7(2+);y9(2+);y12(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b11;b11-NH3;b12;b12-H2O;b13;b7(2+) 289.7;152.6;183.9;412.6;169.1;342.5;173.4;52.4;33.6;68.9;79.1;62.1;105.9;424.1;149.3;102.8;77.4;87.6;183;36.4;120.1;56.7;18.3;48.3;74.2 -0.005254362;0.1561064;0.02294621;0.04113169;0.2249533;0.1538323;0.0925368;-0.1959316;0.1685291;0.3998203;0.1314879;-0.1223391;-0.07740458;-0.1678345;0.1011257;0.06199801;-0.03339029;-0.02367562;0.06673173;0.3738101;0.2557083;0.09642389;0.2988719;0.1961391;0.199881 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deacetylase 2;Histone deacetylase;Histone deacetylase 1 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 476.22589 1425.6558 -0.55172 -1.2330563 72.564 0.00043434 94.538 70.862 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y3-NH3;y4-H2O;y5-H2O;y10(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b5;b6;b6-NH3;b7;b9;b9-H2O;b9-NH3;b6(2+);b7(2+) 1254.4;1397.3;1275;529.7;2565;414.2;415.8;427.6;315.4;655.9;381.4;2565;1493.3;354.4;711.4;419.2;1259.6;2899.4;307.7;166.9;60.7;35.2;157.4;322.6;333.3 -0.01846719;0.01017377;0.07424998;0.09352765;-0.01372616;-0.01893902;-0.09804717;-0.02836874;0.08813667;0.0717325;-0.1313465;0.4806357;0.01509669;-0.05566252;-0.03218484;0.1140063;0.06224341;0.0990063;0.1898278;0.04439814;-0.0853871;0.2193558;0.2285789;0.04175833;-0.05271494 -125.5151;43.45263;186.9646;177.7561;-22.38096;-145.567;-453.4344;-130.6432;231.8816;141.1589;-220.6008;783.6923;87.20696;-276.6815;-175.7342;319.2465;109.3444;144.9053;284.9708;54.52018;-82.85604;216.705;225.5994;122.052;-129.2825 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72.243 98.902 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y4-H2O;y10(2+);y11(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b5;b6;b6-H2O;b7;b9;b9-H2O;b10(2+) 598.4;1319.2;1307.2;393.3;1252.4;706.3;295;212;409.2;441.9;223.4;2844.6;435.5;93.9;524.1;352.8;679.8;1301.1;164.1;121;83.1;71.4;472.9 -0.005375151;0.08727643;0.04864574;0.06502423;0.08997256;-0.01881695;0.04494294;0.009610383;-0.005782151;-0.3560744;-0.2086347;-0.01653478;0.02629244;-0.01851297;0.123955;-0.1310815;-0.03553491;0.1428296;0.02862717;0.1007752;0.2525451;0.1175908;0.3233182 -36.53628;372.8845;122.4841;123.5766;146.728;-144.6289;207.9832;44.26531;-11.37668;-572.3467;-307.4826;-95.49673;130.745;-101.0912;347.1151;-288.4662;-62.41425;209.0583;43.02845;121.3747;241.3917;114.3513;534.4628 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5281.2;3907.4;2186.6;2674.7;3579.3;1358.3;2638;4235.2;1717.9;752.3;6775.1;1358.3;1159.6;3116.9;1556.1;791.3;665.6;7486;619;3027.6;2893.3;738.6;320 0.04713034;0.007522939;-0.0009870527;0.1439759;-0.080966;0.06895602;-0.1083091;-0.03241665;-0.1626869;-0.333836;0.09180263;0.06895602;-0.1064341;0.04824087;0.002306312;-0.0197511;-0.03781974;0.1157633;0.02868469;-0.0835653;-0.2673024;0.05445376;0.2559374 320.4714;34.48637;-3.413187;399.8439;-622.0153;342.9719;-236.5434;-62.06184;-280.9788;-487.893;530.5386;342.9719;-580.9113;135.0618;6.799037;-58.05431;-83.24562;204.0797;42.15753;-146.7587;-426.9108;79.80303;324.5029 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10164.5;5360.3;1962.7;806.9;7871.4;2020.4;1823.1;6116.4;3317.6;4138.6;2020.4;1659.9;2351.3;3244.6;20.7;2511.3;3295.6;2212;4599;8478.7;17606.5;18416.9 0.01336264;0.03114354;0.01198292;0.1927828;0.006833072;-0.01873625;0.02815843;0.009214048;0.270351;-0.03975866;-0.01873625;-0.06129861;0.08330557;0.09123628;0.2832761;-0.4808292;-0.1214681;-0.07681163;-0.07805357;-0.1419552;-0.07707259;-0.06803718 90.84088;142.7825;41.43829;184.7655;52.53;-93.14929;103.4733;20.12832;395.4605;-229.5956;-93.14929;-334.6467;233.2567;112.7213;197.4656;-1409.2;-213.3101;-122.7138;-114.3668;-197.6907;-102.2833;-86.22887 147.09944152832;218.118774414063;289.175048828125;1043.3916015625;130.07942199707;201.142105102539;272.13232421875;457.765319824219;683.635925292969;173.168212890625;201.142105102539;183.174102783203;357.141174316406;809.396728515625;1434.55944824219;341.207153320313;569.44384765625;625.941223144531;682.484497070313;718.066955566406;753.520629882813;789.030151367188 22 0.2629596 0.09090909 None Unknown 75.91126;19.29736;16.73844 SIRPLLEGRDLLAAAK;GTVVSLVDLAKHLRSK;DEIQLILPTRARLGK _SIRPLLEGRDLLAAAK_;_GTVVSLVDLAKHLRSK_;_DEIQLILPTRARLGK_ 20363 1550 6918 7018 30845 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 54722 46432 SISELSDQYKQEK 13 1 Unmodified _SISELSDQYKQEK_ 0 0 P49454 CENPF Centromere protein F 2 HCD ITMS MULTI-SECPEP 6 1 777.88593 1553.7573 -0.2667 644.45738 82.356 1.937E-05 96.866 69.732 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y4-H2O;y7-NH3;y8-NH3;y9-H2O;y9-NH3;y11(2+);a2;b2;b4;b4-H2O;b6;b7;b12 116.7;121.6;118;33.5;77.1;327.4;31.3;66.2;88.9;153.1;162.3;65.7;32.2;27.6;208.1;196.6;275.8;111.3;103.8;80.9;67.1;118.1 -0.1538889;-0.03483504;0.1551902;0.3279386;0.001243909;0.2442098;0.008693721;0.1745778;0.3064598;0.2070645;0.337854;0.1178072;0.00398841;0.2115147;0.07849897;0.02054408;-0.01815641;0.3194198;0.07161146;0.3563801;-0.1809469;0.4632647 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73.082;33.96791;19.62693 SISLASCHQLHSK;MQTKGAMDLLTMK;MNIVFSRDSQVR _SISLASCHQLHSK_;_MQTKGAMDLLTMK_;_M(ox)NIVFSRDSQVR_ 20370 750 6922 7022 30859 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_C 50472 42424 SISLASCHQLHSK 13 0 Unmodified _SISLASCHQLHSK_ 0 0 O75691 UTP20 Small subunit processome component 20 homolog 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 489.91728 1466.73 -0.32428 -719.30479 80.069 0.01558 49.356 24.843 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y4-NH3;y6-H2O;y10(2+);y11(2+);a2;b2;b2-H2O;b3 770.9;319.7;274.8;368.1;51.2;236.5;242.5;383.8;129;39;221.6;107.7;262.3;1052.3;3721.5;1264.2;95.3;230.2 0.06742453;0.1203727;-0.1617155;0.01418452;0.06857539;0.1071346;0.1416849;-0.00171185;0.150488;0.2342808;0.0780623;0.1316106;0.02270163;-0.0372119;0.09233668;-0.01042021;0.2772939;-0.1335432 458.5287;514.3597;-333.8129;18.92805;75.41;107.5259;132.7429;-13.15917;696.756;1080.212;167.0914;179.977;38.42682;-58.66133;533.6266;-51.80734;1516.63;-463.2268 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_SKTDLPEEKPDATPQNPFLK_ 0 0 A1X283 SH3PXD2B SH3 and PX domain-containing protein 2B 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 2 752.38999 2254.1481 -0.58363 888.91373 129.09 0.0090051 48.372 35.218 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y7;y9;y10;y11;y1-NH3;y6(2+);y12(2+);y15(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);y19(2+);b2;b2-H2O;b3;b5;b5-H2O;b7;b7-H2O 82.2;129.2;218.8;73.3;59.6;126.5;202.7;118.1;158.5;411.2;132;85.9;85.1;72.3;616.4;143.5;128.2;408.8;85.7;161.5;334.5 0.09965109;0.02203295;0.2150515;0.2867823;-0.1569168;-0.05801034;-0.06654645;-0.3955341;0.08113556;0.08895336;0.09491357;-0.2223644;0.1800148;0.4668152;0.1115018;-0.02473429;0.07598934;-0.0002595099;-0.1714077;0.3542527;0.07226469 677.838;84.68516;255.0248;282.4689;-138.7734;-47.25143;-511.2948;-1057.27;119.6181;103.9357;104.0279;-229.1906;176.4267;430.6022;516.1575;-124.8271;239.6339;-0.475909;-324.972;459.4515;95.93012 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117.38 151.22 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y8;y9;y10;y11;y12;y1-NH3;y8-NH3;y9-NH3;y11-NH3;y12-H2O;y12-NH3;y11(2+);y12(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b4;b4-H2O;b6;b8;b8-NH3;b9;b10;b11;b12;b13;b10(2+);b11(2+);b12(2+) 3055.5;11723.7;3290.4;2200;902.5;777.5;799.7;3171.1;652.4;1293.1;625.6;1335.8;724.7;559.5;378.8;350;221.3;2556.6;2209.2;5954.9;6315.1;602.3;2497;2203.1;2279.4;628.7;829.8;538.4;1458;4076.3;4501.2;5418.1;595.2;1895.6;2907;793.6 0.08134054;0.09372952;0.08166859;-0.02304917;0.1828062;0.07821048;-0.004714532;0.1682178;0.216271;0.2141198;0.2365713;-0.03456402;0.2090928;0.3139099;0.09992417;0.2030573;0.2973024;-0.03291761;-0.03212887;0.04660609;0.008851645;-0.01332498;0.0373914;0.03524012;0.1450978;0.08865367;0.1170568;-0.03668959;0.1579689;0.2166075;0.2371949;0.2844906;0.2341965;-0.06017718;0.3081487;0.4738254 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SLESINSRLQLVMK;KTVTMLQAQLSLER;EEYISHKLNILFK _SLESINSRLQLVM(ox)K_;_KTVTM(ox)LQAQLSLER_;_EEYISHKLNILFK_ 20533 342 6973 7073 31098 32 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 84426 71291 SLESINSRLQLVMK 14 1 Oxidation (M) _SLESINSRLQLVM(ox)K_ SLESINSRLQLVM(1)K SLESINSRLQLVM(105.25)K 0 1 E5RI99;P62888;E5RJH3 RPL30 60S ribosomal protein L30 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 545.30291 1632.8869 -0.0069751 -0.5637148 131.45 8.0515E-12 105.25 70.331 105.25 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y6;y10;y1-NH3;y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b11;b11-H2O;b11-NH3;b11(2+) 6893.1;17124.3;3282.9;3351.3;1105.6;231.9;4210.3;2456.6;7392.8;4491.2;23610.8;52665.6;125940.5;34800.7;1204.3;4440.9;2270.9;1208.2;2485.1;393.8;1049.8;753.7;7788 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_SLESINSRLQLVM(ox)K_;_KTVTM(ox)LQAQLSLER_;_FLTIFNLTHISAEK_ 20534 342 6973 7073 31099 32 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 84131 70908 SLESINSRLQLVMK 14 1 Oxidation (M) _SLESINSRLQLVM(ox)K_ SLESINSRLQLVM(1)K SLESINSRLQLVM(102.97)K 0 1 E5RI99;P62888;E5RJH3 RPL30 60S ribosomal protein L30 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 0 545.30291 1632.8869 -0.40668 -0.012543735 131.33 1.8024E-11 102.97 60.582 102.97 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y8;y9;y1-NH3;y6(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b4-H2O;b11;b11-H2O;b11-NH3;b12;b11(2+) 5788.3;13912;4706.3;3019.2;627.4;1340;3215.1;1723.7;8872.7;6332.5;24875.2;31217.9;1778.5;119585.4;34507.2;909.6;3621.1;1978.6;1204.6;2585.6;900;507.4;523.8;42.8;13746 -0.08716226;0.001963164;0.06729481;0.03508681;0.04740949;0.2254688;-0.03869915;0.1254156;-0.1583466;-0.1288268;-0.1547438;0.1064209;0.2027742;0.04613307;0.01796114;-0.01518655;0.07776615;0.016054;0.03453821;0.04673964;0.1977662;0.20893;0.2094251;0.005682023;0.3466619 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_SLVMHTPPVLKK_;_IGLFFWPKITK_;_KSLVMHTPPVLK_ 20729 919;920 7041 7142 31400 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 52905 45205 SLVMHTPPVLKK 12 1 Oxidation (M) _SLVM(ox)HTPPVLKK_ SLVM(1)HTPPVLKK SLVM(43.5)HTPPVLKK 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2;E7EN66 MKI67 Antigen KI-67 3 HCD ITMS MULTI-SECPEP 2 2 455.93561 1364.785 0.0021721 1337.3377 77.981 0.029685 43.501 27.581 43.501 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y5;y6;y7;y8;y1-NH3;y8-H2O;y8(2+);y9(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b5;b6;b7 804;1653.9;654.3;191;135.6;526;179.9;473.9;506.8;3927.1;986.7;46.8;269;1653.9;322.3;191 -0.001545195;-0.1204383;0.105055;0.1122672;0.04770492;-0.1051664;-0.1635434;-0.3640803;-0.03122571;-0.009866688;0.02379;0.2013967;0.3555401;-0.2473534;-0.001798951;-0.01464789 -10.50336;-206.0418;154.1841;143.4906;51.87998;-807.7832;-181.3672;-790.3555;-58.49277;-56.98732;118.2996;1101.062;1185.781;-423.1638;-2.62492;-18.72171 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Unmodified _SQEITTNSEQRCPLK_ 0 0 Q99741 CDC6 Cell division control protein 6 homolog 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 1 597.62823 1789.8629 -0.31183 -0.88865831 72.497 0.019516 42.958 28.356 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y7;y9;y11;y1-NH3;y10(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b2-NH3;b3;b5;b9;b8(2+) 191.8;1029.8;98.9;81.4;24.1;145.7;179;531.9;572.9;577.6;51.9;860.5;37.7;101.8;448;155.8;65.8;105.8 0.04825949;0.3253766;-0.07322429;0.04860656;0.09855336;0.0279665;0.08718114;-0.2464015;-0.2378778;-0.07583418;0.03498986;0.03512299;0.161567;0.007841465;0.1703827;0.1478283;-0.2468808;0.01200797 328.1518;911.6125;-78.68877;42.95729;73.90277;215.0305;141.3628;-369.0985;-328.5106;-96.179;186.049;162.5592;816.3009;39.39178;493.9057;264.3925;-249.2023;27.84851 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20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 43654 37391 SSTATHPPGPAVQLNKTPSSSKK 23 2 Unmodified _SSTATHPPGPAVQLNKTPSSSKK_ 0 0 Q14684-2;Q14684 RRP1B Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B 5 HCD ITMS MULTI-SECPEP 1 -1 464.85093 2319.2183 -0.31194 -617.30066 62.432 0.039348 32.227 23.602 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y3;y6;y7;y9;y3-H2O;y8(2+);y10(2+);y16(2+);y17(2+);b2;b2-H2O;b5;b9;b11;b11-H2O;b12;b7(2+) 1035;606.8;220.6;201.8;986.8;1926;920;193;273.5;378.3;47.2;709.2;185.6;35.2;66.2;118;551.7 0.315174;0.0207398;0.04864289;-0.2911278;0.222456;-0.2182295;0.1183986;0.1285709;0.1667937;0.08631742;-0.01743269;0.1399612;0.1051614;0.1180737;-0.2945906;-0.1778312;-0.2857654 870.8278;32.74693;66.23887;-298.0322;646.6617;-505.1942;217.166;156.8256;192.0874;493.2846;-110.981;312.369;125.7484;117.561;-298.5422;-161.119;-835.7006 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-1 0 0 0 0 y1;y5;y6;y7;y9;y10;y12;y1-NH3;y7-H2O;y7-NH3;y9-H2O;y10-NH3;y10(2+);y12(2+);y16(2+);y17(2+);y19(2+);y20(2+);a2;b2;b2-H2O;b21(2+) 1739.7;562.3;871.7;466.8;103.3;160.1;29.4;108.8;1089.3;620.1;124.5;74.8;342.2;307.9;342.1;2583.4;129.8;173.6;1739.7;896.3;27.2;173.6 0.002498385;-0.3746144;0.1420777;0.1489847;0.08564224;0.07351481;0.4214535;-0.05986309;0.2363204;0.4075918;0.2111249;0.3194267;0.1152247;-0.3436795;0.0743717;-0.1226961;-0.4614908;-0.08130056;-0.03388712;0.008970615;0.04090166;0.3743217 16.98307;-698.0239;224.3753;202.9058;87.70717;67.47247;320.1727;-459.9684;329.9839;568.492;220.3072;297.8947;211.3434;-521.3395;90.70959;-141.2554;-467.0943;-79.46168;-230.3518;51.2424;260.4872;365.8552 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78123 64804 STLIPILHQK 10 0 Unmodified _STLIPILHQK_ 0 0 Q29RF7 PDS5A Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 15 0 575.35315 1148.6917 0.19503 -1.1288221 132.45 0.0052997 86.882 72.796 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y1-NH3;y2-NH3;y9-H2O;y6(2+);y7(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4 900;568.7;1581;1610.1;432.6;10485.2;1022.9;485;103.5;415.6;602.8;196.3;1080.5;463.9;415.4;1362.1;789.7;4354.5;10625.1;578.4 -0.07568765;-0.00638321;0.1173785;0.1466329;0.1490319;0.0641004;0.03671418;0.111867;0.200317;-0.1054106;0.07458112;0.1845033;-0.1452503;0.2638166;0.02700525;-0.03102812;-0.0598118;0.0116235;0.01497483;-0.007126237 -514.2227;-23.19668;284.8212;279.2116;233.501;87.16552;43.26959;116.3455;188.5395;-809.6569;288.9954;176.6474;-394.3006;621.4653;167.6667;-164.0675;-349.4982;38.46811;52.70128;-17.16081 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y1;y3;y4;y5;y6;y7;y1-NH3;y4-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y7-H2O;y6(2+);y7(2+);y8(2+);a2;b2;b2-H2O;b7 130.1;568.8;873.2;1483.2;1472.2;1190;88.8;126.8;200.7;517;92.5;171;431.9;342.4;938.7;593.3;221.3;72.8 -0.06784592;0.009856525;0.06541709;0.1891564;0.2093428;0.1759139;0.03380933;0.2002144;0.2788562;0.1636287;0.2440845;-0.4160129;-0.08922149;-0.4793837;-0.06740087;-0.01074919;0.09770467;-0.01894276 -387.2776;26.20134;133.7191;306.0133;280.5565;200.5302;213.9038;424.1371;382.9971;224.3982;284.0951;-1112.009;-203.098;-977.9017;-418.2247;-56.84464;571.4435;-23.54968 175.186798095703;376.184051513672;489.212554931641;618.131408691406;746.169799804688;877.243713378906;158.05859375;472.051208496094;728.089721679688;729.18896484375;859.164978027344;374.109222412109;439.302673339844;490.216674804688;161.159469604492;189.097732543945;170.978713989258;804.374572753906 18 0.2513184 0.1304348 None Unknown 70.05642;21.37219;17.46801 STMQELNSR;TSLSSCSAPR;SKEKCNDGK _STMQELNSR_;_TSLSSCSAPR_;_SKEKCNDGK_ 21783 899 7395 7499 33014 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 85293 72034 STMQELNSRLASYLDK 16 1 Oxidation (M) _STM(ox)QELNSRLASYLDK_ STM(1)QELNSRLASYLDK STM(81.13)QELNSRLASYLDK 0 1 P35527;CON__P35527 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 13 0 624.64377 1870.9095 -0.47072 -0.11033035 132.4 0.013952 81.128 63.988 81.128 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y6;y10;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y5-H2O;y10-H2O;y6(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);a2;b2;b2-H2O;b11;b12;b13;b6(2+);b11(2+) 3216.2;2969.5;933.9;4933.9;1023.5;237.5;1945.2;807.8;692;2527.7;263.2;1083.3;1198.9;1175.8;2021.8;4019.6;6005.1;4822.1;2734.2;2409.4;564.3;114.9;79.1;35.1;877.7;7026.8 0.02054953;0.1131969;0.121974;0.1642609;0.1170851;0.200153;-0.05356121;0.05240029;-0.03121108;0.08570305;0.007215286;0.3480695;0.4578614;0.1880653;-0.008183931;-0.0902199;-0.187396;-0.08009677;0.02233606;0.01178804;-0.006467078;0.2259556;0.3121832;-0.3824228;0.4463873;0.12864 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_STNKGTAYTFFTPGNLK_ 0 0 Q92841-1;Q92841;Q92841-2;C9JMU5;Q92841-3;H3BLZ8;Q59F66 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 5 1 616.31598 1845.9261 -0.43424 -0.78159158 132.86 6.0811E-08 93.181 76.999 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y12;y1-NH3;y5-NH3;y6-H2O;y7-H2O;y7-NH3;y8-NH3;y9-H2O;y6(2+);y8(2+);y11(2+);a2;b2;b2-H2O;b4;b7;b7-H2O;b8;b9;b9-H2O;b9-NH3;b10;b10-H2O;b10-NH3;b6(2+);b9(2+);b12(2+) 3801.3;2469.8;5395.3;54675.1;22446.9;20800.4;8518.7;2664.2;231.9;2152.9;4703.1;3918.3;5591.8;3396.6;9068;859.7;1790.2;4908.4;9499;1617.4;3426.3;1631.3;5395.3;11791.7;3729.7;6010.6;11428.6;9068;6701.4;4737.8;1570.2;1244.4;2487.3;4908.4;11791.7 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74.77552;19.24377;9.799734 SYLSGGAGAAGGGGADPGNK;HTGKNPCKFTECGK;GCVGCATEERLFHK _SYLSGGAGAAGGGGADPGNK_;_HTGKNPCKFTECGK_;_GCVGCATEERLFHK_ 22159 624 7513 7617 33587 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group13_B 56170 47937 SYNCCSGNFSSR 12 0 Acetyl (Protein N-term) _(ac)SYNCCSGNFSSR_ 1 0 Q52LG2 KRTAP13-2 Keratin-associated protein 13-2 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 740.78263 1479.5507 -0.55452 -0.04355971 82.382 0.0036601 62.162 57.967 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y3;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y7-NH3;y8-NH3;y9-H2O;y9-NH3;y10-NH3;y8(2+);y9(2+);b3;b4;b10;b6(2+);b10(2+) 38.9;1094.8;416.5;124.4;681.5;1067.5;1637.8;922.5;294.8;200.8;250.6;108;108.6;250.4;206.4;197.8;179.2;280.2;58.1;179.2;124.4 -0.06900559;0.0161694;0.1258431;0.00937722;-0.06187146;0.1110261;0.1875727;0.2775471;0.2147617;0.3405805;0.1723762;0.3254541;-0.03965141;0.07114713;-0.359271;-0.05094759;-0.04678583;-0.199945;0.1150895;0.425452;-0.07419299 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34864 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 52403 44771 THTGERPFACDWQGCDKK 18 2 Unmodified _THTGERPFACDWQGCDKK_ 0 0 Q9BXK1 KLF16 Krueppel-like factor 16 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 1 548.99547 2191.9528 -0.51416 456.27742 77.27 0.003755 47.916 23.925 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y8;y10;y1-NH3;y6-H2O;y6-NH3;y14(2+);y15(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b11;b9(2+);b11(2+);b12(2+) 74.1;292.9;177.1;1025.9;211;71.9;13;788.8;251.8;312.8;119.6;108.4;181.9;782.8;121.6;338.2;46.7;199.1;377.5;744.8 0.09052633;0.09088486;-0.1258159;0.07100184;0.00287036;0.1818803;0.0787438;-0.03950787;0.04681007;-0.1223726;0.05484561;-0.03885368;-0.000264738;0.03742027;0.1371766;0.08934069;0.2777033;0.06746016;-0.1512723;-0.3744332 615.7321;330.35;-228.5936;116.9301;3.903433;175.5144;62.12819;-303.613;65.2598;-170.3307;61.01815;-41.89323;-1.253974;156.5201;620.8039;262.7109;218.2748;135.1423;-237.5037;-512.7894 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42.68203;25.97791;23.59593 THTGERPYKCPECGK;IHTGEKPYQCNQCGK;THTGERPYPCKECGK _THTGERPYKCPECGK_;_IHTGEKPYQCNQCGK_;_THTGERPYPCKECGK_ 23053 1586 7756 7862 34869 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group15_B 38501 33022 THTITIESEGK 11 0 Unmodified _THTITIESEGK_ 0 0 Q9P2D1 CHD7 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7 3 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 405.8787 1214.6143 -0.38 -1.9847249 55.258 0.0034521 78.513 46.755 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y1-NH3;y2-NH3;y5-H2O;y5-NH3;y6-H2O;a2;b2;b2-H2O;b4;b4-H2O;b5;b5-H2O;b7;b9 473.2;736.7;708.2;472.7;102.4;308.4;364.9;679.4;409;162.1;77.3;486.8;22.3;303.4;259.4;177.2;575.3;89.2;24.2 0.06733298;0.005117503;0.0604519;-0.07450628;0.001562102;0.01749897;0.01161894;0.03156722;0.1597479;0.2331239;0.2173409;-0.0644474;0.07528698;-0.0930443;0.09799013;0.2057023;0.1132895;-0.07144924;0.1494125 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methyltransferase NOP2 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 457.50505 1825.9911 -0.072322 -1.4345745 41.507 0.020707 40.211 16.127 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y5-NH3;y6(2+);y7(2+);y10(2+);y11(2+);b2;b2-H2O;b11(2+) 120.4;788;280.7;31.2;76;44.4;20.1;40.1;137.3;224.6;409.3;72;126.3;220.2;117.6;68.7 -0.03281173;-0.089486;-0.01000395;-0.1855281;0.2247631;0.1321993;-0.2629499;0.1869086;0.07434783;-0.2019188;-0.1613239;0.2974099;-0.280841;0.09734288;0.008470085;-0.06451527 -187.3332;-202.2892;-17.54014;-262.2008;266.2348;137.8012;-241.7178;157.8032;134.3875;-569.7436;-381.4781;501.9404;-427.3646;423.2001;39.93543;-102.5023 175.151763916016;442.366729736328;570.345825195313;707.580261230469;844.228881835938;959.348388671875;1087.83850097656;1184.44140625;553.234924316406;354.402923583984;422.891784667969;592.520385742188;657.146118164063;230.016189575195;212.094497680664;629.403076171875 16 0.2101503 0.1355932 None Unknown 40.21099;24.08383;7.783285 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Unknown 53.0082;34.76828;23.48881 TQDPSSPGTTPPQAR;RQMLSPYCDTLR;NMGPMGPGGLANLPR _TQDPSSPGTTPPQAR_;_RQMLSPYCDTLR_;_(ac)NMGPM(ox)GPGGLANLPR_ 23426 1069 7906 8016 35498 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 37987 32362 TQDPSSPGTTPPQAR 15 0 Unmodified _TQDPSSPGTTPPQAR_ 0 0 Q13112 CHAF1B Chromatin assembly factor 1 subunit B 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 2 0 770.37353 1538.7325 -0.88652 -0.81356825 55.702 0.00045801 71.279 48.888 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y5;y9;y10;y12;y13;y10-NH3;y12-NH3;y12(2+);y13(2+);b2;b2-H2O;b2-NH3;b3;b3-H2O;b5;b10;b11(2+);b13(2+) 33.5;283.8;231.3;122.7;172.6;141.5;59.7;85.3;115.5;118.5;93.7;52.4;64.7;195.9;46.2;144.2;56.5;218.1;93.9 -0.01016769;0.1353567;-0.04381363;0.0224555;0.1419768;0.1947987;0.35284;0.1823222;-0.06465561;-0.1457275;0.05010167;0.1235671;-0.2838052;0.08081362;0.2818273;0.04020915;0.1742562;0.02031597;-0.4838888 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20 2 Oxidation (M) _TSPEM(ox)DIQNPDDGARKPIPR_ TSPEM(1)DIQNPDDGARKPIPR TSPEM(40.6)DIQNPDDGARKPIPR 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 6 3 564.02866 2252.0855 -0.30389 1336.428 98.492 0.040084 40.602 32.784 40.602 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y4;y7;y1-NH3;y8(2+);y9(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);y14(2+);a2;b2;b2-H2O;b6;b6-H2O;b7;b7-H2O;b8;b8-H2O;b18;b10(2+) 17;222.4;113.2;46.3;545.9;583.6;537.9;2269.6;936.5;315;158.5;763.9;531.9;14.6;253.1;273.5;145.3;275.5;84.9;269.6;15.4;3405.1 0.195948;-0.3902782;-0.001786367;0.1159932;0.06090123;0.2212233;-0.1228186;-0.1375743;-0.2754734;-0.4214776;0.001352696;0.01690393;0.07364717;-0.304166;0.005241641;-0.2355477;-0.02104594;0.01312814;0.3253734;0.02025302;0.09024604;0.3981 1120.196;-808.5335;-2.132865;734.2436;136.0239;437.9988;-218.1754;-224.9873;-411.9934;-575.1521;1.714596;104.9444;389.6401;-1774.799;7.739717;-357.1774;-26.62864;16.99865;354.4133;22.49444;45.53653;704.7926 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45.08256;16.92441;11.65658 TSPEMDIQNPDDGARKPIPR;QDGPMPKPHSVSLNDTETRK;GKASIAEANSSLDDTEKMLEK _TSPEM(ox)DIQNPDDGARKPIPR_;_QDGPM(ox)PKPHSVSLNDTETRK_;_GKASIAEANSSLDDTEKM(ox)LEK_ 23688 919;920 7996 8106 35899 109 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_C 56524 47312 TSPEMDIQNPDDGARKPIPR 20 2 Oxidation (M) _TSPEM(ox)DIQNPDDGARKPIPR_ TSPEM(1)DIQNPDDGARKPIPR TSPEM(42.63)DIQNPDDGARKPIPR 0 1 P46013;F5H4V4;P46013-2 MKI67 Antigen KI-67 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 3 0 564.02866 2252.0855 -0.12826 -2.5974901 90.852 0.028172 42.633 25.392 42.633 1 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y14;y8(2+);y10(2+);y11(2+);y12(2+);y13(2+);a2;b2;b2-H2O;b4;b6;b7;b8;b8-NH3;b11 137.9;79.5;267.4;562.7;930;613.1;349.5;389.6;316.2;134;141;265;126.2;74.4;255.9;30 0.01626053;-0.242242;-0.1762814;-0.4083411;-0.1992809;-0.08748514;0.0261542;0.06336695;0.00988069;-0.005444739;-0.1737998;0.04375482;0.1122548;0.2018382;-0.01843648;0.05024159 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60751 50755 VAEPGAEATSSTGEESGSEHPPAVPMHNK 29 0 Unmodified _VAEPGAEATSSTGEESGSEHPPAVPMHNK_ 0 0 Q14684-2;Q14684 RRP1B Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B 4 HCD ITMS MULTI-MSMS 4 1 726.58326 2902.3039 0.0072156 344.05942 98.786 3.0075E-12 59.55 56.433 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y3;y5;y8;y9;y13;y1-NH3;y2-NH3;y11(2+);y13(2+);y14(2+);y15(2+);y16(2+);y17(2+);y18(2+);y19(2+);y20(2+);y21(2+);y25(2+);y27(2+);a2;b2;b3;b5;b6;b7;b14;b7(2+);b9(2+);b23(2+) 70.6;629.7;305.6;1579.6;327.6;811.9;29.5;141.5;134;412.6;597.3;870.7;710.3;477.8;1938.4;401.1;512.9;837.6;204.9;60.2;57.5;1344;3020.6;1150.5;295.6;539.8;257.3;106.4;190.5;439.8;204.9 -0.01359964;-0.06387287;0.1132641;0.1150819;0.4884613;0.1272848;0.1463566;-0.04713726;-0.05923301;0.4327609;-0.01198964;-0.1536903;0.2535315;0.2862417;0.03732999;-0.0668215;0.1565902;0.1380585;0.07596021;-0.398965;-0.4217211;-0.004302834;0.1269948;0.001893849;0.004283045;0.0458524;0.2085017;0.1441348;-0.1940519;0.02644486;0.06103004 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Unknown 54.09011;22.32095;19.67751 VEALPEQVAPESR;EVKAREISDSYK;KKLDNAGSSFTSK _VEALPEQVAPESR_;_EVKAREISDSYK_;_(ac)KKLDNAGSSFTSK_ 24578 1417 8278 8391 37188 20150910_Q1_SA_NiHu_Masterprac_group10_B 67576 57119 VEALPEQVAPESR 13 0 Unmodified _VEALPEQVAPESR_ 0 0 Q96RE7 NACC1 Nucleus accumbens-associated protein 1 2 HCD ITMS MULTI-MSMS 1 0 712.87263 1423.7307 0.23165 -1.307094 103.69 0.0016824 86.756 55.081 NaN NaN 1 0 0 0 -1 0 0 0 0 y1;y2;y4;y5;y6;y7;y8;y9;y10;y11;y1-NH3;y2-H2O;y2-NH3;y5-NH3;y8-H2O;y8-NH3;y9-NH3;y10-H2O;y9(2+);a2;b2;b2-H2O;b3;b3-H2O;b4;b8 35.9;259.3;529.6;392.1;344.9;259.7;339;4451.5;83.6;505.3;89.7;256;20.6;187.2;68.7;73;171.5;59.4;824.3;500.1;1913.7;50.7;3494.3;122.1;234.7;76.6 0.2647652;0.0820719;-0.06512486;0.1159709;0.06109376;0.2584652;0.08371212;0.1210341;0.2353715;0.1416259;-0.1380504;0.01860499;0.06808078;-0.04241418;0.07973923;-0.06399177;-0.04876453;-0.4492655;0.01721924;0.08395541;0.1011784;-0.06314912;0.0304583;-0.123539;0.06514484;0.2425103 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